啟動子分析(promoter analysis)是2018年公布的計算機科學技術名詞。
基本介紹
- 中文名:啟動子分析
- 外文名:promoter analysis
- 所屬學科:計算機科學技術
- 公布時間:2018年

啟動子分析(promoter analysis)是2018年公布的計算機科學技術名詞。
啟動子分析(promoter analysis)是2018年公布的計算機科學技術名詞。定義分析與確定DNA序列中位於基因上游的調控區域,即啟動子。它是一個用於調控基因轉錄的控制位點。出處《計算機科學技術名詞 》第三版。1...
啟動子是RNA 聚合酶識別、結合和開始轉錄的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特異性結合和轉錄起始所需的保守序列,多數位於結構基因轉錄起始點的上游,啟動子本身不被轉錄。但有一些啟動子(如tRNA啟動子)位於轉錄起始點的下游,這些DNA序列...
①組成型啟動子(constitutive promoter)是指在該類啟動子控制下,結構基因的表達大體恆定在一定水平上,在不同組織、部位表達水平沒有明顯差異。使用最廣泛的組成型啟動子是花椰菜花葉病毒(CaMV)35S 啟動子、來自根癌農桿菌Ti 質粒T-DNA...
初步的分析表明,其中一個啟動子具有理想的化學誘導型啟動子的基本特徵,有可能開發出有套用價值的誘導型植物基因啟動子。本項目在全面考察該啟動子的誘導表達特性的基礎上,將啟動子與報告基因GFP連線轉化到水稻和擬南芥,以噻菌靈誘導並...
經測序和序列比對分析,獲得了1個與MYBCORE元件相互作用的轉錄因子,將該轉錄因子命名為PeMYB1。螢光定量PCR檢測結果顯示PeMYB1基因受鹽脅迫誘導表達上調,後續我們將進一步通過螢光素酶活性分析實驗在體內驗證該轉錄因子與PeXTH啟動子結合的...
啟動子是基因表達調控的必要元件。植物啟動子在全基因組水平的鑑定及其結構與功能分析,不僅對闡述與基因表達調控相關的基本理論問題具有重要的參考價值,而且為植物基因工程中啟動子的選擇與人工改造提供理論依據。本項目首先運用DNase-seq同時...
《環境脅迫應答基因ATMPK3的啟動子分析及轉錄因子克隆》是依託清華大學,由劉強擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 克隆了乾旱、高鹽、低溫及愈傷脅迫應答的ATMPK3啟動子並確定了其序列。利用轉基因菸草植株進行分析,已確定與乾旱、高鹽...
CaMV35S啟動子作為一種組成型啟動子在所有組織中都能啟動基因的表達,具有持續性,不表現時空特異性;RNA和蛋白質表達量也相對恆定。病毒形態 CaMV, 1937年由Tomkin首次發現,也是第一個發現植物DNA病毒, 其侵染的宿主範圍狹窄, 主要限...
結果表明其中位於3’端1.8kb區域啟動子最高,推測該區域對調控HaSCP-2基因表達非常重要;(3)通過5’-RACE分析,發現棉鈴蟲SCP-2基因啟動子區存在多個轉錄起始位點,轉錄調控較為複雜;(4)對HaSCP-2啟動子的生物信息學分析發現,...
CMV DNA只有一個單向性的IE啟動子複合體,可指導多個基因的表達。在IE94基因上游存在一個強啟動子,IE94的上游區比SV40病毒72bp重複序列具有更高的增強子功能IE94基因啟動子區序列分析證明這一區段內有多個迴文結構,並相間著保守的...
組織特異型啟動子能驅動外源基因在特定組織器官中高效表達,對作物品質改良,提高抗性和產量等方面具有重要作用。項目前期分析了甘藍型油菜和擬南芥基因表達譜,篩選了油菜根、莖稈、葉片和角果皮特異表達基因各1個,獲得了基因的啟動子序列。
《番茄miR167多基因座的表達特徵及其啟動子調控分析》是依託重慶大學,由李正國擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 番茄miR167對植物的生長素信號轉導具有重要調節作用。我們研究發現miR167在基因組中存在3個基因座,受控於不同的啟動子,...
本項目在已克隆得到飛蝗LmCHS1和LmCHS2基因cDNA序列的基礎上,進一步深入探討LmCHSs啟動子的結構、功能及轉錄調控機制。主要內容包括:1)運用染色體步移法克隆LmCHSs基因啟動子區,並用相關軟體分析其特徵;2)構建一系列CHSs基因啟動子5...
因此推測可能是CD34+細胞hCLP46啟動子區CpG island異常低甲基化,使得hCLP46異常表達,進而導致CD34+細胞失去正常分化功能。我們擬定首先對MDS、AML和正常人骨髓CD34+細胞hCLP46啟動子CpG island的甲基化譜式進行分析;針對該CpG island設計...
