趙書紅

趙書紅，女、教授，第八屆中國青年女科學家獎獲得者，第十二屆中國青年科技獎獲得者、國家傑出青年科學基金獲得者、華中農業大學動科動醫學院副院長。榮獲2018年度國家技術發明獎二等獎

基本介紹

• 中文名：趙書紅
• 國籍：中國
• 民族：漢族
• 出生地：河北
• 職業：教授
• 畢業院校：內蒙古民族大學、吉林農業大學 
• 主要成就：國家傑出青年科學基金獲得者榮獲2018年度國家技術發明獎二等獎
• 性別：女

人物經歷

學習經歷

1985.9-1989.6內蒙古民族大學學習並獲學士學位

華中農業大學趙書紅

1989.9-1992.6吉林農業大學動物遺傳育種專業學習並獲碩士學位

1995.9-1998.6東北農業大學動物科技學院學習（為華中農業大學定向培養的在職博士研究生），獲動物遺傳育種專業博士學位

教學工作

1992年8月，趙書紅碩士畢業來到華中農業大學工作。

1992.7-1995.7華中農業大學畜牧獸醫系助教

1995.9-1998.11華中農業大學講師

1998.12-2003.10 華中農業大學畜牧獸醫學院副教授,動物遺傳育種部副主任,分子生物學與育種實驗室副主任

2003.11--華中農業大學動物科技學院教授

動物遺傳育種系主任(2005.8--)

留學經歷

2000.7-2001.7美國依阿華州立大學動物科學系分子遺傳組訪問學者

2001.11-2005.5 美國依阿華州立大學動物科學系分子遺傳組合作研究

主要兼職：

農業動物遺傳育種與繁殖教育部重點實驗室主任、學術委員會委員

中國畜牧獸醫學會動物遺傳育種學分會副秘書長

中國畜牧獸醫學會動物遺傳標記分會理事

湖北省外專局引智項目評審委員會專家組成員

國際動植物基因組大會組委會主席團成員(2008-2010) (Animals: Hans Cheng, Joan Lunney, James Reecy, Max Rothschild, Shu-Hong Zhao)

國際動物遺傳研究會（International Society of Animal Genetics）會員

美國動物科學學會（American Society of Animal Science）會員

《Research Journal of Animal Sciences》、《豬業科學》雜誌編委，《BMC Genomics》、《BBA-Gene Regulatory Mechanisms》、《Animal Genetics》、《Biochemical Genetics》、《中國科學》、《遺傳學報》、《畜牧獸醫學報》等雜誌審稿人

科研工作

1989-1992年：在吉林農業大學動物科技系從事松毛蟲赤眼蜂的選擇雜交試驗與計算機模擬研究及蛋白質多態性檢測並獲得碩士學位。

1992-1995年：華中農業大學工作，作為主要負責人之一組建了動物分子生物學與育種實驗室。作為2項國家自然科學基金的主要完成人，承擔了血樣DNA提取以及豬的GH、PRKAR1A等基因的PCR-RFLP與PCR-SSCP檢測工作。

1995-1998年：作為霍英東青年教師基金項目的主要完成人，在國內外首次在豬中建立單精子分型遺傳作圖技術並利用我室在江蘇常熟畜牧良種場合作建立的參考家系表型與DNA信息完成了豬12號染色體上幾個微衛星座位的高精度遺傳圖的構建，提高了遺傳圖精度，獲得博士學位。

1998-2006年：先後主持承擔了20餘項科研項目，其中國家自然科學基金5項（批准號為39770539、30100131、30571328、30671138、U0631005）：4個國家基金面上項目和1項重點項目，1項“十一五”“863”課題，2項國際科學基金（International Foundation for Science, IFS，課題編號：B2580/1,B2580/2）、1項國際原子能機構項目。作為主要學術骨幹參與承擔了“973”項目“農業動物遺傳資源的分子標記評估及其優質基因的分離和利用研究”（2001-2005）、“重要複雜性狀的比較基因組”（2006-2008）的研究工作。

2005年牽頭申請湖北省自然科學基金創新群體並獲得資助，牽頭申請了農業動物遺傳育種與繁殖教育部重點實驗室，並於2005年12月獲得教育部批准。2005年入選教育部新世紀優秀人才支持計畫,2006年入選“新世紀百千萬人才工程”國家級人選。

