基因組步查法是用以鑑定已經克隆的特定DNA片段側翼順序的方法。用已經被鑑定的特定DNA片段一端或兩端的末端片段為探針去篩選基因組DNA文庫，對已被鑑定的DNA一端或兩端並與之重疊的克隆進行篩選與鑑定。然後用新鑑定克隆中與原始克隆DNA非共有的一端的片段作探針，進行新的篩選與鑑定。依次類推，可以弄清跨度為幾百個kb的連線片段。
DNA文庫嚴格來講應稱作cDNA文庫，中文名稱是基因文庫，是指某生物基因組中所有可表達的基因片段，經mRNA反轉錄後獲得相應的cDNA的集合，將這些cDNA的集合經轉入和克隆後貯存於受體細胞群落中，這個受體細胞群落即構成該生物的cDNA文庫。
