崔玉軍，男，漢族，中共黨員，山東利津人，研究員。碩士研究生導師。現任軍事醫學研究院微生物流行病研究所未知病原分析室副主任。
基本介紹
個人簡歷,學習工作經歷,研究方向,科研課題,發表文章,獲獎情況,編寫教材（著作）,
個人簡歷
崔玉軍，男，漢族，中共黨員，山東利津人，研究員。碩士研究生導師。現任軍事醫學研究院微生物流行病研究所未知病原分析室副主任。2008年畢業於原軍事醫學科學院，取得博士學位。近五年來，承擔國家自然科學基金2項、北京市科技計畫1項、國家重點實驗室重點項目1項等。近五年發表學術論文50餘篇，其中第一及通訊（含共同）SCI收錄17篇，中文核心期刊7篇。代表性論文發表於The New England Journal of Medicine、PNAS（2013,2015）、Nature Communications (2015,2020)、ISME Journal、eLife等雜誌。
學習工作經歷
1995.09–1999.07 青島大學套用化學專業讀本科；
1999.07–2002.08 解放軍某部工作；
2002.09–2008.06 原軍事醫學科學院軍事預防醫學專業讀碩士及博士研究生；
2008.06–2017.12 原軍事醫學科學院工作；
2017.12–至今 軍事科學院軍事醫學研究院工作。
研究方向
微生物進化與基因組流行病學
科研課題
1. 北京市科學技術委員會，新冠應急項目，Z201100001020004，2019 新型冠狀病毒傳播變異監測與進化動力學研究，2020-03至2022-04，240萬元，在研，主持。
2. 國家自然科學基金委員會，面上項目，31970002，鼠疫耶爾森菌結構變異的進化動力學研究 ，2020-01至2023-12，60萬元，在研，主持。
3. 國家自然科學基金委員會，面上項目，31770001，高頻重組細菌代表性物種——副溶血弧菌的種群結構與進化動力學研究，2018-01至2021-12，55萬元，在研，主持。
4. 病原微生物生物安全國家重點實驗室，重點項目，SKLPBS1405，鼠疫耶爾森 氏菌種群進化與生態變遷的關聯研究，2014-12至2016-12，80萬元，已結題，主持。
發表文章
1. Mao Y, Yang X, Liu Y, Yan Y, Du Z, Han Y, Song Y, Zhou L, Cui Y, Yang R. Reannotation of Yersinia pestis Strain 91001 Based on Omics Data[J]. Am J Trop Med Hyg,2016,95(3):562-570.
2. Cui Y, Song Y. Genome and Evolution of Yersinia pestis[J]. Adv Exp Med Biol, 2016,918:171-192.
3.Qi Z, Cui Y, Zhang Q, Yang R. Taxonomy of Yersinia pestis[J]. Adv Exp Med Biol, 2016,918:35-78.
4. Zhang Y, Luo T, Yang C, Yue X, Guo R, Wang X, Buren M, Song Y, Yang R, Cao H, Cui Y, Dai X. Phenotypic and Molecular Genetic Characteristics of Yersinia pestis at an Emerging Natural Plague Focus, Junggar Basin, China[J]. Am J Trop Med Hyg,2018,98(1):231-237.
5. Song Y, He Q, Zhang J, Qiao J, Xu H, Zhong Z, Zhang W, Sun Z, Yang R, Cui Y, Zhang H. Genomic Variations in Probiotic Lactobacillus plantarum P-8 in the Human and Rat Gut[J]. Front Microbiol,2018,9:893.
6. Xu X, Cui Y, Xin Y, Yang X, Zhang Q, Jin Y, Zhao H, He J, Jin X, Li C, Jin J, Li X, Wu H, Qi Z. Genetic Diversity and Spatial-temporal Distribution of Yersinia pestis in Qinghai Plateau, China[J]. PLoS Negl Trop Dis,2018,12(6):e0006579.
7. Huang W, Wang M, Hao H, Yang R, Xie J, Su J, Lin M, Cui Y, Jiang Y. Genomic Epidemiological Investigation of a Streptococcus suis Outbreak in Guangxi, China, 2016[J]. Infect Genet Evol, 2019,68:249-252.
