在18世紀,植物病害的傳染性以及植物病害的微生物病原性已漸為人們覺察。19世紀初,真菌學在植物形態學和植物分類學的基礎上逐漸發展,真菌病原本質首先得到研究和認識。1775年,M·蒂利特證明了腥黑穗病是傳染的。1807年,B·普雷沃證明了這個病是由孢子傳染的。在1847~1865年間,L·E·蒂拉納研究了麥角病菌、黑粉病菌和鏽病菌的形態和生活史。在1853~1866年間,德巴里(Heinrich Anton de Bary)在進一步對黑粉菌、鏽菌以及馬鈴薯疫病菌的研究中,闡明了病原菌對植物的致病和發病過程,並證明真菌發育過程中的多形態性以及鏽菌的轉株寄生現象。他對一些重要作物的真菌病害和病原菌的多方面研究,奠定了植物病理學的基礎。J·屈恩於1858年寫的《作物病害原因和防治》一書,總結了這一時期對植物病害發生和對病原菌的認識,提出了環境因素與植物病害發生的關係和病害的防治方法,標誌著植物病理學的誕生。葡萄霜霉病
1888年,米亞爾代(Pierre Marie Alexis Millardet),創製了波爾多液,成功地防治了葡萄霜霉病,開創了植物病害的化學防治。1866年,M·C·沃羅寧觀察到植物根瘤中的細菌,這是首次在植物體內發現細菌。1879年,T·J·伯里爾發現梨火疫病是細菌寄生所致。1899年,E·F·史密斯對細菌性植物病害進行了系統研究,發展了植物病理學的細菌性病害領域。1879年,邁爾發現菸草花葉病並注意了這個病的傳染性。Д·И·伊萬諾夫斯基研究了這一病害,於1892年證明病原是存在病葉汁液里的微粒體,能透過細菌濾器,與細菌不同。1898年,M·W·拜耶林克稱這類病原為病毒,以與細菌相區別,從而開創了植物病理學的病毒病原新領域。在19世紀末期,植物病理學者用選種雜交方法選出了抗鏽病的蘆筍新品種,1902年,W·A·奧頓選出了抗枯萎病的棉花品種,從而發展了植物病理學的免疫性機制的研究和抗病育種的防病途徑。葡萄霜霉病病原