近岸海域三維潮流與水質模型研究(Modeling of Eutrophication in Coastal Waters)(主持,新加坡國立大學、新加坡港務局資助, 11萬新加坡元，1992-1994) ·流域水環境綜合管理規劃模型研究(主持,國家教委留學回國人員科研資助, 3萬元，1995-1997) ·土壤三鹵甲烷前驅物質組成及流出機理研究(1998-2000，主持，廣東省自然科學基金) ·華南地區土壤三鹵甲烷前驅物質組成及流出機理研究(批准號49771071 ) (主持，國家自然科學基金，13萬元，1998-2000) ·珠江口三維水質模型研究,國家863高技術項目“珠江河口海洋環境立體監測綜合技術示範試驗”子課題（負責，國家科技部，7萬元，1998-2000） ·土壤腐殖質性質與三鹵甲烷生成潛能研究（主持，國家教育部高校骨幹教師基金，6萬元，2000-2002） ·感潮河網水環境管理規劃與綜合調控研究（主持，廣東省教育廳“千百十工程”優秀人才培養基金，3萬元，2000-2002） ·珠江口水質自動監測系統開發研究（主持之一，廣東省“科技百項工程計畫”，150萬元，2001-2003） ·污水管中水質淨化與表面曝氣機理的實驗研究（主持，與香港科技大學合作項目，41163港幣，2003-2005） ·珠江河口及其鄰近海域底層水體缺氧現象的模擬研究（主持，中國科學院南海海洋研究所熱帶海洋環境動力學開放實驗室開放研究課題，2萬元，2003-2005） ·佛山水道綜合調水方案優選研究（主持，佛山市環保局，10萬元，2003-2004） ·廣州市禽畜養殖業污染源調查及資料庫研究（主持，廣州市環保局，30萬元，2003-2004） ·廣州市禽畜養殖業對環境的影響及對策研究（主持，廣州市環保局，30萬元，2003-2004） ·廣東省不同源污染土壤中多環芳烴的固有生物降解研究 (主持，廣東省自然科學基金，6萬元，2005-2006) ·Ecosystems, Societies, Consilience, Precautionary principle: Development of an assessment method of the societal cost for best fishing practices and efficient public policies （主持，歐盟第六框架計畫項目，14萬歐元，2005-2010） ·廣州市水環境質量預測及風險預警系統開發與管理對策研究（主持，廣州市建委科技項目，15萬元，2007-2008） ·南海海洋生態系統動力學過程的物理-生態耦合模擬研究（主持，中科院南海海洋研究所熱帶海洋環境動力學重點實驗室開放基金課題，5萬元，2007-2008） ·珠江河網溢油事故對廣州市水源地影響預測和預警研究（主持，廣州市環保局科技項目，20萬元，2007-2009） ·灘涂紅樹林種植-養殖耦合系統試驗示範研究（主持，國家863高技術計畫海洋領域重點項目，289萬元，2007-2010） ·大亞灣海域環境容量評估及入海污染物總量控制對策研究（主持，廣東省海洋與漁業局-惠州市海洋與漁業局科技項目，225萬元，2008-2009） ·珠江口主要環境問題分析與對策（主持，廣東省海洋與漁業局海洋908項目，108萬元，2008-2010） ·城市污水生物處理過程污泥減量新OSA技術（主持，廣東省教育部產學研結合項目，60萬元，2009-2011） ·廣州感潮河道與主要河湧水環境模型開發與套用（主持，廣州市市政工程設計研究院，80萬元，2009-2010） ·海南省南渡江水環境質量應急預測系統開發研究（主持，海南省環境廳，25萬元，2009-2010） ·流溪河流域環境容量及水污染控制策略研究（主持，廣州市環保局-監測站，44萬元，2010-2011） ·廣東省海洋環境保護“十二五”規劃與海洋環境容量研究（主持，廣東省海洋與漁業局，148萬元，2011-2012） ·流溪河水庫水質保護規劃（主持，廣州市環保局，26.6萬元，2012-2013）
發表論文情況
在國際期刊和國核心心期刊發表論文70多篇。代表論文如下：
1. Sueishi,T.,Li,Shiyu,Morioka,T.,Multi-level coordination in basin-wide sewerage planning for river water quality management，Technology Reports of Osaka University，Vol.39,No.1957,1989 （EI收錄）.
3. Li,Shiyu,A programming model for river quality management under transverse mixing，Water Science and Technology，Vol.26,No.7-8,1992 （SCI收錄）.
4. Li,Shiyu,Migita,J.,Pesticide runoff from paddy field and its impact on receiving water，Water Science and Technology，Vol.25,No.11,1992 （SCI收錄）.
5. Li,Shiyu,Chen,G.H.,Modeling the organic removal and oxygen consumption by biofilms in an open-channel flow，Water Science and Technology，Vol.30,No.2,1994 （SCI收錄）.
10. Li,Shiyu,Morioka,T.,Optimal allocation of waste loads in a river with probabilistic tributary flow under transverse mixing，Water Environment Research，Vol.71,No.2,1999 （SCI收錄）.
13. Li，Shiyu，Chen，G.H.,Yen,B.C.,Optimal location of artificial aeration in a tidal river for water quality improvement，Water Science and Technology，Vol.42，No.3-4，2000 （SCI收錄）.
14. Li， Shiyu，Morioka，T.,Modeling the fate of paddy field pesticide in surface water and environmental risk assessment，Journal of Environmental Sciences，Vol.12,No.3，2000.
19. LI Shiyu,Yang Xiuhong,Qiu Rongliang,Wang Peng,Contents and leaching of trihalomethane precursors in soils,Water,Air,and Soil Pollution,Vol.145,No.1-4,p.35-52,2003 (SCI收錄）.
