合成寡核苷酸

是通過適當保護的亞磷醯胺核苷的3′端磷酸基團與5′末端羥基的酯化每次產生一個鹼基而合成的，5′端羥基是通過一個接頭連線到固相載體上。合成是從3′到5′的方向合成，而酶促反應是以相反的方向進行的。每一輪偶聯反應包括四種反應：輕度鹼水解、輕度酸水解、親核取代和氧化還原替換。在偶聯過程每一階段反應後，未參與反應的化學物被洗掉。