昭靈宮為仿古宮殿式石構，殿的四面水、屋架石拱、圭斗、雲土、雲草、柱珠盤等均用花崗岩精雕細刻。宮內供奉著 “媽祖”金身塑像，
媽祖像安然端坐，左邊供奉著媽祖父母像，右邊也有一尊小的媽祖像，是用於出遊的。千里眼、順風耳兩部將左右相隨。宮的石柱上的聯語： “故家喬木揚千古，深谷猗蘭翠萬年”、“欽命代天安四海，龍華盛會統九山”。宮的牆壁上貼有由古到今的24位歷代帝王的人物壁畫，這個在各地媽祖宮廟內並不多見。
據載：聖母芳名林默娘與南渚林開族始祖杭公都是唐代“九牧”（
葦、
藻、
著、
薦、
曄、
蘊、
蒙、
邁、
茛）之後第七代後裔，故南渚對媽祖有祖姑之尊稱。
