牙本質小管（dentinal tubule）貫通整個牙本質，自牙髓表面向釉牙本質界呈放射狀排列，在牙尖部及根尖部小管較直，而在牙頸部則彎曲呈“～”形，近牙髓端的凸彎向著根尖方向。
小管近牙髓一端較粗，其直徑約為2.5μm，越向表面越細；近表面處約為lμm，且排列稀疏。因此牙本質在近髓端和近表面每單位面積內小管數目之比約為4：1.牙本質小管自牙髓端伸向表面，沿途分出許多側支，並與鄰近小管的側支互相吻合。牙根部牙本質小管的分支數目比冠部者多。牙本質小管的內壁襯有一層薄的有機膜，礦化差，稱為限制板（Lamina limitans），它含有較高的氨基多糖（glycosaminoglycans），可調節和阻止牙本質小管礦化。
