簡單序列長度多態性

簡單序列長度多態性是據串聯重複排列微衛星基序兩側的單一序列設計引物,對微衛星序列(microsatellite DNA或simple sequence repeats,SSR)進行擴增,由微衛星基序重複數目的變異而產生多態性。

基本介紹

  • 中文名:簡單序列長度多態性
  • 外文名:simple sequence length polymorphism
  • 簡稱:SSLP
  • 解釋串聯排列微衛星基序序列設計引物
英文,定義,

英文

simple sequence length polymorphism,SSLP

定義

由於基因組中某一特定的微衛星的側翼序列通常都是保守性較強的單一序列,因而可以將微衛星側翼的DNA片段克隆、測序,然後根據微衛星的側翼序列就可以人工合成引物進行PCR擴增,從而將單個微衛星位點擴增出來。
由於單個微衛星位點重複單元在數量上的變異,個體的擴增產物在長度上的變化就產生長度的多態性,這一多態性稱為SSLP,每一擴增位點就代表了這一位點的一對等位基因。SSLP是一些長度不等的重複序列、有多個等位基因位點,它們多為2-4個核苷酸序列重複(也叫微衛星標記),在不同動植物品系中其重複次數不同,故可用PCR法來檢測各該多態性序列的長度,從而快速測定出多種回交後代中標記物的分離方式。基因組中廣泛分布,等位性變異豐富,檢測手段簡便,穩定可靠而受重視,但是微衛星標記要求已知微衛星兩側單一序列信息而使其發展受到限制,同時微衛星標記具有嚴格的種屬特異性也使其套用上受到限制。

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