美國駐菲律賓軍事基地問題，1947年3月14日，美國和菲律賓兩國政府簽訂了《菲美軍事基地協定》。協定共29條，它規定：菲律賓借給美國軍事基地23處，使用期限為99年。1966年9月，該協定經重新修訂，期限縮短為新協定生效後的25年(1991年)，除蘇比克、克拉克、桑萊岬等重要基地由美使用外，其他軍事基地全部歸還菲律賓。1971年8月31日，菲律賓又宣布收回了桑萊岬海軍基地。以後，美國在菲律賓還保持有克拉克空軍基地和蘇比克空軍基地。1979年1月7日，菲、美兩國簽訂有關美在菲軍事基地協定的6點修政案，正式承認菲律賓對這些軍事基地的主權，任命菲律賓人為基地指揮官，由菲武裝部隊承擔基地外圍的安全任務，美國可以繼續使用菲律賓的軍事基地，美國在5年內向菲律賓提供5億美元的軍援和貸款，美軍不得介入菲內部衝突，但如果菲律賓遭到了外敵入侵，菲政府可以請求美國的援助。同年2月，美國和菲律賓在蘇比克和克拉克舉行了基地移交儀式。此後，美國在菲律賓的駐軍大約有1.6萬人，飛機110架，實際上仍控制著這兩個軍事基地。科拉松·阿基諾當政期間，她主張至少在1991年菲、美軍事基地協定到期之前，美國可以繼續在菲律賓保留軍事基地。1987年2月11日生效的菲律賓憲法規定：美國在菲律賓的軍事基地於1991年期滿後，須經過議會來決定是否延長租借期。1992年12月31日，美國撤出了它駐菲律賓的全部軍事人員和軍事設施，原美在菲的軍事基地移交菲律賓政府。
