《分子診斷學—基礎與臨床》是2014年6月科學出版社出版的圖書，作者是姜儻。
基本介紹
- 書名：分子診斷學—基礎與臨床
- 作者：姜儻
- ISBN：9787030403728
- 頁數：624
- 定價：180.00
- 出版社：科學出版社
- 出版時間：2014年6月
- 裝幀：平裝
- 開本：16開
編輯推薦,內容簡介,圖書目錄,
編輯推薦
《分子診斷學———基礎與臨床》適用於各大醫療機構檢驗科、分子診斷實驗室、科研機構、分子遺傳學、生物醫學、臨床醫學等相關學科的本科生、研究生、科研人員、臨床醫生等專業人員。相信從事科研、臨床分子診斷的實驗人員，臨床醫學、分子遺傳學、生物醫學等相關學科的工作人員、本科生、研究生等均可從《分子診斷學———基礎與臨床》得到啟發及受益。
內容簡介
隨著分子生物學理論的迅速拓展，分子診斷學正發生著日新月異的變化，且在臨床疾病診斷中發揮了其無可比擬的作用。《分子診斷學——基礎與臨床》正是順應目前基礎科學的發展及臨床診治的需要而撰寫，並將為分子診斷學的發展起不可估量的推動作用。《分子診斷學——基礎與臨床》由三個重要的部分構成：（1）分子診斷學原理；（2）分子診斷學技術（3）分子診斷學實踐（即臨床套用）。
圖書目錄
序
前言
緒論 1
一、分子診斷學的定義 1
二、分子診斷學的發展簡史及主要技術 1
三、分子診斷學在醫學中的套用 5
四、分子診斷的套用前景展望 8
第一篇 分子診斷學理論基礎
第一章 基因組學 13
第一節 基因組學概論 13
一、基因 13
二、基因組 16
三、基因組學 16
四、基因組學的意義 17
第二節 原核生物基因組 21
一、原核生物基因組特點 21
二、原核生物基因組的類核結構 22
三、質粒 22
四、原核細胞的基因轉移 23
第三節 真核生物基因組 24
一、真核生物基因組的結構與功能 24
二、線粒體基因組 29
三、人類基因組研究 31
四、人類基因組多樣性 35
第四節 比較基因組學 38
一、比較基因組學研究原理 39
二、比較基因組學的幾個相關概念 39
三、比較基因組學的研究策略 40
四、比較基因組學在基因分析中的套用 41
五、比較基因組雜交技術在腫瘤研究中的套用 41
第五節 原核生物———微生物基因組 43
一、大腸埃希菌基因組學 44
二、流感嗜血桿菌基因組學 45
三、陰溝腸桿菌基因組學 46
四、鮑曼不動桿菌基因組學 47
五、肺炎鏈球菌基因組學 49
六、腦膜炎奈瑟菌基因組學 51
七、銅綠假單胞菌基因組學 52
八、結核分枝桿菌基因組學 53
九、幽門螺桿菌基因組學 53
十、衣原體基因組學 54
十一、肺炎支原體基因組學 56
第六節 原核生物———病毒基因組 57
一、病毒基因組學 58
二、B型肝炎病毒基因組學 59
三、C型肝炎病毒基因組學 61
四、HIV基因組學 62
五、人類乳頭瘤病毒基因組學 69
六、伊波拉病毒基因組學 71
七、SARS病毒基因組學 72
八、禽流感病毒基因組學 74
九、腸道病毒基因組學 75
十、單純皰疹病毒基因組學 77
十一、巨細胞病毒基因組 78
十二、EB病毒基因組學 79
十三、朊病毒基因組學 80
第二章 轉錄組學 82
第一節 基因表達的概念及特點 83
一、基因表達的概念 83
二、基因表達的時間性及空間性 83
三、基因表達的方式 83
第二節 轉錄作用及組成 84
一、轉錄作用及其特點 84
二、RNA聚合酶 84
三、啟動子及終止信號 85
四、增強子 86
五、終止信號 86
第三節 真核基因轉錄過程 87
一、 RNAPolⅡ的轉錄起始 87
二、延長 88
三、終止 88
第四節 轉錄後加工 88
一、mRNA前體的加工 89
二、tRNA前體的加工 91
三、rRNA前體的加工 91
第五節 真核生物基因表達的調控 91
一、染色體水平的調控 92
二、染色質水平調控 93
三、DNA水平的調控 95
四、轉錄水平的調控 96
五、轉錄起始和加工的調節 98
六、翻譯的調控 98
七、小分子RNA的調控 99
第三章 蛋白組學 102
第一節 蛋白組學概論 102
一、蛋白質組和蛋白質組學 102
二、蛋白組學研究的意義和內容 102
三、蛋白質組學的研究策略和一般步驟 103
