張文炳(武漢大學物理科學與技術學院教授博導)

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張文炳: 武漢大學物理科學與技術學院 教授博導。1999年獲武漢大學博士學位後留校任教,2000年晉升為副教授。1999年11月——2005年12月,在美國密蘇里-哥倫比亞大學物理系作研究工作,為美國物理學會會員和美國生物物理學會會員。2005年12月回武漢大學,晉升為教授。主要工作方向為生物物理。生物分子是由成千上萬個原子通過共價鍵連結的鏈狀有機分子。生物分子必須形成某種特殊的結構才能發揮生物功能, 錯誤的結構常常引起疾病。根據物理原理, 我們發展統計力學理論和計算機模型, 精確地預測生物分子序列和結構的關係及結構與功能的關係。 力學過程幾乎伴隨細胞循環的每一步.細胞中的力可產生於不同的生化過程: 染色體分離, 複製, 輸運, 蛋白質跨越細胞膜輸運, 蛋白質和核酸的摺疊與反摺疊, 分子馬達, 等等. 我們發展第一性原理的方法來定量預測和分析實驗結果,揭示其分子機理.

學習和工作簡歷,研究興趣,主要方向,近年代表性論文,

學習和工作簡歷

1999年獲武漢大學博士學位後留校任教,2000年晉升為副教授。1999年11月——2005年12月,在美國密蘇里-哥倫比亞大學物理系作研究工作,為美國物理學會會員和美國生物物理學會會員。2005年12月回武漢大學,晉升為教授。

研究興趣

目前,我們的主要工作方向為生物物理。生物分子是由成千上萬個原子通過共價鍵連結的鏈狀有機分子。生物分子必須形成某種特殊的結構才能發揮生物功能, 錯誤的結構常常引起疾病。根據物理原理,我們發展統計力學理論和計算機模型, 精確地預測生物分子序列和結構的關係及結構與功能的關係。
力學過程幾乎伴隨細胞循環的每一步.細胞中的力可產生於不同的生化過程:染色體分離, 複製, 輸運, 蛋白質跨越細胞膜輸運, 蛋白質和核酸的摺疊與反摺疊, 分子馬達, 等等. 我們發展第一性原理的方法來定量預測和分析實驗結果,揭示其分子機理.

主要方向

1. 生物分子(RNA, DNA, protein)的統計熱力學: 結構和穩定性預測, 致病分子的結構, 生物分子序列設計.
2. 生物分子摺疊的動力學: 摺疊機制, 有功能的中間態, 限制變化率的關鍵步, 摺疊路徑和過度態的預測, 變異及分子序列的影響.
3.生物分子相互作用: RNA-RNA, RNA-DNA, DNA-DNA 相結合的統計熱力學和動力學, 結合點的預測和結合分子設計.
4.單分子生物物理: 外力導致的生物分子摺疊和反摺疊, 分子馬達.

近年代表性論文

1 Zhang WB, Chen SJ,RNA hairpin-folding kinetics。 PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 99, 1931(2002).
2 Zhang WB, Chen SJ. Exploring the complex folding kinetics of RNA hairpin. 1. General folding kinetics analysis。 BIOPHYSICAL JOURNAL 90,765(2006)
3. Zhang WB, Chen SJ, Exploring the complex folding kinetics of RNA hairpin. 2. Effect of sequence, length, and misfolded states。BIOPHYSICAL JOURNAL 90,778(2006)
4. Zhang WB, Chen SJ,Analyzing the biopolymer folding rates and pathways using kinetic cluster method. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 119,8716(2003)
5. Zhang WB, Chen SJ, Master equation approach to finding the rate-limiting steps in biopolymer folding. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 118, 3413(2003)
6 Zhang WB, Chen SJ, A three-dimensional statistical mechanical model of folding double-stranded chain molecules。JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 114,7669(2001)
7 Zhang WB, Chen SJ, Predicting free energy landscapes for complexes of double-stranded chain molecules。JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 114,4253(2001)

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