徐錦(中山大學生命科學學院教授、博士生導師)

徐錦(中山大學生命科學學院教授、博士生導師)

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徐錦,女,博士,中山大學生命科學學院教授、博士生導師

基本介紹

  • 中文名:徐錦
  • 畢業院校:中科院北京基因組研究
  • 學位/學歷:博士
  • 專業方向:生物信息學
  • 任職院校:中山大學
研究方向,個人經歷,學術成就,承擔課題,論文專著,

研究方向

大腦作為複雜的多細胞系統,包含大量不同種類和功能的神經元細胞,這些神經元細胞是大腦功能的基本單元。由同一基因編碼的神經元細胞的多樣化和個體化的精確調控過程,是表觀遺傳研究的熱點問題。同時,人類的大腦相對於其他物種而言,是各種器官中表型差異最大的器官,也是人類有別於其他生物的獨特屬性之一。人類智慧型的演化過程一直以來都是進化生物學中極具吸引力的方向。作為大腦的基本功能單位,神經元細胞的多樣化和個體化保證了神經細胞間的正確連線和迴路的形成,是大腦複雜功能和高級認知的物質基礎。因此探索和解析神經細胞群體間的多樣化和個體化的調控機制,以及神經細胞群體多樣化在物種間的保守和特異性程度及其在人腦適應性進化過程中的作用等問題,將為理解大腦功能和認識提供細胞和分子基礎,為神經系統疾病的預防和治療提供理論依據。

個人經歷

2019-至今 中山大學生命科學學院,教授
2014-2019 史丹福大學醫學院,博士後(導師: Howard Y. Chang)
2008-2014中科院北京基因組研究,生物信息學,博士(導師:吳仲義)
2003-2007東北師範大學, 軟體工程,學士

學術成就

徐錦,中山大學2019“百人計畫”引進人才,生命科學學院教授。主要研究方向為基因表達在演化、發育和疾病中的調控機制。以計算生物學和基因組學為手段,研究和探索了包含表觀遺傳學修飾、轉錄調控和轉錄後調控等多個層次的調控機制。目前已在Cell, Nature Genetics, Neuron, eLife 等國際專業學術期刊發表多篇論文。

承擔課題

中山大學“百人計畫”啟動項目(2019-2020)
國家級人才計畫(2019-2021)

論文專著

主要工作:
  • Xu, Jin;Nuno, Kevin; Litzenburger, Ulrike M; Qi, Yanyan; Corces, M Ryan; Majeti, Ravindra; Chang, Howard Y. Single-cell lineage tracing by endogenous mutations enriched in transposase accessible mitochondrial DNA. eLife, 2019
  • Cho, Seung Woo*;Xu, Jin*; Sun, Ruping; Mumbach, Maxwell R; Carter, Ava C; Chen, Y Grace; Yost, Kathryn E; Kim, Jeewon; He, Jing; Nevins, Stephanie A; et.al Promoter of lncRNA Gene PVT1 Is a Tumor-Suppressor DNA Boundary Element. Cell,2018
  • Xu, Jin*; Peng, Xinxin*; Chen, Yuxin; Zhang*, Yuezheng; Ma, Qin; Liang, Liang; Carter, Ava C; Lu, Xuemei; Wu, Chung-I. Free-living human cells reconfigure their chromosomes in the evolution back to uni-cellularity. eLife,2017
  • Xu, Jin*; Carter, Ava C*; Gendrel, Anne-Valerie; Attia, Mikael; Loftus, Joshua; Greenleaf, William J; Tibshirani, Robert; Heard, Edith; Chang, Howard Y. Landscape of monoallelic DNA accessibility in mouse embryonic stem cells and neural progenitor cells . Nature Genetics,2017
  • Huang, Wei-Hsiang*; Guenthner, Casey J*;Xu, Jin*; Nguyen, Tiffany; Schwarz, Lindsay A; Wilkinson, Alex W; Gozani, Or; Chang, Howard Y; Shamloo, Mehrdad; Luo, Liqun. Molecular and Neural Functions of Rai1, the Causal Gene for Smith-Magenis Syndrome. Neuron, 2016
  • Giorgetti, Luca; Lajoie, Bryan R; Carter, Ava C; Attia, Mikael; Zhan, Ye;Xu, Jin; Chen, Chong Jian; Kaplan, Noam; Chang, Howard Y; Heard, Edith. Structural organization of the inactive X chromosome in the mouse. Nature2016
  • Xu, Jin*; Zhang, Rui*; Shen, Yang; Liu, Guojing; Lu, Xuemei; Wu, Chung-I. The evolution of evolvability in microRNA target sites in vertebrates. Genome Research, 2013

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