owl(蛋白質序列資料庫)

OWL是一個非冗餘的蛋白質序列資料庫，是由Leeds大學和Warrington的Daresbury實驗室合作開發的（Bleasby等，1994）。OWL資料庫由四個主要的一級序列資料庫複合而成，即SWISS-PROT、PIR、GenBank（由其編碼序列翻譯而成的胺基酸序列）和NRL-3D。在構建OWL資料庫的過程中，考慮到每個資料庫所包含序列信息的情況，賦予它們不同的優先權，SWISS-PROT資料庫的優先權最高。在對數據的處理上，不僅刪除與某一序列完全相同的序列條目，也剔除與某一序列相差個別胺基酸殘基的序列條目。因此，OWL資料庫是一個具有較小冗餘度的蛋白質序列資料庫。儘管如此，與NRDB相同，OWL資料庫也會有一些錯誤，即在該資料庫中仍然包括來自一次資料庫的錯誤序列，例如由GenBank中錯誤序列翻譯而得的錯誤的胺基酸序列。此外，OWL資料庫更新較慢。英國的EMBnet國家節點上提供有針對於OWL的BLAST搜尋服務。