2009年至2011年，應邀擔任國際動植物基因組大會動物基因組組委會主席團成員。

與美國依阿華州立大學動物分子遺傳組Christopher K Tuggle教授合作製備了豬尼龍膜cDNA晶片用於肌肉發育研究；受Affymetrix公司委託檢測了其設計的豬基因晶片並套用於豬胚胎髮育基因表達差異研究；參與了美國豬基因組計畫協調人帶領的豬寡核苷酸晶片開發與利用；與美國動物基因組資料庫負責人Zhiliang Hu博士進行了豬基因組生物信息學方面的合作，將1300個在沙門氏菌感染豬肺臟差異表達的基因定位在了豬的染色體上，部分基因與免疫性狀定位的QTL區域吻合，可作為位置候選基因進一步研究；與韓國忠北大學學者合作進行了豬肌肉生長相關基因的研究；通過這些工作建立了豬高通量基因表達研究技術平台，促進了豬功能基因組學研究水平的提高。與依阿華州立大學Tuggle教授（Professor, Molecular genetics; Chair, Bioinformatics & Computional Biology）實驗室、美國豬基因組計畫協調人Rothschild實驗室建立了長期穩定的合作關係，合作申請了國家自然科學基金，先後派去3名教師/博士 進行合作科研，在試驗豬群體共享、基因功能分析、生物信息學、基因晶片套用等方面均取得了一系列研究成果，合作申請專利一項，合作發表文章10篇。

主持了兩項國際科學基金（IFS）項目，1項國際核子彈機構項目,最早開展了將微衛星標記用於中國山羊遺傳多樣性評估研究，與國際原子能機構動物生產處、聯合國糧農組織國際家畜研究所、芬蘭農業科學院等單位建立了良好合作關係，先後派兩名年輕教師至肯亞國際家畜研究所進行短期科研，一名博士到芬蘭農業科學院做博士後研究。

2018年，趙書紅教授領銜的研究團隊歷時近14年，完成了“豬整合組學基因挖掘技術體系建立及其育種套用”科技成果，榮獲2018年度國家技術發明獎二等獎。該成果突破了豬基因組學研究方法和工具數量不足、效率不高的局限，構建了首個豬整合組學資料庫，涵蓋基因組、轉錄組、表觀組、表型組等多組學信息；開發了GWAS新算法等10個方法和工具；結合機器學習開發出基於“多組學聯動評分”的整合組學基因挖掘技術體系，發掘出一批新分子育種標記；制定出1套適用於優質豬母本選育的綜合選擇指數，培育出1個優質豬母本新品系，篩選出2個三元雜優配套組合；選育了“硒都黑”豬新品種，獲批開展中間試驗，恩施黑豬肉獲國家地理標誌保護產品證書。該項目在豬多組學分析方法與工具創新、豬整合組學基因挖掘技術體系創建等方面取得重要進展，豐富了豬種質創新方法，有力地推動了豬分子育種技術的發展。

教學工作

承擔的教學任務：主講本科生的《家畜育種學》(每學年授課學時數為50)、《分子生物學》(每學年授課學時數為40)，研究生《分子生物學》（48學時）、曾講授函授生的《家畜育種學》及一部分研究生的《動物育種專論》(40學時)、《分子生物學實驗操作技術》，曾部分講授本科生《豬的遺傳改良》、《生物統計附試驗設計》、《專業英語》等課程。在教學中態度認真，刻苦鑽研教學內容，講課中概念清楚，內容充實，能反映本學科最新進展，注意教書育人，受到學生好評，曾獲全校青年教師講課競賽優勝獎。 在教材編寫方面：（1） 參編面向21世紀教材《普通遺傳學》（高等教育出版社,2001,2萬字），（2） 參編面向21世紀教材《分子遺傳學》（中國農業出版社,2001,8萬字），（3） 參編“十五”規劃教材《家畜育種學》（中國農業出版社，3萬字，2007），（4）參編面向21世紀教材《動物遺傳學》（高等教育出版社，出版中），（5）主編面向21世紀教材《分子生物學》（高等教育出版社，編寫中）。在教學改革方面，主持動物遺傳育種教學團隊項目，主持並完成了校教學項目《家畜育種學CAI課件製作》。獲華中農業大學1999、2006年度教學比賽優勝獎及優秀學生論文指導獎。指導大學生兩次獲得湖北省大學生優秀畢業論文一等獎。指導的大學生SRF項目“豬microRNA分離研究”獲得湖北省大學生課外科技作品特等獎，一篇論文“豬miR-206前體的克隆、表達及生物信息學分析”發表在畜牧獸醫學報接受，另有一篇發表在SCI收錄的亞澳動物科學雜誌。