第二節 蛋白質翻譯後修飾及功能確定 104
一、蛋白質翻譯後修飾的種類 105
二、蛋白質翻譯後修飾的作用 105
三、蛋白質修飾的蛋白組學研究 106
第三節 蛋白質與核酸間的相互作用 111
一、蛋白質與DNA僅Df啌C3僅的相互作用 111
二、蛋白質與RNA的相互作用 115
第四節 蛋白質與蛋白質間的相互作用 117
一、蛋白質相互作用研究的意義 117
二、蛋白質相互作用的分子結構基礎 118
第五節 蛋白質組學的套用 121
一、臨床蛋白質組學 121
二、藥物蛋白質組學 127
三、微生物蛋白質組學 129
四、毒理蛋白質組學 132
第四章 代謝組學 133
第一節 代謝物靶標分析 133
一、代謝物的生理作用 134
二、代謝物靶標分析 134
第二節 代謝輪廓(譜)分析 138
一、 高效液相色譜技術在代謝組學中的套用 139
二、毛細管HPLCMS代謝組學研究 140
三、UPLCMS的代謝組學研究 141
四、HPLC在代謝組學研究中的地位 141
第三節 代謝指紋分析 142
一、代謝指紋分析技術的進展 142
二、代謝指紋分析在代謝組學研究中的作用 144
第四節 代謝組學 144
第二篇 分子診斷學技術
第一章 基因組學 151
第一節 核酸的分離和純化 151
一、真核基因組DNA的分離純化 151
二、基因組DNA的提取 154
三、質粒DNA的提取與純化 156
四、真核細胞RNA的分離純化 166
第二節 核酸分子雜交技術 170
一、核酸雜交的基本原理 170
二、核酸探針 170
三、核酸探針的製備 172
四、探針的標記及檢測 173
五、核酸分子雜交技術 180
第三節 基因擴增檢驗技術 186
一、聚合酶鏈反應技術的原理 186
二、聚合酶鏈反應技術的設計及最佳化 187
三、聚合酶鏈反應技術的進展 194
四、螢光定量聚合酶鏈反應技術 197
五、有限稀釋法 204
第四節 DNA指紋技術 204
一、DNA指紋技術的原理 205
二、DNA指紋技術的優點 205
三、DNA指紋圖的遺傳規律 206
四、典型案例 206
五、STR分析個體基因型原理 206
六、DNA指紋技術的套用 207
第五節 核酸測序技術 207
一、核酸測序策略 208
二、鏈末端終止法 208
三、化學降解法 210
四、焦磷酸測序技術 211
五、其他測序技術 212
六、自動化測序技術 214
第六節 微型化分子診斷技術 216
一、微型晶片 217
二、DNA晶片技術 221
三、微毛細管電泳 226
四、微珠技術 227
五、可定址微陣列技術 236
六、生物感測器技術 237
第七節 DNA重組技術 238
一、工具酶 239
二、載體 242
三、DNA重組技術 244
第八節 染色體分析技術 257
一、染色體核型分析 257
二、分子細胞遺傳學技術 263
三、比較基因組雜交技術 267
四、光譜核型分析技術 269
五、無創DNA產前檢測技術 271
第九節 其他基因診斷技術 271
一、基因變異檢測技術 271
二、二維基因掃描技術 276
三、脈衝場凝膠電泳技術 276
四、分子影像技術 277
第二章 轉錄組學技術篇 282
第一節 轉錄組學概論 282
第二節 基於序列分析的轉錄組學技術 283
一、cDNA文庫隨機抽樣 283
二、大規模表達序列標籤測定及分析 283
三、基因表達系列分析 284
四、大規模平行標識測序 287
五、RNA測序 288
第三節 基於雜交的轉錄組學技術 289
一、差異顯示RT PCR及限制性酶切片段差異顯示 289
二、DNA微陣列和Tillingarray 289
第四節 小結 292
第三章 蛋白組學 293
第一節 蛋白質的分離技術 293
一、等電聚焦凝膠電泳技術 294
二、SDS 聚丙烯醯胺凝膠電泳 298
三、二維電泳圖像分析技術 301
四、蛋白質分離技術的發展 305
第二節 蛋白質的鑑定技術 308
一、生物質譜技術 308
二、Edman降解技術 320
三、蛋白質分子結構分析技術 321
第三節 蛋白質晶片技術 324
一、蛋白質晶片原理 324
二、蛋白質晶片技術 325