本項目選取了存在於啟動子區域、miRNA靶基因結合區域以及磷酸化位點區域的幾個代表性遺傳位點,探討了這些SNP 與表型關聯的功能機制。通過eQTL分析、meta分析以及螢光素酶差異表達分析,發現OPG基因啟動子區域的rs2073617能調控OPG基因的表達...
本研究基於既往的臨床病理資料庫和組織晶片庫基礎上,通過DNA測序,篩選出3個Sp1啟動子區突變位點(C-684T, T-617G和T-637C),分析表明它們在胃癌中的發生率分別為3.96 %、1.98%以及5.94%。分別構建含有上述3個位點突變啟動子的...
本項申請研究目標為闡明 PTPN22 基因啟動子區域單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism,SNP)和1型糖尿病相關性產生的潛在功能機制。經過項目的實施開展,對PTPN22啟動子區域內多態性和細胞核蛋白結合能力進行了分析,對啟動子所結合...
通過對HERV中啟動子和PolyA信號的建模、預測和分析,以期為揭示HERV在癌症發生髮展中的作用機理研究提供理論支持。結題摘要 人內源性逆轉錄病毒(Human Endogenous Retrovirus,HERV)是幾百萬年前逆轉錄病毒整合到人類基因組中經過長期遺傳...
1.1 植物啟動子研究進展 1.2 楊樹TIR-NBS類抗病相關基因及其啟動子研究概況 1.3 立題依據與技術路線 2 毛白楊PtDrl02基因的表達特性及其啟動子區的克隆與分析 2.1 材料與方法 2.2 結果與分析 2.3 討論 3 毛白楊PtDr102...
《源於嗜鹽古菌特殊啟動子基因功能的熱化學研究》是依託武漢大學,由劉義擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 將微生物遺傳學與現代微量熱技術相結合,根據實驗研究中發現的新現象,進一步通過體內外遺傳操作和微量量熱分析,從結構和功能...
對龍膽BCH和ZEP基因啟動子的分離與功能分析的研究結果,將為闡明這兩個基因表達調控機制提供基礎資料和依據,並將有助於闡明這兩個基因的表達與有色體發育之間的關係。在實踐上,獲得的龍膽BCH基因可期望套用於主要農作物和胡蘿蔔以及番茄...
本項目首先在中國和韓國兩個國家的胃癌佇列中均驗證了初期的發現,證實CDH1基因啟動子區-73SNP是胃癌的獨立預後因素,-73CC基因型患者預後較好。並進一步在胃癌組織中分析發現,-73CC基因型組織中CDH1表達水平較高,而-73AA基因型組織中...
antigen,PCNA)是一種在DNA複製、DNA修復、細胞周期調控等機制中發揮重要功能的核蛋白,我們對人增殖細胞核抗原(human proliferating cell nuclear antigen,hPCNA)基因—538~+60區域啟動子的調控做了比較全面的分析,著重研究了5′啟動子中...
雜合啟動子是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。定義 由兩種或兩種以上不同啟動子元件融合構成的一個新的啟動子。如tac啟動子就是將色氨酸啟動子Ptrp-35區域與突變的乳糖啟動子PlacUV5的-10區域融合構成的雜合啟動子,兼具Ptac強...
本項目擬進一步篩查並確認正常人群中PP2A三聚體亞基基因5'-側翼區的多態性及其單體型;利用鼻咽永生化和腫瘤細胞株,通過細胞外EMSA、細胞內報告基因檢測和體內ChIP分析,獲得NF-kB調控不同啟動子多態性PP2A亞基基因轉錄的直接證據;構建細胞...
利用生物信息學軟體分析確定了UCA1啟動子和核心啟動子的位置,並且發現在UCA1核心啟動子區中存在多個轉錄因子結合位點,其中包括轉錄因子Ets-2和C/EBPα。本項目在前期研究基礎上,深入研究了UCA1上游轉錄調控的具體分子機制及其對膀胱癌...
《DUSP22啟動子甲基化與結直腸癌的關係研究》是依託浙江大學,由張丹丹擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 DNA甲基化在結直腸癌的轉移中起了重要作用。但目前缺乏臨床樣本和細胞系相結合的系統研究。本課題組前期利用全基因組甲基...
利用CAT表達載體,通過系列缺失和動物細胞轉染實驗,在人的雌性激素合成酶基因組DNA的2.4kb片段的3’端發現了一個啟動子的功能區。通過序列分析,在具有啟動子功能的序列中發現兩處存在類TATA盒,這一結果同亞克隆DNA的轉染實驗結果相...
在較高等的真核生物中,有一類特殊的調控序列(啟動子等)可以調控基因只能在一定的組織中才進行有效的表達。選用這樣的調控序列可以構建一系列組織特異性表達載體,為研究動植物發育和人類基因治療等提供了有效的手段。已構建的組織特異性...