人物成就

科研項目

編號	課題名稱	承擔; 任務	起止時間	批準; 經費	類別	完成情況
U0631005	豬免疫應答相關基因的eQTL 作圖、功能鑑定及用於優質; 豬培育的若干關鍵問題研究	主持	2007-2010	130	國家自然科學基金廣東聯合基金	正在進行
30671138	豬骨骼肌miRNA的分離及其介導的基因表達調控研究	主持	2007-2009	26	國家自然科學基金	正在進行
30571328	用新建立的寡聚核苷酸技術分離胎盤中的新印記基因	主持	2006-2008	28	國家自然科學基金	正在進行
30100131	用cDNA宏陣列技術發現豬某些產肉性狀的候選基因	主持	2002-2004	19	國家自然科學基金	完成
39770539	中外豬種基因組差異消減雜交分離、鑑定與遺傳規律研究	主持	1998-2000	17	國家自然科學基金	完成
39960050	不同地理分布藏山羊微衛星與MHC變異及適應性研究	合作方主持人	2000-2002	12	國家自然科學基金地區基金	完成
2006CB102105	重要複雜性狀的比較基因組	骨幹	2006-2008	24	973	正在進行
2006AA10Z195	豬抗病基因詞典的建立、重要基因功能分析及套用於育種的若干關鍵問題研究	主持	2006-2010	70	863	正在進行
NCET-05- 0669	長白豬與二花臉豬妊娠後期胎盤中基因表達模式的比較研究	主持	2005-2006	50	教育部新世紀優秀人才資助支持計畫	正在進行
2006ABC008	豬基因組研究與遺傳改良	主持	2006-2008	40	湖北省自然科學基金創新群體項目	正在進行
2007-620	畜禽遺傳改良及健康養殖技術研究與套用	主持	2007-2010	40	湖北省農業科技創新中心	正在進行
CRP D.3.10.25	Gene-based Technologies in Livestock Breeding: Characterization of Small Ruminant Genetic Resources in Asia	共同主持	2004-2007	2.0萬$	聯合國原子能機構協調研究項目	正在進行
B2580/2	Study of microsatellite andMHC variation of Tibetan cashmere goats	主持	2001-2003	1.2萬$	國際科學基金（IFS）	完成
B2580/1	Detectionof microsatellite; polymorphisms and estimation of; genetic distance in five Chinese; indigenous goat breeds	主持	1997-2000	1.2萬$	國際科學基金（IFS）	完成
	豬的雜種優勢的分子生物學基礎分子標記輔助預測研究	共同主持人	2000-2003	36	教育部高等學校骨幹教師基金	完成
QLRT	Characterisation of genetic variation in the pig breeds of China and Europe to facilitate the maintenance and exploitation of biodiversity	參加	2001-2005	50	歐共體第六框架計畫	完成
G2000016103	中國地方豬優質基因的發掘和利用	參加	2000-2005	140	973　課題	完成
2004AA222241	豬肌肉與脂眆沉積相關基因的分離、鑑定和套用	主要參加	2003-06	75	863計畫	完成
2001AA222241	豬肌肉與脂肪沉積相關基因的分離、鑑定及套用	參加	2001-2003	45	863計畫	完成
	肉質嫩美雜優豬“鄂青一號”的選育和推廣	參加人	2001-02	20	湖北省荊楚青年科技創新基金	完成
	中外豬種肌肉細胞差異表達基因的篩選、鑑定及效應研究	主要參加人	1998-2000	15	“863”青年科學基金	完成

學術會議

（1）2007年10月主持了在華中農業大學舉行的聯合國原子能機構的亞洲小反芻動物的項目協調會。

（2）2007年10月主持了在華中農業大學舉行的全國動物遺傳育種學術討論會。

（3）2006年9月作為中國方面項目負責人參加在韓國舉行的聯合國原子能機構組織的亞洲小反芻動物項目協調會。

（4）2006年9月參加在韓國舉行的亞洲動物科學會議，韓國基因組會議，並在韓國基因組會議上做了不同豬種子宮內膜的轉錄譜差異的發言。

（5）2005年9 月被邀請出席在哈爾濱召開的黑龍江國際生物技術峰會（International Agro-Biotechnology Conference, Heilongjiang, China ），並在大會上作題為“Transcriptional profiling in the pig using oligonucleotide microarrays”的特邀報告。

（6）2005年8月出席在哈爾濱召開的第十三次全國動物遺傳育種學術討論會，並在大會上作題為“基因晶片技術在豬功能基因組學研究中的套用”的大會報告。

（7）2005年1月出席在美國聖地亞哥召開的第十三次國際動植物基因組會議（Plant & Animal Genome XIII Conference），並在分會上作題為“Transcriptional profiling in normal tissues and Salmonella choleraesuis infected lung using the porcine 70mer oligo array”的報告。