第四節 蛋白質核酸相互作用研究技術 328
一、凝膠阻滯實驗 328
二、DNAaseI足紋分析技術 330
三、酵母單雜交技術 331
四、染色質免疫沉澱技術 332
五、核酸適體技術 333
六、掃描探針顯微鏡技術 334
七、表面等離子共振技術和生物分子相互作用分析 336
第五節 蛋白質蛋白質相互作用研究技術 337
一、免疫共沉澱 337
二、酵母雙雜交技術 340
三、串聯親和純化技術 341
四、質譜技術 343
五、蛋白質晶片 344
六、生物信息分析 345
第四章 生物信息學 348
第一節 人類基因組計畫 348
一、人類基因組計畫的發展 348
二、人類基因組計畫研究內容 348
第二節 生物信息學 349
一、生物信息學的定義 349
二、生物信息學的研究內容 350
三、生物信息學資料庫 350
四、生物信息學的臨床套用 355
第三篇 分子診斷學的臨床套用
第一章 遺傳性疾病的分子診斷 383
第一節 分子診斷學相關的遺傳學諮詢和倫理學 383
一、遺傳諮詢 383
二、遺傳諮詢中的倫理問題 383
三、遺傳檢查中的倫理問題 384
第二節 遺傳性疾病分子診斷的策略 384
一、 直接診斷策略 384
二、基因多態性連鎖分析 385
三、基因突變的定量診斷 385
第三節 遺傳病的分子診斷 385
一、血液系統疾病 385
二、神經和神經肌肉疾病 392
三、內分泌疾病 396
四、囊性纖維化 402
五、脆性X綜合徵 404
第二章 感染性疾病的分子診斷 406
第一節 感染性疾病分子診斷的策略 406
一、一般性檢出策略和方法 406
二、完整檢出策略和方法 407
第二節 病毒感染的分子診斷 407
一、B型肝炎病毒的分子診斷 408
二、C型肝炎病毒的分子診斷 412
三、人乳頭瘤病毒的分子診斷 415
四、單純皰疹病毒的分子診斷 419
五、人類免疫缺陷病毒的分子診斷 420
六、EB病毒的分子診斷 424
第三節 病原菌基因的分子診斷 425
一、結核分枝桿菌的分子診斷 425
二、金黃色葡萄球菌 428
三、大腸埃希菌的分子診斷 432
四、流感嗜血桿菌的分子診斷 435
五、肺炎鏈球菌的分子診斷 436
六、腦膜炎奈瑟菌的分子診斷 438
七、銅綠假單胞菌的分子診斷 440
八、幽門螺桿菌的分子診斷 441
第四節 其他常見病原微生物的分子診斷 443
一、沙眼衣原體的分子診斷 443
二、解脲脲原體的分子診斷 445
三、梅毒螺旋體的分子診斷 447
四、肺炎支原體的分子診斷 448
第五節 院內感染的分子診斷 449
一、分子生物學技術在耐藥機制研究中的套用 449
二、分子生物技術在醫院感染控制中的套用 450
第三章 藥物遺傳學及耐藥性的分子診斷 453
第一節 藥物遺傳學 453
一、藥物遺傳學研究的現狀 453
二、人類基因組研究與藥物遺傳學的發展 454
第二節 耐藥性的分子機制 455
一、細菌的耐藥性機制 455
二、真菌的耐藥機制 456
三、病毒的耐藥機制 457
四、腫瘤耐藥的機制 458
第三節 耐藥性分子診斷的策略 459
一、基於測序技術的檢測方法 459
二、基於DNA擴增(polymerasechainreaction，PCR)的檢測方法 460
三、基於分子雜交技術的檢測方法 461
第四節 微生物的耐藥性分子診斷 461
一、結核分枝桿菌的耐藥性分子診斷 461
二、大腸埃希菌耐藥性分子診斷 466
三、耐甲氧西林金黃色葡萄球菌耐藥性分子診斷 468
四、B肝病毒耐藥性分子診斷 470
五、獲得性免疫缺陷病毒(HIV)耐藥性分子診斷 472
第五節 抗腫瘤藥物的耐藥性分子診斷 474
一、實時FQ PCR檢測乳腺癌MDR 1、MRP、LRP、GST π、Topo Ⅱ
多藥耐藥基因 475
二、RT PCR法檢測耐藥相關基因表達的測定 476
三、基因晶片檢測腫瘤患者多藥耐藥基因1(MDR 1)多態性 476
第六節 個體化醫療治療監控 478
第七節 基因治療安全性評估 479
第四章 腫瘤性疾病的分子診斷 482
第一節 腫瘤發生的分子機制和易感性 482
一、惡性腫瘤是一種分子病 482
二、腫瘤發生的分子機制 483
三、腫瘤發生的易感性 490
