流行病學,基因定序,
流行病學
大部分腸出血性腸炎是由O157:H7型的大腸桿菌引起的,但也有少部分是由其他血清型的大腸桿菌引起。如1994年發生於美國蒙大拿州的出血性結腸炎,即是由O104:H21型的大腸桿菌引起。造成本次疫情的O104:H4型之前也曾造成零星個案,如2004年一位並發溶血性尿毒綜合症的韓國婦女,其糞便中分離出O104:H4大腸桿菌。
基因定序
在2011年O104:H4型大腸桿菌疫情爆發後,位於中國深圳的華大基因研究院(BGI)首先於6月2日定序出造成疫情的大腸桿菌O104:H4型的基因,半天后德國明斯特大學醫院衛生研究所也完成了基因定序,結果顯示這種品系的大腸桿菌與2001年德國從腹瀉病人體內分離出的菌株01-09591,及2002年從中非長期腹瀉愛滋病患者糞便中分離的菌株55989具有高度相似性,與中非菌株相比多了志賀樣毒素(Shiga-like toxin)基因,與2001年德國的分離株相比則毒性基因大致吻合,但多了許多抗藥性的基因,因此對氨基糖甙、大環內酯、磺胺、頭孢菌素、單醯胺菌素、青黴素和鏈黴素等多種抗生素有抗藥性。研究人員據此推測2001年的分離株可能是這次疫情菌株的直接祖先。
德國明斯特大學衛生研究所所長黑爾格·卡希於6月10日表示,此型大腸桿菌的原始宿主很有可能就是人類,因為儘管有幾種O104型的大腸桿菌以其他動物為宿主,但沒有證據證明O104:H4型的大腸桿菌能在其他動物的體內生存。