結合模體(binding motif)是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。
基本介紹
- 中文名:結合模體
- 外文名:binding motif
- 所屬學科:生物物理學
- 公布時間:2018年

結合模體(binding motif)是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。
結合模體(binding motif)是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。定義生物大分子如DNA、RNA或蛋白質中參與特定結合功能的局部序列或結構模式。1出處《生物物...
DNA結合模體 DNA結合模體是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞 ,是指DNA結合蛋白中與DNA發生相互作用的區域所具有的特定的結構模式。定義 DNA結合蛋白中與DNA發生相互作用的區域所具有的特定的結構模式。如鋅指結構、亮氨酸拉鏈、螺旋-轉角-螺旋、螺旋-環-螺旋等。出處 《生物化學與分子生物學名詞》
肽結合模體 肽結合模體是2007年公布的免疫學名詞。定義 MHC分子抗原肽結合槽容納抗原肽的錨著殘基序列。出處 《免疫學名詞》。
模體(motif)表示具有特定功能的或作為一個獨立結構域一部分的相鄰的二級結構的聚合體,它一般被稱為功能模體(functional motif)或結構模體(structural motif),相當於超二級結構(super-secondary structure)。模體和結構域一起組成了蛋白質的三級結構。結構模體作為結構域的組分,介於蛋白質二級結構和三級結構之間,由...
蛋白質模體指的是由2個或3個具有二級結構的肽段,在空間上相互接近,形成一個特殊的空間結構。它具有特徵性的胺基酸排列順序,並且同特定的功能相聯繫。蛋白質分子中由胺基酸殘基空間排布形成具有特定生物學功能的結構模式。鋅指結構由1個a螺旋和1對反向β摺疊組成,形似手指,具有結合鋅離子的功能。在多數鋅指的兩端...
果凍卷模體 果凍卷模體(jelly roll motif)是2018年公布的生物物理學名詞。定義 由兩個希臘鑰匙模體首尾相接,環繞形成的一種桶狀結構。通常含有8條β鏈,其中每一條β鏈都與旁邊的兩條β鏈以反平行β片層的形式結合在一起。出處 《生物物理學名詞》第二版。
共用模體 共用模體是2007年公布的免疫學名詞。定義 特定MHC分子抗原結合槽所接納的各種抗原肽,在關鍵性結合部位所擁有的相同或相似的胺基酸殘基。不同MHC分子所接納的抗原肽,其共用模體組成往往不同。出處 《免疫學名詞》。
採用變構模型的優點是它可以模擬外源信息影響轉錄因子與位點結合的動態過程並改進預測模型的性能。這一項目的難點和關鍵問題是外源信息的特徵提取和合理量化及其與保守模體信息的有效融合。該項目的成功實施,將為從理論上分析和理解轉錄因子識別目標序列的複雜機理提供新的思路,同時對變構理論的發展也將產生積極的影響。...
膽鹽輸出泵(BSEP)是ATP結合盒式轉運蛋白家族(family of ATP-binding cassette transporters,又叫ABC超家族)成員之一,分子量為160kDa,包含1321個胺基酸,具有12個假定的跨膜結構域和兩個ATP結合模體。該蛋白最早(1995年)是由豬肝的部分cDNA序列中鑑定出來的,由於與P-糖蛋白(P-gp)同源,故被命名為P-糖...
MLK3由一個SH3結構域,一個激酶結構域,雙重亮氨酸拉鏈,一個CDC42/Rac互動結合模體(CRIB)和一個富含脯氨酸的C-端組成。MLK3能通過亮氨酸拉鏈二聚體化從而激活其下游信號。SH3結構域能在亮氨酸拉鏈和CRIB結構之間結合一個脯氨酸殘基,通過這種形式,MLK3處於自身抑制的狀態。Rho家族成員Rac/CDC42能通過CRIB結合...
12.2 激活因子DNA結合模體的結構 317 鋅指結構 318 GAL4蛋白 319 細胞核受體 320 同源異型域 322 亮氨酸拉鏈和螺旋環螺旋域 323 12.3 激活因子各功能域的獨立性 325 12.4 激活因子的功能 326 TFIID的募集作用 326 聚合酶全酶的募集 327 12.5 激活因子問的相互作用 33l 二聚化作用 33l 遠程作用 331 轉...