第二節 腫瘤分子診斷的策略 491
第三節 癌基因與抑癌基因的分子診斷途徑 492
一、染色體不穩定性分析 492
二、腫瘤易感基因的檢測 492
三、腫瘤基因多態性檢測 492
四、腫瘤相關基因蛋白質水平檢測 493
五、腫瘤相關基因擴增/過表達、突變/缺失的檢測 493
六、表觀遺傳修飾的檢測 494
七、染色體微衛星異常分析 495
八、端粒酶活性的檢測 496
九、基因表達圖譜研究 497
第四節 常用腫瘤的分子診斷 499
一、乳腺癌的分子診斷 499
二、膀胱癌的分子診斷 500
三、肺癌的分子診斷 501
四、消化系統惡性腫瘤的基因診斷 503
五、血液系統腫瘤的分子診斷 503
六、腫瘤早期篩查的分子診斷 509
七、腫瘤微小殘留病的分子診斷 510
第五章 複雜性疾病的分子診斷 513
第一節 複雜性疾病的分子診斷策略 513
一、複雜性疾病分子診斷的定義和原理 513
二、複雜性疾病分子診斷常用的檢測標本 514
三、分子診斷的常用方法與思路 514
第二節 常見疾病的分子診斷 515
一、糖尿病 515
二、高血壓 518
三、家族性高脂血症 522
四、腎小球腎炎 525
五、支氣管哮喘 528
第六章 產前(胚胎植入前)遺傳缺陷的分子診斷 531
第一節 染色體異常的分子診斷 531
一、分子細胞遺傳學方法 531
二、分子遺傳學方法 533
第二節 非整倍體篩選 534
一、人類染色體非整倍體的形成 534
二、胎兒染色體非整倍體類疾病的產前篩查及診斷 535
第三節 產前(胚胎植入前)遺傳缺陷的分子診斷的概述 535
一、胚胎植入前分子診斷的概念 535
二、胚胎植入前分子診斷的意義 535
三、胚胎植入前的技術操作 536
四、胚胎植入前分子診斷常用的方法 537
第四節 植入前遺傳診斷在一些遺傳病的套用 538
一、21三體綜合徵的植入前遺傳診斷 538
二、克氏綜合徵的植入前遺傳診斷 539
三、苯丙酮尿症的植入前遺傳診斷 539
四、脆性X染色體綜合徵的植入前遺傳診斷 539
五、地中海貧血的植入前遺傳診斷 542
六、馬凡綜合徵的植入前遺傳診斷 542
七、脊髓性肌萎縮症的植入前遺傳診斷 543
八、杜氏肌營養不良症的植入前遺傳診斷 544
第七章 移植配型的分子診斷 546
第一節 HLA遺傳學基礎 546
一、 HLA的研究簡史和命名 546
二、HLA複合體的遺傳結構和功能 547
三、HLA複合體的遺傳特徵 549
四、小結 550
第二節 組織配型中的DNA分型技術 551
一、聚合酶鏈反應限制性片段長度多態性 551
二、聚合酶鏈反應序列特異性寡核苷酸 552
三、PCR 序列特異性引物分型法 552
四、聚合酶鏈反應單鏈構象特異性 553
五、指紋圖譜技術 554
六、SBT PCR分型法 554
七、基因晶片 555
八、小結 555
第三節 HLA配型在器官移植中的套用 556
一、人紅細胞血型抗原相容 556
二、HLA配型 556
三、HLA交叉配型與預存抗體的檢測 557
四、HLA配型與不同的器官移植的相關性 558
五、小結 559
第八章 法醫學的分子診斷 560
第一節 DNA多態性 560
一、DNA多態性標記物 560
第二節 DNA分型技術與方法 564
一、DNA指紋技術 564
二、PCR技術 565
三、DNA晶片 566
第三節 DNA資料庫 566
一、DNA資料庫的概念 566
二、DNA資料庫的組成 566
三、DNA資料庫的國內外發展狀況 567
四、DNA資料庫的功能與套用 567
第四節 法醫DNA鑑定的套用範圍 569
一、種屬鑑定 569
二、性別鑑定 569
三、個人識別 569
四、親權鑑定 571
第九章 分子診斷實驗室的質量管理 574
第一節 全面質量管理體系的概念與建立 574
一、全面質量管理體系的概念 574
二、質量管理體系的建立 575
第二節 質量控制諸要素 576
一、設施與環境 576
二、檢驗方法、儀器及外部供應品 576
三、操作手冊 577
四、方法性能規格的建立和確認 577
五、儀器和檢測系統的維護和功能檢查 577
六、校準和校準驗證 577
七、室內質量控制 577
八、室間質量評價 580
