《深海戰爭》中你必須依靠一艘叫作“大海獸”的巨大母艦來挽救水下文明，“大海獸”由四部分設施組成，會隨著你在遊戲中的表現而不斷發展壯大，因此你在遊戲中取得的成就將直接影響到“大海獸”是否能稱霸海底。當你完成一定的任務後會取得軍銜，並且能一步步地升級，軍銜高低影響到你可以駕駛什麼等級的戰艦擊退敵人的侵襲。除了出色的單人遊戲設計，遊戲中的多人模式也毫不遜色，一共有三種形式：單純的死亡模式、戰略死亡模式、岩石足球賽模式。多人遊戲模式的戰鬥在複雜的開放式水下環境中進行，隱蔽在山洞、隧道、海底叢林中，溪流、瀑布穿越其中，把岩石堆推倒引起山崩攻擊敵人，而那些海底生物會令局面變得更混亂。 遊戲中的戰船的設計嚴格參照物理學中的大小、形狀、重量和結構布局，據說是參考了海軍艦隊和潛水艇。開發小組從無數的紀錄影片中認識海中野生動植物的生活習性和環境，然後想像人類怎么才能在那種環境下生存，遊戲中還會出現地震、海底火山爆發和山體滑坡。畫面是遊戲的生命，全新的3D引擎支持從512 X 384到1280 X 1024的解析度，發色數也可以在16位和32位之間選擇。四種風格迥異的海底景色增添了遊戲色彩：有人口眾多的美麗天堂、有古埃及風格的亞特蘭蒂斯、有生長著巨大海洋植物的淺海岩石池、有不同的海平面、有溪流和瀑布、有深不可測的深淵。另外，遊戲還支持“杜比”音效系統和其他3D音效，以及力反饋遊戲搖桿。
