骷髏隊（日文︰スカル団だん，英文︰Team Skull）是太陽/月亮中出現的在阿羅拉地區專給人們找麻煩的流氓組織。
骷髏隊會搶奪他人的寶可夢和在考驗的地方鬧事等，作出各種各樣的惡行。
介紹
在遊戲裡，骷髏隊手下自稱整個骷髏隊都是一群沒有完成諸島巡禮的訓練家組成的。
骷髏隊第一次出現在好奧樂市。他們準備在城市鬧事，主角需要和伊利馬一起對抗骷髏隊。
他們藝後再次出現在樹果園，他們正在搶一位老人的樹果。在主角打敗他們之後，他們會迅速離開。
骷髏隊的隊員多次在諸島巡禮時阻礙主角，但是因為太弱，反而不被任何人關注。
主角在馬利埃靜市第一次遇到古茲馬，得知古茲馬非常敵視庫庫伊博士，並稱庫庫伊博士也是個當不上隊長的傢伙。庫庫伊博士反駁道自己只是沒有精力去做一名隊長，後主角受到了古茲馬的挑釁，在對戰後古茲馬一陣歇斯底里的離開了。
在旅行過程中主角會多次與大姐頭布爾美麗交戰，也因此得知了一些骷髏隊的秘密。
在進行完超值超市舊址的考驗後，以太之家的貓鼬少“少少”會被骷髏隊劫持，主角前往魄鎮的可疑宅邸與古茲馬再度對戰。尋回“少少”後，主角一行卻發現這其實是以太基金會的圈套，真正的目的是讓骷髏隊帶走莉莉艾。
以太基金會僱傭骷髏隊搶走了莉莉艾和科斯莫古，而骷髏隊在以太樂園也阻止主角前往莉莉艾所在之處。在露莎米奈利用科斯莫古打開究極空間後，古茲馬與露莎米奈一起前往了究極空間。
在後來波尼古道遇到布爾美麗時，她會告訴主角古茲馬喜歡露莎米奈，因為古茲馬認為露莎米奈是唯一賞識他才能的大人。
在究極空間中，古茲馬被露莎米奈的瘋狂和到處都是的虛吾伊德嚇到了。
在事件過後，古茲馬解散了骷髏隊，大部分的骷髏隊成員選擇了自謀生路。