九、糾正措施 581
十、質控記錄 581
第三節 統計學質量控制 581
一、理想的質控品 581
二、Levey Jennings質控圖 581
三、Westgard多規則質控方法 585
四、累計和(CUSUM)質控方法 586
五、質控規則的性能特徵 587
第四節 分析前、中、後質量保證 587
一、分析前質量保證 587
二、分析中質量保證 588
三、分析後的質量保證 589
第五節 實驗室認可和認證 590
一、實驗室認可 590
二、實驗室認證 590
三、實驗室認可與認證區別 591
參考文獻 592
前言
緒論 1
一、分子診斷學的定義 1
二、分子診斷學的發展簡史及主要技術 1
三、分子診斷學在醫學中的套用 5
四、分子診斷的套用前景展望 8
第一篇 分子診斷學理論基礎
第一章 基因組學 13
第一節 基因組學概論 13
一、基因 13
二、基因組 16
三、基因組學 16
四、基因組學的意義 17
第二節 原核生物基因組 21
一、原核生物基因組特點 21
二、原核生物基因組的類核結構 22
三、質粒 22
四、原核細胞的基因轉移 23
第三節 真核生物基因組 24
一、真核生物基因組的結構與功能 24
二、線粒體基因組 29
三、人類基因組研究 31
四、人類基因組多樣性 35
第四節 比較基因組學 38
一、比較基因組學研究原理 39
二、比較基因組學的幾個相關概念 39
三、比較基因組學的研究策略 40
四、比較基因組學在基因分析中的套用 41
五、比較基因組雜交技術在腫瘤研究中的套用 41
第五節 原核生物———微生物基因組 43
一、大腸埃希菌基因組學 44
二、流感嗜血桿菌基因組學 45
三、陰溝腸桿菌基因組學 46
四、鮑曼不動桿菌基因組學 47
五、肺炎鏈球菌基因組學 49
六、腦膜炎奈瑟菌基因組學 51
七、銅綠假單胞菌基因組學 52
八、結核分枝桿菌基因組學 53
九、幽門螺桿菌基因組學 53
十、衣原體基因組學 54
十一、肺炎支原體基因組學 56
第六節 原核生物———病毒基因組 57
一、病毒基因組學 58
二、B型肝炎病毒基因組學 59
三、C型肝炎病毒基因組學 61
四、HIV基因組學 62
五、人類乳頭瘤病毒基因組學 69
六、伊波拉病毒基因組學 71
七、SARS病毒基因組學 72
八、禽流感病毒基因組學 74
九、腸道病毒基因組學 75
十、單純皰疹病毒基因組學 77
十一、巨細胞病毒基因組 78
十二、EB病毒基因組學 79
十三、朊病毒基因組學 80
第二章 轉錄組學 82
第一節 基因表達的概念及特點 83
一、基因表達的概念 83
二、基因表達的時間性及空間性 83
三、基因表達的方式 83
第二節 轉錄作用及組成 84
一、轉錄作用及其特點 84
二、RNA聚合酶 84
三、啟動子及終止信號 85
四、增強子 86
五、終止信號 86
第三節 真核基因轉錄過程 87
一、 RNAPolⅡ的轉錄起始 87
二、延長 88
三、終止 88
第四節 轉錄後加工 88
一、mRNA前體的加工 89
二、tRNA前體的加工 91
三、rRNA前體的加工 91
第五節 真核生物基因表達的調控 91
一、染色體水平的調控 92
二、染色質水平調控 93
三、DNA水平的調控 95
四、轉錄水平的調控 96
五、轉錄起始和加工的調節 98
六、翻譯的調控 98
七、小分子RNA的調控 99
第三章 蛋白組學 102
第一節 蛋白組學概論 102
一、蛋白質組和蛋白質組學 102
二、蛋白組學研究的意義和內容 102
三、蛋白質組學的研究策略和一般步驟 103
第二節 蛋白質翻譯後修飾及功能確定 104
一、蛋白質翻譯後修飾的種類 105
二、蛋白質翻譯後修飾的作用 105
三、蛋白質修飾的蛋白組學研究 106
第三節 蛋白質與核酸間的相互作用 111
一、蛋白質與DNA僅Df啌C3僅的相互作用 111
二、蛋白質與RNA的相互作用 115
第四節 蛋白質與蛋白質間的相互作用 117
一、蛋白質相互作用研究的意義 117
二、蛋白質相互作用的分子結構基礎 118
第五節 蛋白質組學的套用 121
一、臨床蛋白質組學 121
二、藥物蛋白質組學 127
