蛋白質結構分類資料庫

蛋白質結構分類(SCOP)資料庫詳細描述了已知的蛋白質結構之間的關係。

基本介紹

• 中文名：蛋白質結構分類資料庫
• 外文名：Protein structural classification
• 蛋白質結構：SCOP
• 描述：已知的蛋白質結構之間的關係

分類基於若干層次：家族，描述相近的進化關係；超家族，描述遠源的進化關係；摺疊子(fold)，描述空間幾何結構的關係；摺疊類，所有摺疊子被歸於全α、全β、α/β、α+β和多結構域等幾個大類。SCOP還提供一個非冗餘的ASTRAIL序列庫，這個庫通常被用來評估各種序列比對算法。此外，SCOP還提供一個PDB-ISL中介序列庫，通過與這個庫中序列的兩兩比對，可以找到與未知結構序列遠緣的已知結構序列。