台灣史前時期與歷史時期分界一般以1624年荷蘭人占領台灣南部後，因為傳教目的而傳入羅馬拼音給原住民書寫當時平埔族的語言前後為分界點，時代橫越舊石器時代晚期至金屬器時代，而這段時期中最著名的考古發掘為於台南縣新市鄉（舊名新港）發現的新港文。
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考古發現
根據考古遺址的發掘，台灣在舊石器時代晚期（50,000年前-10,000年前）就已經開始有人類居住。以現有的證據而言，目前台灣最早的文化為長濱文化（以八仙洞遺址最具代表性），這是在東海岸所挖掘出來的考古遺蹟。而在台南縣左鎮一帶，則挖掘出原始人類骨骸，史稱左鎮人。在台北盆地則有圓山文化、芝山岩文化和植物園文化等新石器時代遺址。然而，以目前的考古學證據而言，對於台灣在舊石器時代晚期所出現的文化，並不能確定是哪一種族群的人類所留下的遺留。
能夠確定的，是新石器時代（始於紀元前5,000年）以來的史前文化，是台灣南島系民族的遺留。也就是說，在原住民定居於台灣以前，可能還有別的族群曾經在此定居過。日本學者移川子之藏就曾經這樣表示：“今日在台灣被視為原住民的諸民族之間，不乏證明存在更早期先住民族的口頭傳承。自史前時代起，在本島即有近二十種的先住民族”。
民族
台灣的原住民族呈現多元而複雜情況，大致分成平埔族和高山族（日治時代稱為高砂族）。 高山族分成十二族：泰雅族、賽夏族、卑南族、阿美族、排灣族、布農族、鄒族、魯凱族、達悟族、邵族、太魯閣族（由泰雅族分出）、撒奇萊雅族（96年1月宣布，由阿美族分出），多居住在山地與東海岸縱谷，其體質和文化特色至今大抵尚清晰可辨。平埔族亦大致上可以分成十族：凱達格蘭族、馬賽族、噶瑪蘭族、道卡斯族、巴則海族、巴布拉族、貓霧捒族、洪雅族、西拉雅族、以及猴猴族（Qauqaut），在荷西時期前曾經出現過類似國家組織的部落共主大肚番王（大肚王國），於清雍正時期滅亡。經過三個世紀漢人移入者的侵擾、威脅、同化，以及生存的需要，平埔族的文化特色逐漸消失，與漢人難以區分。台灣很多地名、姓氏、風俗、信仰、歌謠等，則保留了平埔族歷史文化的遺緒。
代表文化
舊石器時代：台灣在舊石器時代晚期（距今5萬年前-1萬年前）已有人類居住。舊石器時代晚期的文化遺址以長濱文化為代表，另有苗栗網形文化、台南左鎮人等。
新石器時代：新石器時代（距今5,000年）以來的史前文化，是台灣南島語系民族的遺留。
早期的大坌坑文化
中期的北部的圓山文化和芝山岩文化，中部的牛罵頭文化，南部的牛稠子文化和東海岸繩紋陶文化等
晚期北部的芝山岩文化和植物園文化，中部的營埔文化，南部的大湖文化，以及東部的卑南文化和麒麟文化。
金屬器時代：是石器與鐵器並用的時代。
十三行文化位於新北市八里區淡水河海口交界處的南岸，距今1500年左右，代表台灣北部鐵器文化的開始，是凱達格蘭、巴賽、噶瑪蘭、猴猴、道卡斯族的共有文化。
中部的番仔園文化，南部的蔦松文化和東部的靜浦文化等。