三、微生物蛋白質組學 129
四、毒理蛋白質組學 132
第四章 代謝組學 133
第一節 代謝物靶標分析 133
一、代謝物的生理作用 134
二、代謝物靶標分析 134
第二節 代謝輪廓(譜)分析 138
一、 高效液相色譜技術在代謝組學中的套用 139
二、毛細管HPLCMS代謝組學研究 140
三、UPLCMS的代謝組學研究 141
四、HPLC在代謝組學研究中的地位 141
第三節 代謝指紋分析 142
一、代謝指紋分析技術的進展 142
二、代謝指紋分析在代謝組學研究中的作用 144
第四節 代謝組學 144
第二篇 分子診斷學技術
第一章 基因組學 151
第一節 核酸的分離和純化 151
一、真核基因組DNA的分離純化 151
二、基因組DNA的提取 154
三、質粒DNA的提取與純化 156
四、真核細胞RNA的分離純化 166
第二節 核酸分子雜交技術 170
一、核酸雜交的基本原理 170
二、核酸探針 170
三、核酸探針的製備 172
四、探針的標記及檢測 173
五、核酸分子雜交技術 180
第三節 基因擴增檢驗技術 186
一、聚合酶鏈反應技術的原理 186
二、聚合酶鏈反應技術的設計及最佳化 187
三、聚合酶鏈反應技術的進展 194
四、螢光定量聚合酶鏈反應技術 197
五、有限稀釋法 204
第四節 DNA指紋技術 204
一、DNA指紋技術的原理 205
二、DNA指紋技術的優點 205
三、DNA指紋圖的遺傳規律 206
四、典型案例 206
五、STR分析個體基因型原理 206
六、DNA指紋技術的套用 207
第五節 核酸測序技術 207
一、核酸測序策略 208
二、鏈末端終止法 208
三、化學降解法 210
四、焦磷酸測序技術 211
五、其他測序技術 212
六、自動化測序技術 214
第六節 微型化分子診斷技術 216
一、微型晶片 217
二、DNA晶片技術 221
三、微毛細管電泳 226
四、微珠技術 227
五、可定址微陣列技術 236
六、生物感測器技術 237
第七節 DNA重組技術 238
一、工具酶 239
二、載體 242
三、DNA重組技術 244
第八節 染色體分析技術 257
一、染色體核型分析 257
二、分子細胞遺傳學技術 263
三、比較基因組雜交技術 267
四、光譜核型分析技術 269
五、無創DNA產前檢測技術 271
第九節 其他基因診斷技術 271
一、基因變異檢測技術 271
二、二維基因掃描技術 276
三、脈衝場凝膠電泳技術 276
四、分子影像技術 277
第二章 轉錄組學技術篇 282
第一節 轉錄組學概論 282
第二節 基於序列分析的轉錄組學技術 283
一、cDNA文庫隨機抽樣 283
二、大規模表達序列標籤測定及分析 283
三、基因表達系列分析 284
四、大規模平行標識測序 287
五、RNA測序 288
第三節 基於雜交的轉錄組學技術 289
一、差異顯示RT PCR及限制性酶切片段差異顯示 289
二、DNA微陣列和Tillingarray 289
第四節 小結 292
第三章 蛋白組學 293
第一節 蛋白質的分離技術 293
一、等電聚焦凝膠電泳技術 294
二、SDS 聚丙烯醯胺凝膠電泳 298
三、二維電泳圖像分析技術 301
四、蛋白質分離技術的發展 305
第二節 蛋白質的鑑定技術 308
一、生物質譜技術 308
二、Edman降解技術 320
三、蛋白質分子結構分析技術 321
第三節 蛋白質晶片技術 324
一、蛋白質晶片原理 324
二、蛋白質晶片技術 325
第四節 蛋白質核酸相互作用研究技術 328
一、凝膠阻滯實驗 328
二、DNAaseI足紋分析技術 330
三、酵母單雜交技術 331
四、染色質免疫沉澱技術 332
五、核酸適體技術 333
六、掃描探針顯微鏡技術 334
七、表面等離子共振技術和生物分子相互作用分析 336
第五節 蛋白質蛋白質相互作用研究技術 337
一、免疫共沉澱 337
二、酵母雙雜交技術 340
三、串聯親和純化技術 341
四、質譜技術 343
五、蛋白質晶片 344
六、生物信息分析 345
第四章 生物信息學 348
第一節 人類基因組計畫 348
