生物信息軟體分析表明，其中全長cDNA為713bp，5′非編碼區(UTR)246bp，3′UTR29bp，開放閱讀框438bp，編碼145個胺基酸，包括溶菌酶成熟肽124個胺基酸和信號肽21個胺基酸。對海參溶菌酶與多種無脊椎動物的c、g和i型溶菌酶進行分析比較，發現它與i型溶菌酶有較高的同源性，並具有i型溶菌酶高度保守的2個活性位點，即Glu34和Ser50.活性位點附近具有i型溶菌酶的一段特有的胺基酸保守序列MDVGSLSCG(P/Y)(Y/F)QIK，所以推斷克隆的海參溶菌酶為i型。通過搜尋蛋白保守結構域資料庫，發現海參溶菌酶與醫用水蛭失穩酶相似性最高，並且這2個酶的三級結構模型也極其相似.因此推測，海參i型溶菌酶具有雙功能特性，既能作用於細菌細胞壁的糖苷鍵使細胞裂解，又具有失穩酶的一些生化功能，能夠水解纖維蛋白。
