微生物法醫學：理論與技術

基本介紹

• 書名：微生物法醫學：理論與技術
• 作者：楊瑞馥、宋亞軍
• ISBN：7-5025-6173-0
• 頁數：368頁
• 出版時間：2005年1月
• 裝幀：平膜
• 開本：16開
• 主審：黃培堂
• 版次：1版1次

內容簡介

隨著生物恐怖主義的現實性和危害的有增無減、各類造成嚴重危害的傳染病的不斷出現，微生物法醫學應運而生，為反生物恐怖的工作者和管理者、急性傳染病預防和治療的研究人員和臨床醫生以及法律工作者提供如何調查取證、進行分子生物學分析、區分近源菌毒株、追蹤病原體的理論依據和技術工具。

本書共十二章，前三章為微生物法醫學的基礎知識，介紹基本概念、實驗室建立和各項技術支撐體系；後九章介紹微生物法醫學中的各項套用技術，闡述技術原理、操作步驟、技術優缺點分析選擇，並結合國內外生物恐怖和造成嚴重危害傳染病的具體實例講述各類技術的套用。所以本書既可作為防範生物恐怖、微生物病原檢測和法醫學鑑定等相關領域的教學和培訓用書，又可作為實際研究套用中的案頭參考書。

目錄信息

第一章 微生物法醫學1

第一節 微生物法醫學的發展1

第二節 微生物法醫學的任務3

一、證據調查3

二、生物犯罪中微生物的檢驗與鑑定3

三、追蹤微生物的來源6

四、調查研究7

五、教育培訓與通訊7

第三節 微生物法醫學的未來發展7

一、質量保證（QA）與質量控制（QC）標準的發展7

二、微生物基礎資料庫的標準設計與建立7

三、高水平檢驗鑑定隊伍的培養與組織指揮體系的建立8

四、重點科研領域的支持8

參考文獻8

第二章 高通量實驗室的建立9

第一節 高通量實驗室硬體建設9

一、高通量實驗室的特點10

二、高通量實驗室的工作內容10

三、高通量實驗室的設施與裝備11

第二節 高通量實驗室的軟體建設14

一、實驗室認可14

二、實驗室信息管理系統16

第三節 高通量實驗室的質量保證17

參考文獻18

第三章 微生物法醫學技術支撐19

第一節 證據調查19

一、行之有效的預案的建立19

二、第一反應者任務的落實與持續培訓20

三、及時的採樣與標本的正確運輸20

四、證據調查要及時、記錄要完整21

五、建立各交叉學科間的持久交流與培訓計畫21

六、成立一個永久的微生物專家組，為法律的實施開展諮詢工作21

七、發展標準的操作程式，避免樣品的意外損毀21

第二節 計算機網路和基礎資料庫建設22

一、計算機網路建設22

二、基礎資料庫建設23

第三節 微生物的鑑定與溯源技術體系24

一、檢驗、鑑定程式與技術體系24

二、溯源技術體系30

三、生物犯罪中使用微生物生物工程特性的檢測33

第四節 分型技術的基本要求34

一、分辨力34

二、重複性34

三、分型性34

四、簡便性34

參考文獻35

第四章 表型分析技術36

第一節 生物型分析技術36

一、生化反應36

二、生理試驗37

三、細菌素（bactericin）分型37

四、生物型報告方法38

五、優缺點38

六、套用39

第二節 生化譜分析技術39

一、原理39

二、操作40

三、優缺點43

四、套用43

第三節 表型微點陣技術44

一、原理44

二、操作45

三、優缺點45

四、表型微點陣的套用47

第四節 噬菌體分型分析技術48

一、對細菌進行噬菌體分型的基本要求48

二、噬菌體的分離、純化與增殖技術48

三、噬菌體的效價和裂解譜的測定50

四、細菌的噬菌體分型方法51

五、噬菌體分型的優缺點52

第五節 藥物敏感性試驗52

一、耐藥性產生的機制53

二、藥物敏感性試驗的方法53

三、各種微生物的藥物敏感性試驗57

四、藥物敏感性流行病學59

第六節 血清學分析技術60

一、凝集反應60

二、血清學分型的套用60

三、血清學方法的優缺點62

第七節 LPS譜分析63

一、原理63

二、操作63

三、優缺點64

四、套用64

第八節 PAGE/免疫印跡分析技術65

一、蛋白質免疫印跡的基本流程65

二、蛋白質免疫印跡技術的實驗步驟65

三、免疫印跡技術關鍵點69

四、免疫印跡技術優缺點69

五、PAGE/免疫印跡技術的套用69

第九節 多位點酶電泳分析技術71

一、原理72

二、方法72

三、優缺點76

四、套用76

參考文獻77

第五章 核酸指紋分析技術80

第一節 微生物DNA多態性的演化及其分析技術80

一、微生物基因組80

二、微生物基因組的分子進化83

三、遺傳多態性分析技術90

第二節 質粒指紋圖分析技術92

一、基本原理92

二、質粒指紋圖分析的基本方法93

三、質粒指紋圖譜技術的優缺點95

四、質粒指紋圖譜技術的套用95

第三節 核酸探針雜交分型技術98

一、原理98

二、操作步驟99

三、優缺點105

四、套用106

第四節 隨機擴增多態性DNA分析技術108

一、原理109

二、方法110

三、RAPD方法的評價114

四、套用116

五、展望120

第五節 rep-PCR分析技術121

一、簡介121

二、材料122

三、方法124

四、注意事項127

第六節 限制性核酸片段多態性分析技術（RFLP) 128

一、限制性核酸片段多態性分析基本原理128

二、限制性核酸片段多態性分析RFLP的基本方法128

三、RFLP技術的特點131

四、RFLP技術的套用131

五、RFLP技術的展望132