通過翻譯後修飾也可以生成不同於母體分子結構的新肽分子模體,提高對靶位分子的識別能力與專一性,同時這些結構變化也常能提高芋螺毒素對蛋白酶的抗性。另一些翻譯後修飾的重要作用是改變其物理化學性質,如絲氨酸和蘇氨酸的羥基的O-糖基化作用可增加毒素分子的穩定性以及與膜轉運分子的親和性,苯丙氨酸的鹵化作用可以...
C4區包含一個底物結合區,是識別磷酸化底物所必需的。已發現了至少11種亞型,其結構有一定的保守性而又有所差別,導致其功能和調控的多樣性。新合成的PKC一般需要經歷活化莖環(Activation-loop,A-loop)、轉角模體(Turn motif,TM)以及疏水模體(hydrophobic motif,HM)的程式性磷酸化過程才能成熟,獲得進一步活化的功能。...
一種常出現在DNA結合蛋白中的一種結構基元。是由一個含有大約30個胺基酸的環和一個與環上的4個Cys或2個Cys和2個His配位的Zn2+構成,形成的結構像手指狀。鋅指 鋅指結構指的是在很多蛋白中存在的一類具有指狀結構的模體,這些具有鋅指結構的蛋白大多都是與基因表達的調控有關的功能蛋白。鋅指結構的共同特徵是通過...
前者主要是在Shc 的PTB/SH2 結構和ERa 的AF-1的參與下,通過磷酸化的Shc、IGFR與ERα結合,從而發揮生物效應。而後者中,PELP1/MNAR既定位於細胞核又定位於細胞膜,MNAR 和PELP1上有兩種不同的模體,可以分別ERa、c-Src結合形成復體,從而發揮作用。PI3K/Akt信號轉導途徑——PI3K與多種細胞因子轉導途徑相關,...
3、亮氨酸拉鏈(Leucineziipper)兩個蛋白之間相互作用共同建立一個轉錄複合體,在一系列轉錄因子中發現的一種模體涉及兩個相同和不同的部分構成。亮氨酸拉鏈是一種富含亮氨酸的蛋白鏈形成的二聚體模體。它本身形成二聚體同時還可以識到特殊的DNA序列。一個親水的α-螺旋在其表面的一側有疏水基因(包括亮氨酸),...
亮氨酸拉鏈(leucine zipper):出現在DNA結合蛋白質和其它蛋白質中的一種結構基元(motif),即模體。當來自同一個或不同多肽鏈的兩個兩用性的α-螺旋的疏水面(常常含有亮氨酸殘基)相互作用形成一個圈對圈的二聚體結構時就形成了亮氨酸拉鏈。簡介 蛋白質局部結構形式,即適於大分子之間相互結合的基元(motif)...
它們對通過基因信息的增幅基因的進行控制,能夠發揮基因模體上沒有的功能。更令人驚訝的是,泛素相關聯的基因群,占基因總數的2-3%。泛素,真的是難以說是一種普通的蛋白質。泛素的發現中做出貢獻的Hershko, Ciechanover, Varshavsky在2000年被授予Albert Lasker Award。ershko, Goldberg, Varshavsky等所發起的FASEB ...
2型鈉通道毒素相比,3型鈉通道毒素不僅二硫鍵的數量要多,同時其半胱氨酸在序列中的分布也有很大不同,例如,1型和2型鈉通道毒素的雙聯半胱氨酸(- Cys-Cys-)位於序列的C 端,而3型鈉通道毒素的- Cys- Cys- 位於序列的N 端,這也預示著3型鈉通道毒素可能採取了一種完全不同於1型及2型鈉通道毒素的結構模體...
英文motif的縮寫,也翻譯為“模序”,“模體”,DNA,蛋白質等生物大分子中的保守序列,在反式作用因子的結構中,基序一般指構成任何一種特徵序列的基本結構(既指具此功能的基本結構,也指編碼此結構的蛋白質/DNA序列),作為結構域中的亞單元,其功能是體現結構域的多種生物學作用。反式作用因子的DNA結合結構域...
