擬南芥基因組序列於2000年由國際擬南芥基因組合作聯盟聯合完成，研究結果“Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana”發表在國際期刊《Nature》上，是第一種完成全基因組測序和分析的植物。2017年，擬南芥基因組注釋得到了更新，研究結果“Araport11: a complete reannotation of the Arabidopsis thaliana reference genome”發表在國際期刊《 The Plant Journal》上。
基本介紹
- 中文名：擬南芥
- 外文名：Arabidopsis thaliana
- 基因組：125 Mb
- 染色體：5條
- 基因：25498
- 科：十字花科Brassicaceae
- 屬：鼠耳芥屬 Arabidopsis
背景,特點,基因組信息,哥倫比亞生態型 Columbia,塔勒水芹生態型 thale cress,意義,
背景
擬南芥 （Arabidopsis thaliana）又名鼠耳芥，阿拉伯芥，阿拉伯草。屬被子植物門，雙子葉植物綱，十字花科植物。其在植物學中所扮演的角色正仿佛小白鼠在醫學和果蠅在遺傳學中的一樣。是在植物科學，包括遺傳學和植物發育研究中的模式生物之一。
擬南芥的五條染色體 (2000) Nature 408:796–815特點
- 植株較小（一個8cm見方的培養缽可種植4-10株）；
- 生長周期短（從發芽到開花約4-6周）；
- 結實多（每株植物可產生數千粒種子）；
- 擬南芥的形態特徵分明；
- 易於轉化。經過不斷的實踐，浸花法（floral tip）已成為擬南芥轉化最常用的方法。具體為：生長5-6周已抽苔的擬南芥打頂來促進側枝生長，待花序大量產生時將其在含有轉化輔助劑silwet和蔗糖的農桿菌溶液中浸泡幾分鐘，3-4周后對轉化植株收種子。在含有合適抗生素的平板上對種子進行篩選，能夠健康生長的幼苗為轉基因植株。這種轉化方法不需要組織培養和再生植株的過程，操作簡便、轉化效率較高，為研究人員建立突變體庫、改變目的基因的表達特徵以及開展互補驗證等實驗提供了便利；
- 可以方便獲得大量發生在不同基因位點的突變體。
基因組信息
哥倫比亞生態型 Columbia
數據下載（包括CDS序列、編碼蛋白序列、mRNA序列、基因組序列和GFF注釋信息）
地址a（擬南芥官網，Tair）：https://www.arabidopsis.org/
地址b（NCBI）：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=Arabidopsis+thaliana
塔勒水芹生態型 thale cress
數據下載（包括CDS序列、編碼蛋白序列、mRNA序列、基因組序列和GFF注釋信息）
地址a（Aroport11官網，Araport）：https://www.araport.org/
地址b（NCBI）：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=Arabidopsis+thaliana
意義
模式植物的選擇和利用對於開展遺傳分析、基因克隆和功能研究意義重大，擬南芥由於其植株小、結實多、生命周期短、基因組簡單、遺傳操作簡便，近四十年來由田野里不起眼的小草成為植物研究領域最耀眼的明星。全世界有超過六千家實驗室正在對擬南芥的生長發育及其對環境應答的過程開展深入研究。它在糧食增產、農作物耐逆、環境保護等領域做出了重要貢獻，讓我們記住這棵小草，記住神奇的模式植物——擬南芥。