一、人類基因組計畫的發展 348
二、人類基因組計畫研究內容 348
第二節 生物信息學 349
一、生物信息學的定義 349
二、生物信息學的研究內容 350
三、生物信息學資料庫 350
四、生物信息學的臨床套用 355
第三篇 分子診斷學的臨床套用
第一章 遺傳性疾病的分子診斷 383
第一節 分子診斷學相關的遺傳學諮詢和倫理學 383
一、遺傳諮詢 383
二、遺傳諮詢中的倫理問題 383
三、遺傳檢查中的倫理問題 384
第二節 遺傳性疾病分子診斷的策略 384
一、 直接診斷策略 384
二、基因多態性連鎖分析 385
三、基因突變的定量診斷 385
第三節 遺傳病的分子診斷 385
一、血液系統疾病 385
二、神經和神經肌肉疾病 392
三、內分泌疾病 396
四、囊性纖維化 402
五、脆性X綜合徵 404
第二章 感染性疾病的分子診斷 406
第一節 感染性疾病分子診斷的策略 406
一、一般性檢出策略和方法 406
二、完整檢出策略和方法 407
第二節 病毒感染的分子診斷 407
一、B型肝炎病毒的分子診斷 408
二、C型肝炎病毒的分子診斷 412
三、人乳頭瘤病毒的分子診斷 415
四、單純皰疹病毒的分子診斷 419
五、人類免疫缺陷病毒的分子診斷 420
六、EB病毒的分子診斷 424
第三節 病原菌基因的分子診斷 425
一、結核分枝桿菌的分子診斷 425
二、金黃色葡萄球菌 428
三、大腸埃希菌的分子診斷 432
四、流感嗜血桿菌的分子診斷 435
五、肺炎鏈球菌的分子診斷 436
六、腦膜炎奈瑟菌的分子診斷 438
七、銅綠假單胞菌的分子診斷 440
八、幽門螺桿菌的分子診斷 441
第四節 其他常見病原微生物的分子診斷 443
一、沙眼衣原體的分子診斷 443
二、解脲脲原體的分子診斷 445
三、梅毒螺旋體的分子診斷 447
四、肺炎支原體的分子診斷 448
第五節 院內感染的分子診斷 449
一、分子生物學技術在耐藥機制研究中的套用 449
二、分子生物技術在醫院感染控制中的套用 450
第三章 藥物遺傳學及耐藥性的分子診斷 453
第一節 藥物遺傳學 453
一、藥物遺傳學研究的現狀 453
二、人類基因組研究與藥物遺傳學的發展 454
第二節 耐藥性的分子機制 455
一、細菌的耐藥性機制 455
二、真菌的耐藥機制 456
三、病毒的耐藥機制 457
四、腫瘤耐藥的機制 458
第三節 耐藥性分子診斷的策略 459
一、基於測序技術的檢測方法 459
二、基於DNA擴增(polymerasechainreaction，PCR)的檢測方法 460
三、基於分子雜交技術的檢測方法 461
第四節 微生物的耐藥性分子診斷 461
一、結核分枝桿菌的耐藥性分子診斷 461
二、大腸埃希菌耐藥性分子診斷 466
三、耐甲氧西林金黃色葡萄球菌耐藥性分子診斷 468
四、B肝病毒耐藥性分子診斷 470
五、獲得性免疫缺陷病毒(HIV)耐藥性分子診斷 472
第五節 抗腫瘤藥物的耐藥性分子診斷 474
一、實時FQ PCR檢測乳腺癌MDR 1、MRP、LRP、GST π、Topo Ⅱ
多藥耐藥基因 475
二、RT PCR法檢測耐藥相關基因表達的測定 476
三、基因晶片檢測腫瘤患者多藥耐藥基因1(MDR 1)多態性 476
第六節 個體化醫療治療監控 478
第七節 基因治療安全性評估 479
第四章 腫瘤性疾病的分子診斷 482
第一節 腫瘤發生的分子機制和易感性 482
一、惡性腫瘤是一種分子病 482
二、腫瘤發生的分子機制 483
三、腫瘤發生的易感性 490
第二節 腫瘤分子診斷的策略 491
第三節 癌基因與抑癌基因的分子診斷途徑 492
一、染色體不穩定性分析 492
二、腫瘤易感基因的檢測 492
三、腫瘤基因多態性檢測 492
四、腫瘤相關基因蛋白質水平檢測 493
五、腫瘤相關基因擴增/過表達、突變/缺失的檢測 493
六、表觀遺傳修飾的檢測 494
七、染色體微衛星異常分析 495
八、端粒酶活性的檢測 496
九、基因表達圖譜研究 497
第四節 常用腫瘤的分子診斷 499
一、乳腺癌的分子診斷 499
二、膀胱癌的分子診斷 500
三、肺癌的分子診斷 501
