聯盟通過制定統一的野外監測指標體系、技術標準和規範，開展長期濕地生態系統結構與功能的研究，主要包括以下幾個研究方面：
（1）濕地生態系統結構研究：研究濕地生物組成特點、多樣性、功能特徵以及生物間的相互作用
（2）環境變遷對濕地的作用機理研究：研究包括生境破碎化、富營養化、酸化、有毒有害物質污染對濕地系統的生態學作用機理、生態回響機理及防治技術；
（3）受損濕地系統生態功能修復研究：研究受人類活動干擾劇烈的濕地系統在物種保護、水質淨化、涵養水源、服務功能提升等方面的修復機理與技術；
（4）自然濕地保護生態學研究：探討自然濕地在維持區域生態系統功能方面的作用、監測與評價自然濕地的綜合生態服務功能。
基於上述主要研究方向，通過長期定位觀測和研究，揭示濕地生態系統的結構與功能規律，探索濕地的科學價值和社會意義，特別是在生態文明建設中的作用，為國家、部門建設野外台站、支持基於野外站的研究項目提供決策依據。
