2006年，在省委、省政府以及市委的正確領導下，全市堅持以科學發展觀為指導，開拓創新，紮實工作，努力克服經濟社會發展中的各種矛盾和困難，順利完成了市十三屆人大四次會議確定的各項目標任務，實現了“十一五”發展的良好開局。
經濟成長保持穩定與協調。預計實現地區生產總值2774億元，可比價比上年增長15.1%，完成財政收入603.9億元，同口徑增長18.4%，其中地方財政一般預算收入246.4億元，增長16.8%。高新技術產業繼續保持較快增長，實現銷售收入1500億元，比上年增長13%。成功舉辦第二屆中國（南京）國際軟體產品博覽會，榮獲“國家軟體出口創新基地”、“中國服務外包基地城市”稱號。以南京軟體園、江蘇軟體園為代表的“兩園多基地”建設進一步加快，實現軟體產業銷售收入258億元，比上年增長55.4%。工業經濟持續穩定增長，工業增加值比上年增長16%。第三產業對全市經濟成長貢獻率提高到50.8%。消費需求快速擴張，社會消費品零售總額達1166.85億元，比上年增長16.1%。52家企業通過清潔生產審核，實施61個資源綜合利用項目和67個節能示範項目建設。民營經濟繼續保持快速發展勢頭，實現增加值965.35億元，比上年增長16.5%，對全市經濟成長貢獻率達到39.9%。
新農村建設開局良好。實施《關於統籌城鄉發展，加快社會主義新農村建設的意見》，著力推進郊縣工業化、農業產業化、農村城鎮化以及農民市民化。抓緊重大項目落實，重點工業園區及其配套協作區的規劃和建設水平不斷提高。拓寬農民增收渠道，農民人均純收入達7070元，比上年增長13.5%。全面推進“萬村千鄉”市場工程，農村現代流通網路初步形成。大力發展都市型現代農業，著力打造特色農產品和旅遊農業品牌。發揮資源優勢，高效農業取得明顯進展。發展農民專業合作經濟組織，農業產業化程度不斷提高。完成全市鎮村布局規劃修改，“三城九鎮”規劃覆蓋面進一步擴大。深入推進鎮村環境整治，開工建設“一區兩縣”3座無害化垃圾處置場，建成40個垃圾中轉站。完成河塘、河道清淤2200萬方。農村“新八件實事”紮實推進，對經濟欠發達鎮幫促工作成效顯著。
開放型經濟取得新成效。發展環境進一步最佳化，投資環境位居全國“百佳”城市第五位。創新招商引資方式和手段，成功舉辦重洽會、金洽會等經貿盛會。全市實際利用外資17.02億美元，增長20.1%。地方外貿出口121.1億美元，增長27.6%。引進千萬美元大項目211個，實際到資13.5億美元。提升利用外資質量，美國百思買、邦基和日本住友等世界500強企業在寧落戶。軟體、物流、信息、會展等現代服務業利用外資的比例大幅度提升。載體建設進一步加快，龍潭港保稅物流中心封關運行，棲霞、雨花、江寧濱江開發區和白下高新技術產業園新增為省級開發區。貿易結構不斷最佳化，高新技術產品與機電產品的出口比重持續增長。外經工作發展較快，對外承包工程指標躍居全省第一。
人居環境進一步改善。啟動新一輪城市總體規劃修編工作，初步完成“都市發展區控制性詳細規劃”。新區配套設施不斷完善，河西中部地區建設和北部整合取得新進展，仙林大學城科技園路網基本形成，江寧新市區東進南延框架進一步拉開。民國優秀建築保護、秦淮河環境綜合整治二期、中山陵環境綜合整治、明城牆風光帶建設成效顯著。完成老城房屋整治900幢，老住宅小區出新45個。寧蚌、寧淮高速公路建成通車，對外交通“高速一環”框架已經形成。“高速二環”東南段順利啟動，寧杭二期南京段全線施工，寧常高速南京段、緯七路過江隧道等項目進展順利。繼續完善城市路網布局，快速內環東線二期工程基本完成，捷運二號線一期工程加快推進，開工建設捷運一號線南延工程。城市電網建設步伐加快，新建擴建110千伏及以上輸變電項目34個。“綠色南京”建設取得新進展，新增森林10.7萬畝，全市森林覆蓋率達22%，新增綠地900萬平方米，建成區綠化覆蓋率達45.5%。加快推進沿江地區環境綜合整治，城市集中式飲用水源地保護水平全國領先。全面啟動南河、金川河等水環境治理。全市空氣優秀及良好級別天數達305天。完成“拆違”520萬平方米、“拆破”30萬平方米。啟動31個“城中村”改造。
社會事業取得長足進步。全市義務教育階段學生全部免收雜費，城鄉教育均衡發展水平和教學質量不斷提高。啟動新型農村衛生服務體系建設，郊區縣醫院和農村社區衛生服務中心（站）建設進展順利。在二級以下醫療機構全面推行藥房託管，積極開展社區首診制及雙向轉診制試點。惠民醫療體系進一步完善，民眾“看病難、看病貴”現象有所緩解。人口與計畫生育“世代服務”品牌影響廣泛。推進食品藥品監管體制改革，生產和流通秩序進一步規範。成功舉辦第二屆歷史文化名城博覽會、阿拉伯藝術節南京分會等重大文化活動。南京雲錦、金陵刻經、秦淮燈會和金箔鍛制等成為國家首批非物質文化遺產。公布第三批159家市級文物保護單位。實施《關於加快文化產業發展若干經濟政策的意見》，推動文化產業快速發展。出版物市場管理進一步加強。廣泛開展全民健身運動，體育事業發展水平不斷提高，在第十六屆省運會上獲得金牌265枚，列全省第一。以優撫安置為重點的“雙擁”工作深入開展。民族、宗教、人防、僑務、婦女、兒童、老齡、慈善、殘疾人、紅十字等各項事業取得新的進步。
