染色質與表觀遺傳調控

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出版社是高等教育出版社，出版時間是2006年。

內容介紹

表觀遺傳調控是後基因組時代分子生物學前沿的熱點領域之一，而真核基因組DNA所在的染色質結構是各表觀遺傳調控途徑的共同的匯聚點。本書介紹了相關領域研究的最新進展，首先介紹了從核小體基本結構到高度凝聚的異染色質結構的形成、特異標誌及其在表觀遺傳調控網路中的作用；隨後分別介紹了核心組蛋白的乙醯化、甲基化等多種修飾及其相互關係對基因轉錄前核小體的開關作用及其機制，以及依賴ATP的染色質重塑複合物參與的染色質結構的去阻遏或開放等染色質重塑過程；並介紹了真核基因組DNA的甲基化修飾以及小RNA介導的染色質凝聚等所導致的基因阻遏調控機制。此外還對各體系間的相互作用，以及與疾病的關係等進行了簡要的介紹。

第一章染色質的結構與功能
第一節染色質的基本結構
一、染色質的基本單位——核小體
二、核小體的裝配與相位
三、染色質高級結構
第二節染色質結構域及其相關元件
一、染色質的結構域效應
二、染色質元件及其結合蛋白
第三節染色質的修飾與結構重塑
一、染色質的修飾及其意義
二、染色質高級結構的分類和修飾特徵
第四節染色質與表觀遺傳調控網路
結束語
參考文獻
第二章核心組蛋白的修飾
第一節組蛋白密碼
一、組蛋白修飾與基因轉錄調控

二、組蛋白修飾的生理與病理意義
第二節組蛋白乙醯化修飾
一、組蛋白乙醯基轉移酶
二、天然核小體乙醯化複合物
三、組蛋白乙醯基轉移酶和FAT
四、組蛋白去乙醯基酶
第三節組蛋白甲基化修飾
一、組蛋白賴氨酸甲基化
二、組蛋白精氨酸甲基化
三、組蛋白去甲基化
第四節組蛋白磷酸化
一、組蛋白H3磷酸化
二、組蛋白H2B磷酸化
三、組蛋白H2A和組蛋白H4的磷酸化
第五節組蛋白其他類型修飾
一、組蛋白泛素化修飾
二、組蛋白SUMO化修飾
三、組蛋白生物素化修飾
第六節組蛋白修飾的網路
一、組蛋白修飾的順式相互作用
二、組蛋白修飾的反式相互作用
三、組蛋白甲基化與DNA甲基化之間的相互作用
結束語
參考文獻
第三章依賴於ATP的染色質重塑複合物
第一節概述
一、染色質重塑複合物的組成
二、染色質重塑複合物的作用機制
三、染色質重塑複合物對基因轉錄的激活作用
四、染色質重塑複合物參與抑制基因的轉錄
第二節 SWI/SNF複合物家族
一、SWI/SNF複合物家族的組成
二、SWI/SNF複合物的結構域及功能
三、不同的SWI/SNF複合物提供特定的功能
第三節 ISWI複合物家族
一、ISWI複合物的功能
二、種類繁多的ISWI複合物
第四節 Mi-2複合物家族
一、Mi-2的功能特異性
二、MBD2、MBD3與DNA甲基化
三、MTA蛋白家族與Mi-2/NuRD的功能特異性
第五節 Ino80和SWRl染色質重塑複合物
一、lno80和SWRl重塑複合物的亞基組成
二、參與組蛋白的交換
三、參與DNA損傷斷裂修復
第六節 ATP依賴的染色質重塑複合物與其他染色質重塑機制的聯繫
一、重塑機制協同激活轉錄
二、重塑機制協同抑制轉錄
結束語
參考文獻
第四章真核基因組DNA的甲基化修飾
第一節甲基化的基本概念
一、原核生物甲基化現象
二、真核生物胞嘧啶甲基化
第二節 DNA甲基化對真核基因表達調控的作用
一、DNMT家族介導轉錄抑制活性
二、MBD家族介導的轉錄阻遏機制
三、DNA甲基化排斥轉錄因子
四、DNA甲基化和組蛋白修飾協同參與轉錄調控
第三節 DNA甲基化在重大生命活動中的調控作用
一、DNA甲基化在重要生理活動中的調控作用
二、DNA甲基化在疾病中的調控作用
第四節甲基轉移酶抑制劑在腫瘤治療中的作用
結束語
參考文獻
第五章 RNA與染色質
第一節 RNA干擾及其機制
一、RNA干擾的轉錄後沉默
二、siRNAs與miRNAs的聯繫和區別
第二節 RNAi介導的轉錄水平沉默
一、RNA指導的DNA甲基化
二、依賴RNAi的異染色質形成
第三節 RNA干擾的套用
一、RNA干擾在基因功能研究上的套用
二、RNA干擾在醫藥科學上的研究及套用前景
結束語
參考文獻
附錄輔助閱讀材料
一、染色質免疫沉澱分析
二、全基因組定位技術
三、核小體相位分析
四、染色質DNA酶I高敏感位點的檢測
五、體內DNA足跡法
六、體外染色質裝配
七、分離組蛋白變異體及修飾異構體
八、電泳遷移率變更檢測法
九、DNA甲基化檢測方法
十、RNA干擾技術
十一、染色質構象捕獲技術
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