林森傑

林森傑

1995年畢業於紐約州立大學(石溪分校),獲生物海洋學博士學位,2009年獲美國康乃狄克大學終身教授職位,2010年加盟廈門大學。現任《Frontiers in Microbiology》、《Plos ONE》等期刊編輯。

基本介紹

  • 中文名:林森傑
  • 外文名:Senjie Lin
  • 國籍:美國
  • 出生地:中國 福建
  • 出生日期:1964年
  • 職業:美國康涅迪克大學教授,博士生導師
  • 畢業院校:紐約州立大學石溪分校
人物成就,代表作品,

人物成就

首次將PCNA方法套用到浮游植物細胞周期和生長率現場觀測,開拓了浮游植物整體細胞免疫染色的方法。套用浮游植物整體細胞免疫染色的方法發現了固氮藍藻(紅束毛藻)的固氮酶只分布在一部分(分化的)細胞內,為了解此生物種如何克服固氮與光合之間矛盾提供了細胞化學的證據。套用分子生物學和生理學方法首次發現在南極積雪裡有細菌生存。
首次在浮游植物里克隆了線粒體細胞色素B基因,並套用它設計分子探針用以探測噬魚費氏藻(Pfiesteria piscicida), Karlodinium veneficum等甲藻。
首次在甲藻門內發現mRNA編輯現象,推翻了過去認為Alveolata(包括纖毛蟲、瘧原蟲)可能不存在此現象的假說。同時為研究甲藻(如亞力山大藻)生產毒素和形成赤潮的遺傳機制提供了一條新思路。
克隆了甲藻特異的Rubisco(CO2固定酶)第三例,首次證明這個基因重複排列(tandem repeat),並且這些重複基因組一起被轉錄、翻譯。用Rubisco基因首次發現浮游纖毛蟲攝食大型海藻,說明傳統的大型海藻的顆粒食物鏈需要修訂
首次嘗試用線粒體細胞色素B基因分析浮游植物的系統進化,演示了這個基因作甲藻系統進化分析的潛力並顯示一些重要門類的系統地位需要修改。
首次發現甲藻spliced leader RNA trans-splicing, 為甲藻現場實時基因組表達模式的研究打下基礎。
在國際上首次系統完整地分析了甲藻基因組的結構特性,描繪了珊瑚蟲和蟲黃藻共生過程中相互作用的分子機制,為今後甲藻基因組學和珊瑚-蟲黃藻共生生態系統的深入研究奠定了堅實的分子生物學基礎。這一研究成果不但填補了國內空白,且處於國際領先水平。

代表作品

Lin, S*., Cheng, S., Song, ., Zhong, X., Lin, X., Li, W., ... and Cai, M. 2015. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis.Science350(6261), 691-694.
Qiu, D., Huang, L., &Lin, S*. (2016). Cryptophyte farming by symbiotic ciliate host detected in situ.Proceedings of the National Academy of Sciences, 113(43), 12208-12213.
Lin, S*., Zhang, H., Zhuang, Y., Tran, B., and Gill, J. 2010. Spliced leader–based metatranscriptomic analyses lead to recognition of hidden genomic features in dinoflagellates.Proceedings of the National Academy of Sciences107(46), 20033-20038.
Zhang, H., Hou, Y., Miranda, L., Campbell, D. A., Sturm, N. R., Gaasterland, T., andLin, S*. 2007. Spliced leader RNA trans-splicing in dinoflagellates.Proceedings of the National Academy of Sciences104(11), 4618-4623.
Shi, X., Lin, X., Li, L., Li, M., Palenik, B., &Lin, S*. 2017. Transcriptomic and microRNAomic profiling reveals multi-faceted mechanisms to cope with phosphate stress in a dinoflagellate.The ISME journal,11(10), 2209.
Ji, N., Lin, L., Li, L., Yu, L., Zhang, Y., Luo, H., ... &Lin, S*. 2018. Metatranscriptome analysis reveals environmental and diel regulation of aHeterosigma akashiwo(Raphidophyceae) bloom.Environmental microbiology20(3):1078-1094.
Luo, H., Lin, X., Li, L., Lin, L., Zhang, C., &Lin, S*. (2017). Transcriptomic and physiological analyses of the dinoflagellate Karenia mikimotoi reveal non-alkaline phosphatase-based molecular machinery of ATP utilisation.Environmental microbiology,19(11), 4506-451
de Mendoza, A., Bonnet, A., Vargas-Landin, D. B., Ji, N., Hong, F., Yang, F., ... Lin, S, & Ohta, H. (2018). Recurrent acquisition of cytosine methyltransferases into eukaryotic retrotransposons.Nature Communications,9(1), 1341.

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