生物信息學中計算機技術套用結合計算機圖形圖像處理、模式識別、數據挖掘等技術，利用當前關於蛋白質結構研究的最新成果，討論蛋白質三維結構比較中兼顧全局比較與部分比較的關鍵問題，有效解決了蛋白質三維結構的多層次比較。內容包括蛋白質三維結構的可視化、蛋白質三維結構統一坐標系的建立、統一坐標系下蛋白質結構頻譜建立、基於灰色關聯的蛋白質三維結構相似性算法研究以及蛋白質三維結構空間複雜性的分形研究。
基本介紹
圖書目錄
第1章 緒論
1.1 引言
1.2 生物信息學
1.3 生物信息學中的計算機技術套用
1.4 蛋白質結構模型
1.5 生物系統背景知識
1.6 本書研究的內容
1.7 本書的組織結構
1.8 本章小結
第2章 生物信息學中的結構比較
2.1 結構比對（Structure Alignment）
2.2 VAST與DALI
2.3 全局與局部結構比較
2.4 利用數學記號進行結構比較
2.5 生物大分子表面結構的比較
2.6 本章小結
第3章 三維結構比較
3.1 三維結構比較研究
3.2 基於體模型的比較
3.3 基於三維模型幾何相似性的比較
3.3.1 基於輪廓的幾何相似性比較算法
3.4 三維模型相似性度量方法的分類
3.5 本章小結
第4章 蛋白質三維結構可視化
4.1 蛋白質存儲結構分析
4.2 PDB檔案中對於大分子結構的描述
4.3 MATLAB下蛋白質三維結構可視化實現
4.4 本章小結
第5章 建立蛋白質三維結構頻譜
5.1 三維物體形狀特徵提取
5.2 統一坐標系的建立
5.3 小波分析
5.4 基於蛋白質碳原子距離的多分辨頻譜建立
5.5 基於統一坐標序列的蛋白質三維結構多分辨頻譜建立
5.6 本章小結
第6章 蛋白質三維結構相似性
6.1 三維模型相似性比較
6.2 灰色系統理論概述
6.3 蛋白質三維結構相似性的灰色關聯分析
6.4 蛋白質三維結構頻譜的灰色關聯分析
6.5 本章小結
第7章 蛋白質三維結構空間複雜性
7.1 生物學中的分形[Den06]
7.2 分形的概述
7.3 基於分形的蛋白質三維空間結構複雜性研究
7.4 基於結構頻譜分維的蛋白質三維結構相似性比較
7.5 本章小結
第8章 蛋白質三維結構視圖系統
8.1 系統框架
8.2 系統功能
8.3 本章小結
後記
一、相關研究
二、有關蛋白質三維結構預測的研究
參考文獻
