均一化cDNA文庫

均一化cDNA文庫是指某一特定組織或細胞的所有表達基因均包含其中,且在cDNA文庫中表達基因對應的cDNA的拷貝數相等或接近。

中文名稱均一化cDNA文庫
英文名稱normolized cDNA library
定  義減少冗餘轉錄物的拷貝而增加低豐度轉錄物的拷貝而構建的cDNA文庫。
套用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)

基本介紹

  • 中文名:均一化c DNA文庫
  • 外文名:normolized cDNA library
WESSMAN早就提出了可以通過基因組DNA飽和雜交的原理將c DNA文庫進行均一化的理論,但該理論一直都被認為不能套用於實際。
其主要限制因素是難以提供足量的極低表達豐度的c DNA用於飽和雜交,從而會造成部分基因的c DNA的丟失。20年前,基於DNA-RNA雜交的研究就已經將基因的轉錄分為高中低三類。隨後研究表明,絕大多數基因是處於中等或低等表達豐度的,在單個細胞中含有近1~15個拷貝,而高豐度表達基因的轉錄產物在單個細胞中最高可達5000個左右拷貝,約占總表達量的25%.
這種基因表達上的巨大差異成為了獲得一個具有完整性c DNA文庫的障礙,其表達量上的巨大差異更為大規模研究增添了困難。對單一組織的c DNA文庫而言,高拷貝基因的大量存在給基因的篩選和鑑定帶來了不必要的浪費,尤其是在大規模的EST測序中。
均一化c DNA文庫是克服基因轉錄水平上巨大差異給文庫的篩選和分析帶來障礙的有效措施,有利於研究基因的表達和分析。現在,在構建均一化c DNA文庫中至少有兩種主要的觀點。一種是基於復性動力學的原理,高豐度的c DNA在退火下復性速度快,而低豐度的c DNA復性要很長時間,從而可以通過控制復性時間來降低豐度;另一種是基於基因組DNA在拷貝數上具有相對均一化的性質,通過c DNA和DNA的飽和雜交而降低在文庫中高拷貝存在的c DNA的豐度。
目前已報導的均一化c DNA文庫多是根據第二種原理構建的,常用策略有基於PCR技術套用c DNA多次復性c RNA-c DNA雜交等。

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