核苷酸序列

核苷酸序列,就是指DNA或RNA中鹼基的排列順序。這意味著DNA中A,T,G,C的排列循序,或者mRNA中A,U,G,C的排列循序,也包括rRNA,tRNA中鹼基的排列順序。

基本介紹

  • 中文名:核苷酸序列
  • 概念:DNA或RNA中鹼基的排列順序
  • 方法:A,T,G,C的排列循序
  • 特點:“柵欄效應”
由A、T、C、G四種字元組成的核苷酸序列本質上是生物分子的一種符號表示。在計算生物學中,常採用離散傅立葉變換進行頻譜分析。
根據核苷酸序列頻率分布的特點和離散傅立葉變換所固有的“柵欄效應”,提出採用調頻Z變換的分析方法,定義了相應的表達式,同時構造了短時調頻Z變換用於識別基因區域中的外顯子部分和內含子部分。與已有的基因區域識別算法相比,該方法不需要依賴於訓練樣本序列。測試結果表明了該方法的有效性。

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