（8）2004年1月出席在美國聖地亞哥召開的第十二次國際動植物基因組會議（Plant & Animal Genome XII Conference），並作牆報展示。

（9）2003年1月出席在美國聖地亞哥召開的第十一次國際動植物基因組會議（Plant & Animal Genome XI Conference），並作牆報展示。

學術獲獎

豬重要基因資源和分子標記的發掘、鑑定及功能研究，湖北省自然科學二等獎，2006，排名第二。

豬重要基因資源及比較轉錄組研究,教育部高等學校科學技術獎（自然科學二等獎）,2006, 排名第二。

微衛星DNA的克隆、測序、定位及與經濟性狀的關係和在豬遺傳多樣性中的套用，獲湖北省自然科學三等獎，2002，(李奎、趙書紅、劉榜、余梅、樊斌)。

指導的碩士論文“豬FBXO32基因的分離、定位、多態性檢測及與經濟的關聯分析”獲湖北省優秀碩士論文獎。

主要作品

專利情況

（1）獲得國家發明專利授權3項：

1）適用於豬品種分類的豬微衛星DNA標記，專利授權號：ZL011064773，國際專利分類號：C12N15/12， 2004。完成人: 李奎、彭中鎮、龔炎長、趙書紅、劉榜、余梅、熊統安

2）豬背膘厚PSME3基因及其製備方法, 專利授權號：ZL 03156242.6，2006。完成人： 李奎、余梅、劉榜、熊統安、趙書紅、潘佩文、王彥芳、朱猛進、樊斌

3）豬斷奶重PSME1基因及其製備方法, 專利授權號：ZL03156241.8，2006。完成人：李奎、王彥芳、余梅、劉榜、潘佩文、熊統安、樊斌、趙書紅

（2）申請發明專利5項（3項國內，1項國際，1項美國）：

1）豬肉質性狀基因FOXO3A的克隆及其套用,。 完成人：趙書紅、於晶、朱猛進、李奎、劉榜、樊斌、余梅、李長春

2）一種豬眼肌面積性狀相關蛋白及其編碼基因與套用（CAV3基因），完成人：李奎、趙書紅

3）一種豬眼肌面積性狀相關蛋白及其編碼基因與套用（SDHD基因），完成人：李奎、趙書紅

4）一種檢測豬肉質性狀胴體性狀的方法（MNTF1基因），完成人：李奎、趙書紅

5）Sequence, polymorphisms, and marker test technology for disease resistance (NFKB1), Application no. 60660124 (美國)。完成人: Christopher K Tuggle, Zhao Shuhong (趙書紅)，Marnie Mellencamp，John Bastiaansen, Lucina Galina

發表論文

1) Ma Guojian, Huang Jing, Sun Nunu, Zhu Mengjin, Wu Zhenfang, Zhao Shuhong(通訊作者), Molecular characterization of porcine GBP1 and GBP2 genes. Molecular Immunology, 2008, doi:10.106/J.molimm (Eu ahead of print). IF = 4.768

2) Zhao SH, Recknor J, Lunney JK, Nettleton D, Kuhar D, Orley S, Tuggle CK. Validation of a first-generation long-oligonucleotide microarray for transcriptional profiling in the pig. Genomics. 2005, 86(5):618-25. IF =3.558

3) Ting-Hua Huang, Bin Fan, Max F. Rothschild, Zhi-Liang Hu, Kui Li, Shu-Hong Zhao(通訊作者), MiRFinder: An improved approach and software Implementation for genome-wide fast microRNA precursor scan, BMC bioinformatics, 2007 Sep 17;8(1):341. IF = 3.617

4) Zhengmao Zhu, Yong Li, Delin Mo, Kui Li and Shuhong Zhao（通訊作者）. Molecular characterization and expression analysis of the porcine caveolin-3 gene. Biochemical and Biophysical Research Communications，2006, 346: 7-13IF = 2.855

5) Shu-Hong Zhao, Daniel Kuhar, Joan K. Lunney, Harry Dawson, Catherine Guidry, Jolita J. Uthe, Shawn M. D. Bearson, Justin Recknor, Dan Nettleton, Christopher K. Tuggle. Gene expression profiling in Salmonella Choleraesuis infected porcine lung using a long oligonucleotide microarray. Mammalian Genome. 2006, 17: 777-89 IF = 2.279

