黃維妮，女，博士，中山大學生命科學學院教授、博士生導師。
基本介紹
- 中文名：黃維妮
- 畢業院校：德國國家研究所
- 學位/學歷：博士
- 專業方向：計算生物學
- 任職院校：中山大學
研究方向,人物經歷,講授課程,學術成果,承擔課題,論文專著,
研究方向
通過計算生物學和進化生物學的方法，運用計算機模擬，數學模型，研究不同生物系統中的種群動態及套用。主要研究課題：1.生物多樣性維持機制 2.物種的協同進化 3.癌症進化4.最最佳化癌症治療方案研究。拓展領域：計算生物學及實驗的結合
人物經歷
2001-2008北京師範大學 信息系統本科/英語雙學士/生態學碩士
2008-2012 德國馬克思普朗克（德國國家研究所）進化生物學研究所，計算生物學博士（方向：生物多樣性維持機制模型）
2017-中山大學生命科學學院，計算生物學與進化生物學研究組,博士生導師
講授課程
微分方程
學術成果
承擔課題
物種間的協同進化 （coevolution）
物種的協同進化是生物系統的一個核心內容，例如宿主與寄生蟲關係，植物與病原體關係，捕食者與獵物的關係。本課題組以輪蟲（Rotifer）和綠藻（Algae），及螢光菌（Pseudomonas Fluorescens）和纖毛蟲（Ciliate）為例，研究物種協同進化下的生物多樣性水平。
對數學建模有興趣的同學，鼓勵開展物種協同進化模型的研究，將會用到基本的大學數學分析及計算機編程。對微生物系統進化實驗有興趣的同學，將到在黃維妮及德國進化實驗學家Lutz Becks的共同指導下，進行協同進化實驗的研究。由黃維妮團隊和Lutz Becks合作的第一項成果目前已發表在Nature Communications接收。Lutz Becks實驗室在Nature，Ecology Letters，Nature Communications等前沿科研期刊上發表多篇文章，實驗技術成熟，設計新穎，並將與黃維妮團隊有長期合作。
癌症進化模型（cancer evolution modeling）
癌症的產生和發展是一個經典的進化過程。隨著第二代基因測序的發展和套用，越來越多的科研數據表明，單個病人的個體腫瘤內具有高度的遺傳多樣性。由於實際操作的難度，大部分數據都採集於病人在單個時間點上的樣品，從而難以對腫瘤隨時間的發生和變化進行深刻的分析解釋，降低了科研結果對腫瘤治療的套用性。通過對腫瘤的生長過程進行數學建模和計算機模擬，結合實際數據分析，本團隊對個體腫瘤內遺傳多樣性產生機制及生長速率更高的腫瘤小種群（subclones）的識別方法進行研究。本方向目前主要方法是進行計算機模擬，歡迎感興趣的科研人員和同學加入；近兩年，將需要腫瘤全基因組，外顯子測序實驗、細胞系（cell line）培養的專職實驗人員。
本團隊在癌症進化研究中，理論方面將與英國國家癌症研究所（ICR）的Benjamin Werner博士（癌症進化學，理論物理學方向，代表論文Williams，Werner，et al., Nature Genetics, 2016, 2018; Werner et al., Elife, 2015; Werner et al., Cancer Research, 2014,2016等）共同指導學生。實驗方面將與英國巴斯癌症研究所的實驗及臨床科研人員合作。
論文專著
代表期刊論文：
W. Huang*, A. Traulsen, B. Werner, T. Hiltunen, L. Becks, 2017. Dynamical trade-offs arise
from antagonistic coevolution and decrease intraspecific diversity. Nature Communications,8:2059.
A. Baker, W. Huang, et al., 2017. Robust RNA-based in situ mutation detection delineates
colorectal cancer subclonal evolution. Nature Communications, 8:1998.
W. Huang*, P. R. A. Campos*, V. M. de Oliveira, F. F. Ferreira*, 2016. A resource-based
game theoretical approach for the paradox of the plankton. PeerJ , 4:e2329.
W. Huang, C. Hauert, A. Traulsen, 2015. Stochastic game dynamics under demographic
fluctuations. PNAS, 112:9064-9069.
W. Huang, B. Werner, A. Traulsen, 2012. The impact of random frequency-dependent
mutations on the average fitness. BMC Evolutionary Biology, 12:160.
W. Huang, B. Haubold, C. Hauert, A. Traulsen, 2012. Emergence of stable polymorphisms
driven by evolutionary games between mutants. Nature Communications, 3:919.
W. Huang, A. Traulsen, 2010. Fixation probabilities of random mutants under frequency
dependent selection. Journal of Theoretical Biology, 263(2):262268.
