相對定量的目的是測定目的基因在兩個或多個樣本中的含量的相對比例，而不需要知道它們在每個樣本中的拷貝數。
相對定量的目的是測定目的基因在兩個或多個樣本中的含量的相對比例，而不需要知道它們在每個樣本中的拷貝數。舉例來說，如果研究項目中包括處理過的和未經處理的對照樣本，通常可以將未經處理的樣本指定為基準，規定其目的基因濃度為 100%，將經處理的樣本的定量結果除以對照樣品的定量結果，就可以計算各個處理樣本的基因含量相對於未處理樣品的百分比。
絕對定量實驗必須使用已知拷貝數的絕對標準品，必須做標準曲線。相對定量可以做標準曲線，也可以不做標準曲線。
相對定量實驗有兩種方法：標準曲線法和CT值比較法。如果使用標準曲線法，可以使用絕對標準品，也可以使用相對標準品，而且相對標準品在實驗操作上更為簡便易行。相對標準品是只知道樣品中DNA或RNA的稀釋比例而不需要知道其分子數目的標準品，典型的做法是將一個已知pg數的樣品做一系列梯度稀釋。
CT值比較法是利用CT值與起始DNA濃度的對數成反比的數學關係，來計算不同樣本之間的相對百分比。
相對定量實驗有兩種方法：標準曲線法和CT值比較法。如果使用標準曲線法，可以使用絕對標準品，也可以使用相對標準品，而且相對標準品在實驗操作上更為簡便易行。相對標準品是只知道樣品中DNA或RNA的稀釋比例而不需要知道其分子數目的標準品，典型的做法是將一個已知pg數的樣品做一系列梯度稀釋。
CT值比較法是利用CT值與起始DNA濃度的對數成反比的數學關係，來計算不同樣本之間的相對百分比。
相對定量的標準品容易在實驗室里自己製備，但是數據處理比較麻煩，對實驗數據的解釋有一定難度。