四、消化系統惡性腫瘤的基因診斷 503
五、血液系統腫瘤的分子診斷 503
六、腫瘤早期篩查的分子診斷 509
七、腫瘤微小殘留病的分子診斷 510
第五章 複雜性疾病的分子診斷 513
第一節 複雜性疾病的分子診斷策略 513
一、複雜性疾病分子診斷的定義和原理 513
二、複雜性疾病分子診斷常用的檢測標本 514
三、分子診斷的常用方法與思路 514
第二節 常見疾病的分子診斷 515
一、糖尿病 515
二、高血壓 518
三、家族性高脂血症 522
四、腎小球腎炎 525
五、支氣管哮喘 528
第六章 產前(胚胎植入前)遺傳缺陷的分子診斷 531
第一節 染色體異常的分子診斷 531
一、分子細胞遺傳學方法 531
二、分子遺傳學方法 533
第二節 非整倍體篩選 534
一、人類染色體非整倍體的形成 534
二、胎兒染色體非整倍體類疾病的產前篩查及診斷 535
第三節 產前(胚胎植入前)遺傳缺陷的分子診斷的概述 535
一、胚胎植入前分子診斷的概念 535
二、胚胎植入前分子診斷的意義 535
三、胚胎植入前的技術操作 536
四、胚胎植入前分子診斷常用的方法 537
第四節 植入前遺傳診斷在一些遺傳病的套用 538
一、21三體綜合徵的植入前遺傳診斷 538
二、克氏綜合徵的植入前遺傳診斷 539
三、苯丙酮尿症的植入前遺傳診斷 539
四、脆性X染色體綜合徵的植入前遺傳診斷 539
五、地中海貧血的植入前遺傳診斷 542
六、馬凡綜合徵的植入前遺傳診斷 542
七、脊髓性肌萎縮症的植入前遺傳診斷 543
八、杜氏肌營養不良症的植入前遺傳診斷 544
第七章 移植配型的分子診斷 546
第一節 HLA遺傳學基礎 546
一、 HLA的研究簡史和命名 546
二、HLA複合體的遺傳結構和功能 547
三、HLA複合體的遺傳特徵 549
四、小結 550
第二節 組織配型中的DNA分型技術 551
一、聚合酶鏈反應限制性片段長度多態性 551
二、聚合酶鏈反應序列特異性寡核苷酸 552
三、PCR 序列特異性引物分型法 552
四、聚合酶鏈反應單鏈構象特異性 553
五、指紋圖譜技術 554
六、SBT PCR分型法 554
七、基因晶片 555
八、小結 555
第三節 HLA配型在器官移植中的套用 556
一、人紅細胞血型抗原相容 556
二、HLA配型 556
三、HLA交叉配型與預存抗體的檢測 557
四、HLA配型與不同的器官移植的相關性 558
五、小結 559
第八章 法醫學的分子診斷 560
第一節 DNA多態性 560
一、DNA多態性標記物 560
第二節 DNA分型技術與方法 564
一、DNA指紋技術 564
二、PCR技術 565
三、DNA晶片 566
第三節 DNA資料庫 566
一、DNA資料庫的概念 566
二、DNA資料庫的組成 566
三、DNA資料庫的國內外發展狀況 567
四、DNA資料庫的功能與套用 567
第四節 法醫DNA鑑定的套用範圍 569
一、種屬鑑定 569
二、性別鑑定 569
三、個人識別 569
四、親權鑑定 571
第九章 分子診斷實驗室的質量管理 574
第一節 全面質量管理體系的概念與建立 574
一、全面質量管理體系的概念 574
二、質量管理體系的建立 575
第二節 質量控制諸要素 576
一、設施與環境 576
二、檢驗方法、儀器及外部供應品 576
三、操作手冊 577
四、方法性能規格的建立和確認 577
五、儀器和檢測系統的維護和功能檢查 577
六、校準和校準驗證 577
七、室內質量控制 577
八、室間質量評價 580
九、糾正措施 581
十、質控記錄 581
第三節 統計學質量控制 581
一、理想的質控品 581
二、Levey Jennings質控圖 581
三、Westgard多規則質控方法 585
四、累計和(CUSUM)質控方法 586
五、質控規則的性能特徵 587
第四節 分析前、中、後質量保證 587
一、分析前質量保證 587
二、分析中質量保證 588
三、分析後的質量保證 589
第五節 實驗室認可和認證 590
一、實驗室認可 590
二、實驗室認證 590
三、實驗室認可與認證區別 591
參考文獻 592