六、PCR-RFLP分析技術133

第七節 間區寡核苷酸分型分析技術138

一、原理138

二、試驗方法139

三、優缺點141

四、套用141

第八節 脈衝場凝膠電泳144

一、PFGE的技術原理144

二、脈衝場凝膠電泳用於細菌分型的原理146

三、PulseNet簡介149

四、PFGE在微生物法醫學中的套用152

五、PFGE套用展望153

第九節 AFLP分析技術154

一、AFLP的基本原理154

二、AFLP的操作過程155

三、優缺點157

四、套用158

第十節 SNP分析技術159

一、新SNP的鑑定160

二、SNP分型技術161

第十一節 多位點序列分型技術167

一、原理167

二、操作168

三、優缺點169

四、套用170

第十二節 VNTR/MLVA分析技術172

一、VNTR/MLVA的套用原理172

二、VNTR的研究方法174

三、以VNTR為基礎的菌株分型研究177

第十三節 病毒的基因分型及核酸指紋圖譜技術在病毒分型中的套用182

一、病毒的血清型和基因型182

二、核酸指紋圖分析法及其在病毒基因分型中的套用183

三、其他病毒基因分型法概述185

四、幾種重要病毒的基因分型及所採用的基因分型方法191

參考文獻194

第六章 化學分析技術199

第一節 脂肪酸分析技術199

一、原理199

二、氣相色譜分析方法200

三、結果解析202

四、套用實例204

五、展望206

第二節 質譜質量指紋圖技術208

一、質譜的發展歷史208

二、原理與方法209

三、套用215

四、發展與展望229

第三節 細菌紅外光譜分析技術231

一、紅外光譜測定原理231

二、實驗方法231

三、分類鑑別方法與套用232

參考文獻232

第七章 生物晶片分析技術234

第一節 DNA晶片技術234

一、DNA晶片（微點陣）234

二、DNA晶片技術在微生物法醫學上的套用235

第二節 蛋白質晶片243

一、蛋白質晶片的製備244

二、蛋白質晶片在微生物法醫學中的套用248

三、其他方面的套用249

四、蛋白質晶片檢測SARS冠狀病毒特異性抗體250

參考文獻251

第八章 基因組學分析252

第一節 細菌基因組概述252

一、基因組大小252

二、編碼密度高260

三、基因組拓撲結構260

四、原噬菌體（Prophages）和隱性原噬菌體（Cryptic Prophages) 261

五、插入序列（insertion sequence, IS）和轉座子（transposons) 261

六、DNA鏈組成的不對稱性262

七、基因組重排264

八、原核生物基因組的（G+C）含量264

第二節 全基因組鳥槍法測序265

一、基因組DNA提取266

二、文庫構建266

三、大規模培養、質粒提取、測序268

四、序列拼接269

五、完成圖的繪製269

六、完成圖的驗證271

第三節 基因組功能注釋及比較基因組學分析272

一、鹼基組成分析272

二、RNA基因的預測273

三、重複序列273

四、蛋白編碼基因的預測和組功能注釋274

五、運用Artemis軟體人工注釋280

六、序列發布和遞交（GenBank) 280

七、比較基因組學分析280

第四節 基因組學在生物恐怖及不明原因突發性疾病中的套用281

一、基因組分析在1999年美國東北部腦膜炎流行的病原體--西尼羅河

病毒研究中的套用282

二、基因組分析在炭疽生物恐怖中的套用282

三、基因組學分析在SARS防治中的套用283

四、比較基因組學在鼠疫耶爾森菌的基因組分型和菌源追蹤的套用284

參考文獻289

第九章 蛋白質組學方法的套用292

第一節 蛋白質組簡介292

第二節 蛋白質組學研究方法293

第三節 蛋白質組學研究方法在微生物法醫學中的套用307

參考文獻310

第十章 生物信息學分析技術311

第一節 生物信息學簡介311

一、生物信息學概念311

二、生物信息學的研究對象312

三、生物信息學的研究目標和任務313

四、生物信息學的研究內容314

第二節 微生物法醫學中的生物信息學技術318

一、資料庫建設和維護318

二、序列比較319

三、系統進化樹構建322

第三節 生物信息學資源327

一、網際網路資料庫資源327

二、生物信息學分析軟體331

參考文獻332

第十一章 微生物介質分析333

第一節 微生物介質的特點與採集333

一、微生物介質的定義333

二、微生物介質的特點333

三、微生物介質的採集、包裝和運輸333

第二節 微生物介質的分析335

一、微生物介質的分析內容及其對微生物法醫學調查的意義335

二、微生物介質分析手段的要求336

三、微生物介質分析的常用方法337

參考文獻340

第十二章 穩定同位素技術341

第一節 穩定同位素技術的原理和基本概念341

一、穩定同位素技術的原理341

二、穩定同位素技術的幾個基本概念341

第二節 穩定同位素分析方法344

一、傳統的穩定同位素分析方法344

二、自動分析儀器簡介344

第三節 穩定同位素技術的優缺點及套用346

一、穩定同位素技術的優缺點346

二、穩定同位素技術的套用347

三、穩定同位素技術在微生物法醫學中的套用探討348

參考文獻349

附錄 微生物法醫學實驗室質量保證指南350