傳統的政務流程複雜且分散。由於以前的技術不能實現整個業務條塊的聯網，整個業務數據流程不得不按地理位置和人力分配被分割在多個部門，從一個部門轉到另一個部門，增加了交接環節和複雜程度；在傳統的業務流程中，相同的信息往往在不同的部門都要進行收集、存儲、加工和管理，造成了大量重複勞動。
目前，雖然不少政府部門已經開展了電子申報和網上審批，但大多停留在用計算機系統去模仿傳統的手工處理過程。隨著電子政務的深入開展，不能簡單地將現有政府事務原封不動地移到計算機上處理，必須對政府傳統工作方式、方法、程式等進行重新審視，進行必要的清理、簡化、最佳化、整合和改造。
政務流程再造(Government Process Reengineering，GPR) 運用現代公共行政學理論和信息技術手段，對政府部門的業務流程作根本性的思考和徹底重建，其目的是在辦事效率、行政效能、行政成本、行政能力和公共服務等方面取得顯著的進步，使得政府部門能最大限度地適應行政管理體制改革的要求。政務流程再造要把傳統以政府職能為中心的行政模式轉變為以政府客戶為中心的行政模式，要以新公共管理理論和新公共服務理論倡導的價值體系為核心。
通過政務流程再造，可以確定每個政務流程應該採集的信息，並通過套用系統實現信息在整個流程上的共享使用。可以充分授予辦事人員以許可權，發揮每個公務員在業務流程中的作用。可以將傳統業務流程的串聯模式變成並聯模式，提高辦事效率。可以在變革中不斷整合政府職能，不斷提升政府績效水平。根據國外實踐經驗，實施政務流程再造以後，政府部門的績效水平可以提高40%到60%。
政務流程再造一個典型案例是美國印第安納玻利斯市個人防盜報警系統的安裝許可申請。美國印第安納玻利斯市原來準備把安裝個人防盜報警系統的安裝許可申請流程原封不動地搬到網上去，但在該電子政務系統設計和認證過程中，有的專家指出這套申請程式本身存在低效、耗時等問題，建議由負責安裝的公司向市政府註冊。經過這樣修改，整個個人防盜報警系統的安裝許可申請流程環節減少了很多，公眾的滿意程度也得到了很大的提高。
政務流程再造的一般步驟如下：首先梳理政府部門的業務，對業務進行分類並劃分層次；建立業務描述標準和業務流程圖繪製標準，對每個業務進行描述並繪製相應的業務流程圖。然後對辦事人員和政府客戶（企事業單位和個人）進行調查研究，徵求他們對現有業務流程的意見；根據調研結果對業務流程進行分類，針對不同情況選擇再造方法（如廢除、簡化、最佳化、合併等），繪製新的業務流程圖。最後發布新的業務流程規範，對原工作流程、機構設定和人員編制進行調整，並建立配套的監督管理制度。
由於商務流程再造起步早，理論和方法相對成熟，政務流程再造可以借鑑商務流程再造的有關成果，制定政務流程再造相關標準規範，研製政務流程再造工具。
值得指出的是，政務流程再造必然會引起行政權力和部門利益的再分配，權力和部門利益之爭將成為政務流程再造的強大阻力。高層官員和政府部門一把手一定要下定決心，堅持不懈地推進政務流程再造工作。值得慶幸的是，黨中央、國務院歷來高度重視行政管理體制改革，中國共產黨第十七屆中央委員會第二次全體會議提出了關於深化行政管理體制改革的若干意見。
