《浴火銀河2-瓦爾基里》帶有新的故事劇情，主人公Keith T. Maxwell這回將與狡猾多詐的敵人對決。由於一個有重要影響力的科學家被綁架，以及一件採用高端科技的嶄新產品原型被偷走，故此Keith要與 Deep Science的科學家攜手合作，以防銀河落入卑鄙之徒的手上。在被武器販賣家Alice操縱的Valkyrie太空站上，Keith悉破了一個重大的陰謀，使他的性命危在旦夕。突如期來的峰迴路轉，及最後的一決雌雄，更將銀河上的安全及自由押上賭注
解決掉Void以後，主角突然收到了一個神秘來電要求主角去偷一架還在試驗的Vossk戰機，報酬是15萬。偷回來那架戰機以後主角被帶到瓦爾基里太空站幫忙測試一個炮台以及Liberator核彈。這核彈是遊戲裡面最好的核彈，不僅儘快發射出去以後還能控制。瓦爾基里太空站的擁有人Alice要求主角用這些Liberator核彈去炸貨船，而這時主角突然發現Alice同志有不可告人的目的。緊接著Alice攻擊了主角再一次遇到女科學家的地方，最後的結局是主角幹掉的瓦爾基里太空站（這是個移動要塞）上面所有的武器，而瓦爾基里太空站的傳送裝置出了問題，結果飛到了Void的母星去。。
