基因合成法是在體外人為地利用酶學方法或化學方法合成目的基因。可分為兩類。①酶學法合成:以RNA為模板,通過逆轉錄合成cDNA。這是獲得真核結構基因的最主要、最常用的方法。由於分離RNA單一組分很困難,所以合成的cDNA分子往往是混雜的,需要用基因分離法分離;這種方法不易得到全長的互補DNA分子,所以還要進一步剪下、拼接。②化學合成法:用化學法或化學法結合酶學法來合成目的基因。自1979年以來,國外已有近百種化學合成基因,包括胰島素基因,干擾素基因,以及乳糖操縱基因,啟動子調節序列等。使用這一方法首先要已知所要合成的基因的序列。