西南科技大學水稻研究所成立於1994年，其前身為綿陽經專水稻研究所。研究所現有科技人員9人，其中研究員3人，享受國務院政府特殊津貼1名，四川省學術和技術帶頭人1名，四川省有突出貢獻的優秀專家1名，綿陽市中青年科技拔尖人才1人。該所主要從事水稻遺傳育種研究，常年承擔四川省水稻育種攻關項目、四川省教育廳重點科研項目、轉基因生物新品種培育重大專項等省、市重點科研項目。
西南科技大學水稻研究所是農業部水稻原原種基地、四川省水稻區域試驗基地。分別在四川綿陽青義（學校新區農園）、江油青蓮和海南陵水建有三處科研基地，有科研試驗田80餘畝，科研用房1000餘平方米和配套的實驗室設備。
西南科技大學水稻研究所從事的水稻遺傳育種研究始於1976年，三十多年來，先後育成雜交水稻新不育系二汕A、八汕A、CA、紅矮A、803A、829A、333A、659A、B5A、B6A、B7A等11個不育系和綿恢501、綿恢2009、綿恢2040、綿恢2095、4761等5個恢復系。育成了綿恢501系列、C優系列、紅優系列、B優系列等水稻品種32個，其中Ⅱ優501、B優827、B優811、紅優2009、紅優527等5個品種通過國家農作物品種審定委員會審定。
西南科技大學水稻研究所先後獲得省、市科技進步獎26項，其中省部以上科技進步獎10項（一等獎1項）。獲國家發明專利1項，品種權保護7項。據不完全統計，育成的水稻新品種累計推廣種植面積1.8億畝，創社會經濟效益60多億元。
西南科技大學水稻研究所在成果轉化方面，組建了以西南科技大學水稻研究所為主導，四川西科種業有限公司、四川綿豐種業有限公司、四川竹豐種業有限公司參與的西南科技大學水稻新品種研發創新聯盟，創新聯盟集成了科研、生產、經銷等優質資源，促進了科技成果的推廣和套用。
西南科技大學水稻研究所科技人員在《中國水稻科學》、《乾旱地區農業研究》、《南京農業大學學報》、《雜交水稻》、《種子》、《植物營養與肥料學報》、《西南科技大學學報》、《西南大學學報》、《世界農業》、《西北農林科技大學學報》、《湖北農業科學》等專業學術刊物發表論文60餘篇。
西南科技大學水稻研究所一方面積極指導、培養年輕的研究人員，另一方面積極參與生命科學與工程學院的人才培養工作，共指導碩士研究生5名，指導本科應屆畢業生50餘名。
西南科技大學水稻研究所和四川大學生命學院、四川農科院水稻所、四川農大水稻所積極開展品種選育、基礎研究等方面的合作與交流。其中與四川大學生命學院合作進行的JW型新質源不育系803A的細胞質特性研究已取得了顯著進展，與四川省科院水稻所合作的“長江上游一季超級雜交稻選育”和與中國水稻研究所合作的“抗病轉基因水稻新品種培育”等項目正在進行中。
西南科技大學水稻研究所是農業部水稻原原種基地、四川省水稻區域試驗基地。分別在四川綿陽青義（學校新區農園）、江油青蓮和海南陵水建有三處科研基地，有科研試驗田80餘畝，科研用房1000餘平方米和配套的實驗室設備。
西南科技大學水稻研究所從事的水稻遺傳育種研究始於1976年，三十多年來，先後育成雜交水稻新不育系二汕A、八汕A、CA、紅矮A、803A、829A、333A、659A、B5A、B6A、B7A等11個不育系和綿恢501、綿恢2009、綿恢2040、綿恢2095、4761等5個恢復系。育成了綿恢501系列、C優系列、紅優系列、B優系列等水稻品種32個，其中Ⅱ優501、B優827、B優811、紅優2009、紅優527等5個品種通過國家農作物品種審定委員會審定。
西南科技大學水稻研究所先後獲得省、市科技進步獎26項，其中省部以上科技進步獎10項（一等獎1項）。獲國家發明專利1項，品種權保護7項。據不完全統計，育成的水稻新品種累計推廣種植面積1.8億畝，創社會經濟效益60多億元。
西南科技大學水稻研究所在成果轉化方面，組建了以西南科技大學水稻研究所為主導，四川西科種業有限公司、四川綿豐種業有限公司、四川竹豐種業有限公司參與的西南科技大學水稻新品種研發創新聯盟，創新聯盟集成了科研、生產、經銷等優質資源，促進了科技成果的推廣和套用。
西南科技大學水稻研究所科技人員在《中國水稻科學》、《乾旱地區農業研究》、《南京農業大學學報》、《雜交水稻》、《種子》、《植物營養與肥料學報》、《西南科技大學學報》、《西南大學學報》、《世界農業》、《西北農林科技大學學報》、《湖北農業科學》等專業學術刊物發表論文60餘篇。
西南科技大學水稻研究所一方面積極指導、培養年輕的研究人員，另一方面積極參與生命科學與工程學院的人才培養工作，共指導碩士研究生5名，指導本科應屆畢業生50餘名。
西南科技大學水稻研究所和四川大學生命學院、四川農科院水稻所、四川農大水稻所積極開展品種選育、基礎研究等方面的合作與交流。其中與四川大學生命學院合作進行的JW型新質源不育系803A的細胞質特性研究已取得了顯著進展，與四川省科院水稻所合作的“長江上游一季超級雜交稻選育”和與中國水稻研究所合作的“抗病轉基因水稻新品種培育”等項目正在進行中。
