李霞(同濟大學教授)

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李霞,女,教授,博士,博士生導師,黑龍江特聘教授,哈爾濱醫科大學生物信息學系主任,同濟大學兼職教授/博士導師,哈爾濱工業大學計算機科學與技術專業博士畢業。

基本介紹

  • 中文名:李霞
  • 國籍:中華人民共和國
  • 職業:教師、博士生導師
  • 畢業院校:哈爾濱工業大學
  • 性別:女
人物經歷,研究方向,主要貢獻,

人物經歷

1993年 任副教授;
1997年破格晉升為教授;
1999年12月到2000年12月受美國UNC與CWRU複雜疾病基因定位奠基人Robert Elston博士邀請,作為訪問教授赴美從事複雜疾病基因定位連鎖作圖和基因表達譜疾病基因發現等研究工作。

研究方向

複雜重大疾病的分子分型與基因定位、計算系統生物學、生物信息融合分析技術、生物動力學、高通量藥物有效成分篩選與藥物靶發現技術、基因與蛋白質功能研究的生物晶片信息學技術等。

主要貢獻

李霞教授多年來一直從事生物信息學、數學與計算機及醫學套用等方面的教學和科研工作,在複雜疾病基因識別、生物晶片信息學分析及基因與蛋白質功能預測等研究領域取得了重要的成果。先後承擔課題26項,其中,連年獲等國家自然科學基金6項(主持3項,參加(第二)1項,指導2項),國家863高科技計畫項目3項(主持1項,副組長1項,參加1項),獲省部級獎5項,廳局級獎8項,在國內外重要學術刊物和學術會議上發表學術論文100餘篇(SCI 38篇、EI 4篇),累計影響因子77.234,主編著作等7部。近年來,致力於功能基因的識別方法的研究,科學研究論文發表在國外著名生命科學雜誌《 Nucleic Acids Research》 (SCI IF:7.26)、《BIoinformatics》(SCI IF: 6.02)、《BMC Bioinformatics》(SCI IF:5.42)等,論文 “Gene mining: a novel and powerful ensemble decision approach to hunting for disease genes using microarray expression profiling”受到了Nobel獎得主,<>資深編輯Rich Roberts博士的好評,並迅速成為英國牛津出版集團旗艦科學雜誌<< Nucleic Acids Research>>的熱點文章(Hot Papers)。
李霞教授領導的哈爾濱醫科大學生物信息系在國內率先從事了生物信息學本科生、碩士研究生、博士研究生教育,初步形成了具有良好知識結構生物信息學梯隊,為建成國內一流生物信息學學科具有雄厚的後備力量。從2001年開始,已經連續招收了7屆生物信息學方向的碩士、博士研究生,生物信息學專業研究生以高質量的培養達到較高水平的畢業標準(撰寫出SCI影響因子2.0以上科研論文),目前,培養的碩士研究生髮表的科研論文SCI影響因子達到5.48,在研究生培養上取得了國內一流成績。同時,為上海聯合基因公司、天津大學、蘇州大學等單位的博士、博士後人員的開展了生物信息學進修培訓工作,同哈爾濱工業大學、同濟大學等國內一流大學聯合培養了多名碩士研究生和博士研究生。為新興的生物信息學領域的深入研究和人才培養做出了不凡的貢獻。
近幾年來, 李霞教授在複雜疾病基因挖掘方面取得了系列研究成果,複雜疾病一般由遺傳基因與環境因素共同作用而發生,並且往往有多基互作、遺傳異質性等特徵,其發病並不能通過一個基因的突變,單一的基因產物或通路的行為來解釋。傳統的單一基因定位克隆和候選基因關聯分析策略已不能全面地闡明人類疾病潛在的遺傳複雜性。為此,從SNP標記數據和基因表達譜數據的分析著手,以挖掘複雜疾病基因和研究基因功能為主要目標,對複雜疾病相關基因模式識別方法進行了系統研究,融合模式識別方法、數據挖掘技術和生物信息學領域知識匹配技術,提出創新的基於單核酸(SNP)標記數據和基因表達譜數據分析的系列方法,主要研究內容包括:(1)複雜疾病模式識別理論方法的建立(2)基於單核酸(SNP)標記的同胞對基因連鎖分析的模式識別方法研究(3)同胞對方差連鎖分析法定位離散型人類複雜疾病基因方法研究(4)集成特徵基因挖掘的集成決策方法EFST和EFST的推廣方法-基於決策森林特徵基因挖掘方法(5)GA和SVM耦合的特徵基因挖掘方法GA-SVM研究(6)複雜疾病相關網路的反向構建方法研究,開發有關的生物信息學資料庫和分析軟體,並套用於信息資源豐富的結腸癌、白血病等疾病的特徵基因發現、疾病識別的深度信息挖掘。系列研究成果發表在具有很高影響力和聲譽的雜誌上(Nucleic Acids Research, 雜誌影響因子:7.26);《BIoinformatics》(SCI IF:6.02),《BMC Bioinformatics》(SCI IF:5.42)、American Journal of Human Genetics 雜誌影響因子11; Arthritis and Rheumatism,雜誌影響因子7.4; Journal of Medical Genetics,雜誌影響因子7.7;中國科學;和 Progress in Natural Science等),並獲得省政府自然科學2等獎,中華醫學獎三等獎等殊榮,在複雜疾病基因作圖的模式識別方法研究領域做出重要貢獻。
李霞教授帶頭主持研製的遺傳學群體與家系資料分析系統(PPAP)與遺傳優生計算機診斷系統(IDDC)已推廣到中國科學院、中國醫學科學院/協和醫科大學等60多個單位,產生了很好的學術影響,並已成功地套用於10多項國家自然科學基金課題與博士論文的數據信息分析工作(如上海第二醫科大學 林海龍博士首次套用PPAP中的受累同胞對方法發現原發性高血壓與血管緊張素原基因位點連鎖,在該基因區域附近存在高血壓易感基因)。PPAP還被成功地套用於北京大學第一醫院 呂建軍博士小兒失神的基因連鎖分析、北京大學 戚豫博士的國家自然科學基金課題家族性熱性驚厥的染色單體型相對風險和傳遞不平衡分析等等.

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