反基因密碼子

位於tRNA反密碼環中部、可與mRNA中的三聯體密碼子形成鹼基配對的三個相鄰鹼基。在蛋白質的合成中，起解讀密碼、將特異的胺基酸引入合成位點的作用。RNA鏈經過摺疊，看上去像三葉草的葉形，其一端是攜帶胺基酸的部位，另一端有3個鹼基。每個tRNA(transfer RNA)的這3個鹼基可以與mRNA上的密碼子互補配對，因而叫反基因密碼子。 tRNA分子二級結構的反密碼環中部的三個相鄰核苷酸組成反基因密碼子。

tRNA的胺基酸接受莖(即3'-端CCA-OH)，在aaRS的催化下，與經ATP活化的胺基酸通過酯鍵結合。攜帶同一個胺基酸的所有tRNA(也稱為同功tRNA)由相同的aaRS所催化，而每種酶通過若干特殊鹼基來識別同工的tRNA。已知aaRS與呈L型的tRNA的內側面廣泛結合。