螺旋—轉角—螺旋

螺旋—轉角—螺旋(helix-turn-helix)是最初在λ噬菌體的阻遏蛋白中發現的一種DNA結合結構域。在阻遏蛋白氨基端有5段 α 螺旋,每段螺旋之間折轉成一定角度相連線,其中兩段負責同DNA結合(圖7—6)。螺旋3由9個胺基酸組成,與前面的由7個胺基酸組成的。螺旋2形成一個角度。α螺旋3通過胺基酸側鏈同DNA鹼基之間的氫鍵同DNA序列相結合,3個胺基酸識別3個鹼基,所以 α 螺旋3被稱為識別螺旋(recognition helix)。α螺旋2則是通過氫鍵同DNA的磷酸骨架相接觸。這種相互作用對於同DNA結合是必需的,但並不控制對靶序列識別的專一性。

最早在原核基因的激活蛋白和阻遏蛋白中發現的調控蛋白, 是一種同型二聚體。

基本介紹

  • 中文名:螺旋—轉角—螺旋
  • 外文名:helix-turn-helix
  • 學科:生物
  • 類型:DNA結合結構域
機制
蛋白質與DNA的識別的分子機制:構成同型二聚體的每個單體由20個胺基酸殘基的小肽組成α螺旋-轉角-α螺旋結構, 其中一個螺旋為識別螺旋(recognition helix), 負責識別DNA大溝的特異鹼基序列。另一個螺旋沒有鹼基特異性, 與DNA磷酸戊糖鏈骨架接觸。在與DNA特異結合時, 以二聚體形式發揮作用, 結合靠蛋白質的胺基酸側鏈與特異鹼基對之間形成氫鍵。

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