(3)一些實際上沒有任何相互作用的但有相同的模體(motif)如兩個親a-螺旋的蛋白質間可以發生相互作用。十年來,酵母雙雜交技術一直在消除假陽性方面不斷改進,並且已取得較好的效果〔2,3〕。在酵母雙雜交的套用中有時也會遇到假陰性現象。所謂假陰性,即兩個蛋白本應發生相互作用,但報告基因不表達或表達程度甚...
鈣調蛋白分子是由 148 個胺基酸殘基組成的高度保守的單鏈多肽,由 N 端和 C 端 2 個結構域及中間連線的螺旋結構組成。每個結構域均由兩個 EF-hands模體組成,每個鈣調蛋白分子含有 4 個Ca結合位點。簡介 Ebashi 等在 1965 年報導了細胞中存在介導鈣信號的鈣結合蛋白,隨後 Cheung 將這一類能結合鈣離子的磷酸...
2) 模具溫度過高,鑄件內部結構緻密,但鑄件易“焊”附於模腔中,粘模不易卸出鑄件。同時過高的溫度會使模體本身膨脹,影響鑄件尺寸精度。3) 模具溫度應選擇在合適的範圍內,一般經試驗合適後,恆溫控制為好。壓鑄成形條件的注意事項 可以簡單歸納為以下兩方面:* 材料熔融溫度、壓射時模具溫度及熔液溫度;工藝 壓力鑄造...
結合GTP,使Ras蛋白由非活性狀態轉變為活性狀態,所以, Sos蛋白是Ras激活蛋白。Sos蛋白不含SH結構域,不屬於SH蛋白。SOS是低分子量G蛋白的正調節因子,含有可以被Grb2的SH3識別和結合的模體結構。在Ras通路中SOS結合到Grb2後被活化,作用於低分子量G蛋白開關Ras,促進Ras蛋白釋放GDP結合GTP.
特點是在三維空間可以明顯區分和相對獨立,並且具有一定的生物功能如結合小分子。模體(motif)是結構域的亞單位 通常由2~3二級結構單位組成,一般為α螺旋、β摺疊和環(loop)。結構域的特點 (1)結構域是球狀蛋白質的獨立摺疊單位。對一些較小的球狀蛋白質分子來說,結構域和三級結構是一個意思。例如紅氧還...
亮氨酸拉鏈體是出現在DNA結合蛋白質和其它蛋白質中的一種結構基元(motif),即模體。當來自同一個或不同多肽鏈的兩個兩用性的α-螺旋的疏水面(常常含有亮氨酸殘基)相互作用形成一個圈對圈的二聚體結構時就形成了亮氨酸拉鏈體。蛋白質局部結構形式,即適於大分子之間相互結合的基元(motif)之一。在生物化學的研究中...
缺血再灌注後DAPK1與ERK相互結合,敲低DAPK1後,ERK核轉位明顯增強,同時細胞凋亡減輕。我們發現DAPK1可與p53結合併磷酸化其絲氨酸23位點,激活的p53主要表達於核內。攜帶有p53DNA結合模體序列的穿膜肽Tat-53DM對再灌注損傷的神經元有保護作用。我們也證實再灌注損傷中DAPK1結合併磷酸化tau蛋白絲氨酸262位點,介導突觸...
3.6.1 模組與模體 3.6.2 層次網路概念 3.6.3 層次網路構造方法 3.7 確定性網路 3.7.1 確定性小世界網路 3.7.2 確定性無標度網路 3.8 自相似網路 3.8.1 複雜網路的自相似性 3.8.2 自相似複雜網路的構造方法 3.9 隨機圖產生器 3.10 結構產生器 3.11 基於連線度的產生器 3.11....
而在體外實驗中FAK鄰近N端的序列可與數種整合蛋白β亞基胞內結構域的人工合成肽結合。這些結合都使FAK分子與聚焦粘附部位接近。然後FAK分子中磷酸化酪氨酸位點與含SH2結構域(即Src同源序列2,能專一地與蛋白質中含磷酸酪氨酸的模體結合)的胞內蛋白質結合。通過這些複雜的相互作用,以FAK為中心的整合蛋白介導信號轉...