6) Zhao SH, Simmons DG, Cross JC, Scheetz TE, Casavant TL, Soares MB, Tuggle CK, PLET1 (C11orf34), a highly expressed and processed novel gene in pig and mouse placenta, is transcribed but poorly spliced in human.Genomics. 2004, 84(1): 114-25. IF =3.558

7) Feng Z, Tang ZL, Li K, Liu B, Yu M, Zhao SH (通訊作者). Molecular characterization of the BTG2 and BTG3 genes in fetal muscle development of pigs. Gene. 2007 Nov 15;403(1-2):170-177. IF =2.721

8) Zhu Z M, Zhang J B, Li K, Zhao S H（通訊作者）. Cloning, mapping and association study with carcass traits of the porcine SDHD gene. Animal Genetics. 2005, 36, 191-195. IF =1.520

9) S.-H. Zhao, D. Nettleton, W. Liu, C. Fitzsimmons, C.W. Ernst,N. E. Raney, and C. K. Tuggle*，Complementary DNA macroarray analyses of differential gene expression in porcine fetal and postnatal muscle.Journal of Animal Science. 2003. 81:2179–2188 IF =1.983

10) Zhou QY, Huang JN, Xiong YZ, Zhao SH (通訊作者). Imprinting analyses of the porcine GATM and PEG10 genes in placentas on days 75 and 90 of gestation. Genes and Genetic Systems, 2007, 82:265-9.

11) Feng Y, Huang TH, Fan B, Zhao SH (通訊作者). Mapping of six miRNAs expressed in porcine skeletal muscle. Anim. Genet. 2008, 39:91-92

12) Qiu H,Zhao S, Yu M, Fan B, Liu B.Expression patterns and subcellular localization of porcine (Sus Scrofa) lectin, galactose-binding, soluble 1 gene. Acta Biochim Biophys Sin. 2008, 40(1):85-90.

13) Jing Yu, Quanyong Zhou, Mengjin Zhu, Changchun Li, Bang Liu, Bin Fan,Shu-Hong Zhao（通訊作者）. The Porcine FoxO1, FoxO3a and FoxO4 Genes: Cloning, Mapping, Expression and Association Analysis with Meat Production Traits. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, 2007, 20: 627-633

14) Feng Z, Zhou QY, Ma GJ, Li K, Zhao SH (通訊作者). Mapping of porcine BTG1, BTG4, TOB2, USP2 and PEG3 using somatic cell and radiation hybrid panels. Anim Genet. 2007 Oct;38 (5):536-7.

15) Zhu M，Zhao S (通訊作者). Candidate Gene Identification Approach: Progress and Challenges. Int J Biol Sci 2007; 3:420-427.

16) Chen-Chang XU, Quan-Yong ZHOU, Li-Jie SU, Chang-Chun LI, Shu-Hong ZHAO, Imprinting Analysis of the MEST Gene in 75 and 90 Day Placentas and Prenatal Porcine Tissues, Acta Biochimica et Biophysica Sinica, 2007, Aug;39(8):633-9.

17) Jing Huang, Zheng-Mao Zhu, Shu-Hong Zhao (通訊作者)SNP detection, Imprinting, and Expression analysis in prenatal skeletal muscle of the Porcine Succinate Dehydrogenase Complex, Subunit D (SDHD) Gene. Research Journal of Animal Science, 2007, 1: 102-106

18) Li X, Zhu Z, Mo D, Wang H, Yang S, Zhao S, Li K. Comparative molecular characterization of ADSS1 and ADSS2 genes in pig (Sus scrofa). Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 2007 Feb 1; [Epub ahead of print]

19) Tang Z, Li Y, Wan P, Li X, Zhao S,Liu B, Fan B, Zhu M, Yu M, Li K. LongSAGE analysis of skeletal muscle at three prenatal stages in Tongcheng and Landrace pigs. Genome Biology, 2007,8::R115

20) Uthe JJ, Royaee A, Lunney JK, Stabel TJ, Zhao SH, Tuggle CK, Bearson SM. Porcine differential gene expression in response to Salmonella enterica serovars Choleraesuis and Typhimurium. Molecular Immunology, 2007 Mar 2; [Epub ahead of print]

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22) H. F. Qiu, X. W. Xu, S. H. Zhao, B. Fan, M. Yerle and B. Liu. Somatic cell hybrid and RH mapping of the porcine LGALS1, ITGA7, ITGB1, LGALS3, NOL12, GGA1, SH3BP1 and PDXP genes. Animal Genetics, 2007. 38 (3): 315-316.

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