8. Yang C, Pei X, Wu Y, Yan L, Yan Y, Song Y, Coyle NM, Martinez-Urtaza J, Quince C, Hu Q, Jiang M, Feil E, Yang D, Song Y, Zhou D, Yang R, Falush D, Cui Y. Recent Mixing of Vibrio parahaemolyticus Populations[J]. ISME J,2019,13(10):2578-2588.
9. Yang C, Zhang X, Fan H, Li Y, Hu Q, Yang R, Cui Y. Genetic Diversity, Virulence Factors and Farm-to-table Spread Pattern of Vibrio parahaemolyticus Food-associated Isolates[J]. Food Microbiol,2019,84:103270.
10. Cui Y, Schmid BV, Cao H, Dai X, Du Z, Ryan Easterday W, Fang H, Guo C, Huang S, Liu W, Qi Z, Song Y, Tian H, Wang M, Wu Y, Xu B, Yang C, Yang J, Yang X, Zhang Q, Jakobsen KS, Zhang Y, Stenseth NC, Yang R. Evolutionary Selection of Biofilm-mediated Extended Phenotypes in Yersinia pestis in Response to a Fluctuating Environment[J]. Nat Commun,2020,11(1):281.
11. Wang H, Yang C, Sun Z, Zheng W, Zhang W, Yu H, Wu Y, Didelot X, Yang R, Pan J, Cui Y. Genomic Epidemiology of Vibrio cholerae Reveals the Regional and Global Spread of Two Epidemic Non-toxigenic Lineages[J]. PLoS Negl Trop Dis,2020,14(2):e0008046.
12. Wang D, Wang B, Zhu L, Wu S, Lyu Y, Feng E, Pan C, Jiao L, Cui Y, Liu X, Wang H. Genotyping and Population Diversity of Bacillus anthracis in China Based on MLVA and CanSNP Analysis[J]. Microbiol Res,2020,233:126414.
13. Jiang M, Zhu F, Yang C, Deng Y, Kwan PSL, Li Y, Lin Y, Qiu Y, Shi X, Chen H, Cui Y, Hu Q. Whole-Genome Analysis of Salmonella Enterica Serovar Enteritidis Isolates in Outbreak Linked to Online Food Delivery, Shenzhen, China, 2018[J]. Emerg Infect Dis,2020 ,26(4):789-792.
14. Cui Y, Yang C, Qiu H, Wang H, Yang R, Falush D. The Landscape of Coadaptation in Vibrio parahaemolyticus[J]. Elife,2020,9:e54136.
15. Fan H, Zhang XL, Zhang YW, Huang Y, Teng Y, Guo Y, Mi ZQ, Yang RF, Song YJ, Cui YJ. In silico Assessment of the impact of 2019 Novel Coronavirus Genomic Variation on the Efficiency of Published Real-time Quantitative Polymerase Chain Reaction Detection Assays[J]. Chin Med J (Engl),2020,133(13):1612-1613.
16. Shi L, Qin J, Zheng H, Guo Y, Zhang H, Zhong Y, Yang C, Dong S, Yang F, Wu Y, Zhao G, Song Y, Yang R, Wang P, Cui Y. New Genotype of Yersinia pestis Found in Live Rodents in Yunnan Province, China[J]. Front Microbiol,2021,12:628335.
17. Chen G, Lyu Y, Wang D, Zhu L, Cao S, Pan C, Feng E, Zhang W, Liu X, Cui Y, Wang H. Obtaining Specific Sequence Tags for Yersinia pestis and Visually Detecting Them Using the CRISPR-Cas12a System[J]. Pathogens,2021 ,10(5):562.
獲獎情況
“準噶爾盆地大沙鼠鼠疫自然疫源地發現與研究”獲得2017年度新疆維吾爾自治區科學技術進步一等獎（證書號：G20170197，排名第4，2017年）
編寫教材（著作）
1. 獅子山伊波拉疫情防控應急反應組織管理(第四章病例管理組；第九章後勤組)(參編), 軍事醫學科學出版社 , 2016.
2. Yersinia Pestis: Retrospective and Perspective: chapter 3 Taxonomy of Yersinia pestis and 6-Genome and Evolution of Yersinia pestis ( coeditor), Springer Nature,2016.
3. Yersinia Pestis Protocols: chapter 5 genotyping of YP and 6 WGS analysis of YP ( coeditor), Springer Nature Singapore Pte Ltd, 2018.
