教育部磷資源綜合利用與清潔加工工程研究中心於2006年由教育部批准建設，依託四川大學化學工程與技術國家重點一級學科，在“創新、產業化”方針指引下，以市場為導向，通過項目的工程化開發加速磷化工技術成果的轉化，建設形成了國內最大、有國際影響的磷資源綜合利用基礎研究、工程開發中心，以及我國最大的磷化學與工程學專業人才培養基地。
磷資源綜合利用與清潔加工教育部工程研究中心擁有一支科研創新能力強、工程技術經驗豐富的高水平研發隊伍。中心擁有教授12名，研究員3名，高級工程師15名，在讀博士生19人，在讀碩士生104人，在讀工程碩士27人。
磷資源綜合利用與清潔加工教育部工程研究中心自建立以來，無論在研究項目、研究領域和方向、研究層次方面都取得了明顯的進展，取得了一批重要的基礎研究和技術創新成果。近5年來承擔國家863計畫課題1項、國家支撐計畫3項、國家科技攻關計畫1項、國家自然科學基金5項，其它項目32項。在磷化工相關領域承擔政府重大科技計畫項目契約資金總額為1655萬元，承擔產學研項目契約資金總額為19021萬元。獲得省部級科技發明和科技進步一等獎1項，省部級科技進步二等獎3項。共發表的文章220餘篇，其中SCI收錄82篇，EI收錄41篇。獲國家發明專利授權39項。
磷資源綜合利用與清潔加工教育部工程研究中心在未來發展中，實驗室在繼續保持磷化工研究優勢的基礎上，進一步強化基礎研究和技術創新能力，重點加強高端磷酸鹽生產工藝研究、新的磷礦加工工藝與低品位磷資源利用研究、磷石膏的綜合利用技術和可控緩釋包裹複合肥的製造技術研究，積極培育和發展新的學科增長點，在更高的起點上引領和支撐我國磷化工領域的科學創新和產業發展。
