計算機分子生物學

計算機分子生物學

分子生物學是結合遺傳學、微生物學、細胞學以及生物物理學等學科的一門前沿科學,近十幾年來,取得了輝煌的成果,得到了大量的生物大分子信息數據。隨著研究的深入,對這些數據的管理和分析顯得尤為重要。幸好計算機的發展和分子生物學的發展幾乎同步進行。

基本介紹

  • 中文名:計算機分子生物學
  • 外文名:Computer molecular biology
  • 套用領域:分子生物學
  • 目的:從分子水平揭示生命的本質規律
簡介,發展,成就舉例,核酸序列資料庫,蛋白分析資料庫,染色體圖譜資料庫,

簡介

分子生物學是結合遺傳學、微生物學、細胞學以及生物物理學等學科的一門前沿科學,其是一門嶄新的學科,帶動了整個生命科學的發展,分子生物學作為生命科學的重要分支學科,在環境污染的治理,在中藥科學領域,以及生物科學領域都有舉足輕重的地位。
分子生物學是從分子水平揭示生命的本質規律,近十幾年來,取得了輝煌的成果,得到了大量的生物大分子信息數據。隨著研究的深入,對這些數據的管理和分析顯得尤為重要,傳統的手工處理已經無法勝任,幸好計算機的發展和分子生物學的發展幾乎同步進行。人們利用計算機具有信息量大、運算精準、迅速等特點在逐步解決大量的數據分析處理問題,建立了核酸、蛋白序列資料庫、開發了許多優秀的套用軟體,並取得了一些重要結論。

發展

計算機科學的發展給分子生物學從立項到論文寫作提供了一系列的軟體工具。人類基因組計畫與計算機科學交匯,產生了一門新興的邊緣科學——生物信息學,其發展更是給生物信息的獲取、檢索及處理帶來了巨大的便利。近年來,晶片技術與生物技術結合而產生了“生物晶片”,它大大的加快了試驗的進程。試驗數據的處理成為研究進展的瓶頸,而計算機科學將會在這個領域發揮重要作用。

成就舉例

核酸序列資料庫

包括基因組ONA序列、CDNA序列、RNA序列,1980年由美國國立基礎醫學研究院和U.S.Department of Energy發起,加州大學LANL實驗室負責,收集整理、Inteui Genetics 負責發起建立起核酸序列資料庫(GENBANK),幾乎同時歐洲分子生物學實驗室也著手建立核酸序列資料庫,不就日本也建立了DNA序列資料庫,後來這幾家達成協定,開始合作,協調分工,並實行數據交換。他們收集所有發去的核酸序列及其註解,加以整理入庫。到1991年8月,GENBANK已收集DNA序列51418個,建庫以來,每年收集的數據呈指數增加。

蛋白分析資料庫

包括蛋白質和多肽胺基酸序列及空間結構參數。由PIR-international和SWISS-PROT收集整理和發行。蛋白質資料庫和核酸資料庫有一個非常重要的區別,即核酸資料庫只是指核酸一級結構上的序列,而蛋白質資料庫除了包括一級結構的胺基酸序列外,還包括X-ray數據級可能的原子空間結構數據,蛋白質資料庫內容隨著時間增長呈指數增加。

染色體圖譜資料庫

它是利用了標記做出的整個基因組的連鎖圖譜,具有很高的套用價值,也是進行整個基因組序列分析的前哨工作。對每一種生物,都有大量的圖譜數據,只有用過計算機建庫才能做到合適的分析和充分的利用。

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