札薩克旗，清代所設遊牧旗之中的主要一種。清廷對蒙古的統治體制是：八旗蒙古、外藩蒙古和內屬蒙古。外藩蒙古實行王公(封爵)制度、札薩克制度和盟旗制度；內屬蒙古實行總管旗制度；此外由於對藏傳佛教的特殊政策而產生喇嘛旗。除八旗蒙古這一清朝世仆外，其遊牧旗可分為三種：即札薩克旗、總管旗及喇嘛旗。中以札薩克旗為最多。自後金天命十一年(1626)至乾隆三十六年(1771)蒙古各部歸附清朝過程中，根據八旗制度組織原則，在蒙古原有社會制度基礎上，札薩克旗逐步建立和完善起來。綜清前期，於內外蒙古、青海與西北蒙古以及回部(維吾爾)之哈密、吐魯番此二處之間，共設有200個札薩克旗。於蒙古，每部或編為一旗，或多達20餘旗不等。直隸理藩院。內蒙古49旗原屬舊藩，清人俗稱“內札薩克”；其餘蒙古149旗則稱“外札薩克”。援“內八旗”之制，敷設其官弁：普設札薩克之職以掌旗，即旗長，由清政府於各旗內王公中任命，給予一定的自主自治權，屬世職之一(“公中札薩克”除外)。置協理台吉為副手，下設管旗章京、參領、佐領、驍騎校諸員及領催、什長諸人以治理。旗際間互不統屬，各統以駐紮之將軍、辦事大臣等。除地處偏僻的孤旗之外，則以其鄰近數旗、同部或同翼的旗分，各建立3年一次的會盟之制，由清政府任命盟內各旗中的札薩克1人兼攝盟長，充會盟召集、主持人。外札薩克蒙古各盟長無兵權。內札薩克蒙古各盟不設副將軍。副將軍，該置者每盟置1員，以稽察盟內各旗軍容、器械等，授之纛(多用正黃、正白旗)。遇徵兵，從者由清政府資以糧餉；平時，其生計悉由各旗自理。
