郭峰彪

郭峰彪

博士,教授,博導,1979年10月出生,06年1月至今在電子科技大學工作。專業為生物信息學,目前研究方向為原核生物基因組分析及基因預測,主持一項國家自然科學基金,一項教育部博士點新教師課題及一項四川省科技廳套用基礎研究課題。

基本介紹

  • 中文名:郭鋒彪
  • 出生日期:1979年10月
  • 職業:教授
  • 性別:男
郭鋒彪教授簡介,學術簡介,獎勵榮譽,主持項目,代表性論文,

郭鋒彪教授簡介

教授課程:數據挖掘,生物信息學,基因組信息學(研究生課程)
學科方向: 生物信息學專業,方向為原核生物基因組分析及基因預測
教育背景:
1996年9月-2000年7月,天津大學套用物理系套用物理專業,獲理學學士;
2000年9月-2003年1月,天津大學理學院生物信息中心(Tubic),獲理學碩士;
2003年3月-2006年1月,天津大學理學院生物信息中心(Tubic),獲理學博士
工作經歷:
2006年1月-2008年8月,電子科技大學生命科學與技術學院,講師
2008年9月-至今,電子科技大學生命科學與技術學院,副教授
2011年9月,入選國家首批“香江學者計畫"

學術簡介

2000年9月至2006年1月在天津大學張春霆院士指導下攻讀生物信息學博士學位。曾獲得第七屆談家楨生命科學獎學金一等獎、第二屆天津大學學生科學獎和2008年全國優秀博士學位論文提名論文獎。至今已在Nucleic Acids Research,BMC Bioinformatics,BMC Genomics,DNA Research等雜誌發表SCI論文11篇,累計影響因子超過40點。這些論文和相關的軟體共被他引90多次,包括權威的Cell,Nature Methods,PLoS Biology,Journal of Virology等期刊。一篇第一作者的論文入選‘Faculty of 1000’論文。作為核心力量開發多個細菌、古細菌及病毒基因識別軟體,其中ZCURVE 1.0軟體擁有70多家註冊用戶(主要為國外)。

獎勵榮譽

2003年,獲得第二屆天津大學學生科學獎,天津大學
2004年,獲得第七屆談家楨生命科學獎學金一等獎,復旦大學及杭州九源基因公司
2008年,獲得全國優秀博士學位論文提名獎,教育部

主持項目

國家自然科學基金青年基金,60801058,2009-2011
教育部博士點基金新教師課題,20070614011,2008-2010
四川省科技廳套用基礎研究課題,2008JY0053,2008-2009

代表性論文

16. Guo FB*, Ye YN, Zhao HL, Lin D, Wei W. (2012) Universal pattern and diverse strengths of successive synonymous codon bias in three domains of life, particularly among prokaryotic genomes.] DNA Res.i] [Epub ahead of print]. [Full Text]
15. Guo FB. (2012) Replicating strand asymmetry in bacterial and eukaryotic genomes. ]Curr Genomics.i] 13(1):2-3. [Full Text]
14. Guo FB*, Wei W. (2012) Prediction of genomic islands in three bacterial pathogens of pneumonia.] Int J Mol Sci.i] 48:416-421. [Full Text]
13. Guo FB*, Wei W, Wang XL, Lin H, Ding H, Huang J, Rao N. (2012) Co-evolution of genomic islands and their bacterial hosts revealed through phylogenetic analyses of 17 groups of homologous genomic islands. ]Genet Mol Res.i] 11(4):3735-43. [Full Text]
12. Tong H, Guo FB*, Ye YN. (2011) Automatic prediction of non-coding RNA genes in prokaryotes based on compositional statistics.]Indian J Biochem Bio.i] 48:416-421. [Full Text]
11. Ning L, Guo FB*. (2011) Theoretical analyses of gene expression for five human pathogens.] Afr J Microbiol Res.i] 5:4071-4079.[Full Text]
10. Wei W, Guo FB*. (2011) Prediction of genomic islands in seven human pathogens using the Z-Island method. ]Genet Mol Res.i]10:2307-15. [PUBMED] [Full Text]
9. Du MZ, Guo FB*, Chen YY. (2011) Gene re-annotation in genome of the extremophile Pyrobaculum aerophilum by using bioinformatics methods.] J Biomol Struct Dyn.i] 29:391-401. [PUBMED] [Full Text]
8. Wei W, Guo FB*. (2010) Strong strand composition bias in the genome of ]Ehrlichia canisi] revealed by Multiple Methods.] Open Microbiol J.i] 21:98-102. [PUBMED] [Full Text]
7. Guo FB*, Ning LW, Huang J, Lin H, Zhang HX. (2010) Chromosome translocation and its consequence in the genome of]Burkholderia cenocepacia i]AU-1054. ]Biochem Biophys Res Commun.i] 403: 375-9. [PUBMED] [Full Text]
6. Guo FB*, Lin H, Huang J. (2009) A plot of G+C content against sequence length of 640 bacterial chromosomes shows the points are widely scattered in the upper triangular area. ]Chromosome Res.i] 17:359-64. [PUBMED] [Full Text]
5. Guo FB* , Yuan JB. (2009) Codon usages of genes on chromosome, and surprisingly, genes in plasmid are primarily affected by strand-specific mutational biases in ]Lawsonia intracellularisi]. ]DNA Resi]. 16:91-104. [PUBMED] [Full Text]
4. Guo FB* , Lin Y. (2009) Identify protein-coding genes in the genomes of ]Aeropyrum pernixi] K1 and ]Chlorobium tepidumi] TLS. ]J Biomol Struct Dyn.i] 26:413-20. [PUBMED] [Full Text]
3. Guo FB*, Yu XJ. (2007) Separate base usages of genes located on the leading and lagging strands in ]Chlamydia muridarumi]revealed by the Z curve method. ]BMC Genomics.i] 8:366. [PUBMED] [Full Text]
2. Guo FB*, Yu XJ. (2007) Re-prediction of protein-coding genes in the genome of ]Amsacta moorei entomopoxvirusi]. ]J Virol Methodsi]. 146:389-392. [PUBMED] [Full Text]
1. Guo FB* (2007) The distribution patterns of bases of protein-coding genes, non-coding ORFs, and intergenic sequences in]Pseudomonas aeruginosa i]PA01 genome and its implications. ]J Biomol Struct Dyn.i] 25:127-133. [PUBMED] [Full Text]

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