DBSCAN

DBSCAN

DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)是一個比較有代表性的基於密度的聚類算法。與劃分和層次聚類方法不同,它將簇定義為密度相連的點的最大集合,能夠把具有足夠高密度的區域劃分為簇,並可在噪聲的空間資料庫中發現任意形狀的聚類。

基本介紹

  • 中文名聚類算法
  • 外文名:Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise 
  • 簡稱:DBSCAN
  • 性質:有代表性的基於密度的聚類算法
概念,描述,步驟,偽碼,好處,缺點,參考,

概念

DBSCAN中的幾個定義:
Ε鄰域:給定對象半徑為Ε內的區域稱為該對象的Ε鄰域;
核心對象:如果給定對象Ε鄰域內的樣本點數大於等於MinPts,則稱該對象為核心對象;
直接密度可達:對於樣本集合D,如果樣本點q在p的Ε鄰域內,並且p為核心對象,那么對象q從對象p直接密度可達。
密度可達:對於樣本集合D,給定一串樣本點p1,p2….pn,p= p1,q= pn,假如對象pi從pi-1直接密度可達,那么對象q從對象p密度可達。
密度相連:存在樣本集合D中的一點o,如果對象o到對象p和對象q都是密度可達的,那么p和q密度相聯。
可以發現,密度可達是直接密度可達的傳遞閉包,並且這種關係是非對稱的。密度相連是對稱關係。DBSCAN目的是找到密度相連對象的最大集合。
Eg: 假設半徑Ε=3,MinPts=3,點p的E鄰域中有點{m,p,p1,p2,o}, 點m的E鄰域中有點{m,q,p,m1,m2},點q的E鄰域中有點{q,m},點o的E鄰域中有點{o,p,s},點s的E鄰域中有點{o,s,s1}.
那么核心對象有p,m,o,s(q不是核心對象,因為它對應的E鄰域中點數量等於2,小於MinPts=3);
點m從點p直接密度可達,因為m在p的E鄰域內,並且p為核心對象;
點q從點p密度可達,因為點q從點m直接密度可達,並且點m從點p直接密度可達;
點q到點s密度相連,因為點q從點p密度可達,並且s從點p密度可達。

描述

DBSCAN算法描述:
DBSCAN
輸入: 包含n個對象的資料庫,半徑e,最少數目MinPts;
輸出:所有生成的簇,達到密度要求。
(1)Repeat
(2)從資料庫中抽出一個未處理的點;
(3)IF抽出的點是核心點 THEN 找出所有從該點密度可達的對象,形成一個簇;
(4)ELSE 抽出的點是邊緣點(非核心對象),跳出本次循環,尋找下一個點;
(5)UNTIL 所有的點都被處理。
DBSCAN對用戶定義的參數很敏感,細微的不同都可能導致差別很大的結果,而參數的選擇無規律可循,只能靠經驗確定。

步驟

DBScan需要二個參數: 掃描半徑 (eps)和最小包含點數(minPts)。 任選一個未被訪問(unvisited)的點開始,找出與其距離在eps之內(包括eps)的所有附近點。
如果 附近點的數量 ≥ minPts,則當前點與其附近點形成一個簇,並且出發點被標記為已訪問(visited)。 然後遞歸,以相同的方法處理該簇內所有未被標記為已訪問(visited)的點,從而對簇進行擴展。
如果 附近點的數量 < minPts,則該點暫時被標記作為噪聲點。
如果簇充分地被擴展,即簇內的所有點被標記為已訪問,然後用同樣的算法去處理未被訪問的點。

偽碼

具體算法描述如下:
(1)檢測資料庫中尚未檢查過的對象p,如果p未被處理(歸為某個簇或者標記為噪聲),則檢查其鄰域,若包含的對象數不小於minPts,建立新簇C,將其中的所有點加入候選集N
(2)對候選集N 中所有尚未被處理的對象q,檢查其鄰域,若至少包含minPts個對象,則將這些對象加入N;如果q 未歸入任何一個簇,則將q 加入C
(3)重複步驟2),繼續檢查N 中未處理的對象,當前候選集N為空
(4)重複步驟1)~3),直到所有對象都歸入了某個簇或標記為噪聲。
偽代碼描述如下:
輸入:數據對象集合D,半徑Eps,密度閾值MinPts
輸出:聚類C
DBSCAN(D, Eps, MinPts)
Begin
init C=0; //初始化簇的個數為0
for each unvisited point p in D
mark p as visited; //將p標記為已訪問
N = getNeighbours (p, Eps);
if sizeOf(N) < MinPts then
mark p as Noise; //如果滿足sizeOf(N) < MinPts,則將p標記為噪聲
else
C= next cluster; //建立新簇C
ExpandCluster (p, N, C, Eps, MinPts);
end if
end for
End
其中ExpandCluster算法偽碼如下:
ExpandCluster(p, N, C, Eps, MinPts)
add p to cluster C; //首先將核心點加入C
for each unvisited point p’ in N
mark p' as visited;
N’ = getNeighbours (p’, Eps); //對N鄰域內的所有點在進行半徑檢查
if sizeOf(N’) >= MinPts then
N = N+N’; //如果大於MinPts,就擴展N的數目
end if
if p’ is not member of any cluster
add p’ to cluster C; //將p' 加入簇C
end if
end for
End ExpandCluster

好處

1. 與K-means方法相比,DBSCAN不需要事先知道要形成的簇類的數量。
2. 與K-means方法相比,DBSCAN可以發現任意形狀的簇類。
3. 同時,DBSCAN能夠識別出噪聲點。
4.DBSCAN對於資料庫中樣本的順序不敏感,即Pattern的輸入順序對結果的影響不大。但是,對於處於簇類之間邊界樣本,可能會根據哪個簇類優先被探測到而其歸屬有所擺動。

缺點

1. DBScan不能很好反映高維數據。
2. DBScan不能很好反映數據集以變化的密度。
3.如果樣本集的密度不均勻、聚類間距差相差很大時,聚類質量較差。

參考

“一種基於密度的算法為在大空間資料庫發現群以噪聲”。第2次國際會議記錄關於KDD的AAAI Press。 檢索2007-10-15.“實驗在平行成群與DBSCAN”。歐洲同水準2001年:並行處理: 第7國際歐洲同水準會議曼徹斯特,英國2001年8月28-31,行動Springer柏林。 檢索2004-02-19.

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