杜茁,2008年獲得中國農業大學生物學院博士學位,研究員,博士生導師。
基本介紹
- 中文名:杜茁
- 畢業院校:湖南農業大學
- 學位/學歷:博士、博士生導師
- 專業方向:在系統層次理解動物胚胎髮生
- 學位:博士
- 職稱:研究員
個人簡介,研究介紹,代表文章,
個人簡介
2003-2008年,中國農業大學,生物學院,生物化學與分子生物學專業,理學博士;
2008-2009年,Albert Einstein College of Medicine,細胞生物學系,博士後;
2009-2014年,Memorial Sloan Kettering Cancer Center,發育生物學系,博士後;
2015年1月起,中國科學院遺傳與發育生物學研究所,研究員;
研究介紹
本課題組致力於研究動物胚胎髮生,即一個細胞如何發展為一個個體。系統生物學的理論和方法學與經典發育遺傳學的融匯衍生了發育系統生物學領域,使得在系統層次(如全部基因,所有細胞)解析胚胎髮生成為可能。我們以簡約而強大的模式動物線蟲為模型,運用系統生物學策略探索胚胎髮生的調控機理、網路與規律。
隨胚胎髮生的推進,基因組信息和遺傳調控網路在時空展開,對特定細胞的發育施以精確控制。異於經典的發育遺傳學研究,我們關注的不是一個特定的基因(如Oct-4),一個特定的通路(如Wnt),或者一個特定的發育過程(如細胞極性);我們更感興趣的是將單個胚胎細胞作為研究胚胎髮生的基本單元,利用高解析度、高通量的遺傳干擾、活體成像和表型生物信息學分析揭示基因組活性如何決定細胞狀態,細胞狀態如何影響發育功能。
代表文章
Du Z*, Santella A, He F, Shah PK, Kamikawa Y, Bao Z*. The regulatory landscape of lineage differentiation in a metazoan embryo
Elewa A, Shirayama M, Kaymak E, Harrison PF, Powell DR, Du Z, Chute CD, Woolf H, Yi D, Ishidate T, Srinivasan J, Bao Z, Beilharz TH, Ryder SP, Mello CC. POS-1 promotes endo-mesoderm development by inhibiting the cytoplasmic polyadenylation of neg-1 mRNA
Du Z, He F, Yu Z, Bowerman B, Bao Z, E3 ubiquitin ligases promote progression of differentiation during C. elegans embryogenesis
Du Z, Stantella A., He F., Tiongson M, Bao Z. De novo inference of systems-level mechanistic models of development from live imaging-based phenotype analysis
Moore JL, Du Z, Bao Z. Systematic quantification of developmental phenotypes at single-cell resolution during embryogenesis
Wu Y, Ghitani A, Christensen R, Santella A, Du Z, Rondeau G, Bao Z, Colón-Ramos D, Shroff H. Inverted selective plane illumination microscopy (iSPIM) enables coupled cell identity lineaging and neurodevelopmental imaging in Caenorhabditis elegans
Schultz SS, Desbordes SC, Du Z, Kosiyatrakul S, Lipchina I, Studer L, Schildkraut CL. Single-molecule analysis reveals changes in the DNA replication program for the POU5F1 locus upon human embryonic stem cell differentiation
Du Z, Zhao Y, Li N. Genome-wide colonization of gene regulatory elements by G4 DNA motifs
Du Z, Zhao Y, Li N. Genome-wide analysis reveals regulatory role of G4 DNA in gene transcription

