烏干達宗教戰爭，英國聖公會、法國羅馬天主教會和阿拉伯伊斯蘭教傳教士在赤道非洲烏干達地區傳教過程中發生的衝突和戰爭。19世紀，位於今烏干達共和國境內的布甘達國王穆特薩一世在位期間(1856～1888)，其王國開始受到外國影響。1877年，英國聖公會的傳教士進入布甘達。法國羅馬天主教會和阿拉伯伊斯蘭教的傳教士亦接踵來到烏干達赤道非洲地區傳教。當地國王姆旺加懼怕外來者對其臣民的影響，遂決定根除外來傳教士。但他未及實施這一計畫就被迫出逃，而由其兄弟基凱瓦繼承王位。雖然基凱瓦允許3種宗教享有平等傳教權力，但烏干達並未得到和平。
