首批有13個北京高校高精尖創新中心獲得認定，分別來自北京大學、清華大學、中國人民大學、北京航空航天大學、北京理工大學、北京工業大學、北京化工大學、中國農業大學、首都醫科大學、北京師範大學、首都師範大學、中央美術學院等高校。研究範圍涵蓋工程科學與新興技術、未來晶片技術、大數據科學與腦機智慧型、智慧型機器人與系統、軟物質科學與工程等領域。
在經費使用方面，北京市財政對高精尖中心按照項目建設周期給予支持，五年為一周期，每年給予每箇中心5000萬至1億元的經費投入。除了一般的專項經費支出範圍外，增加了列支人員聘任費和中心建設與運行管理費。經費額度原則上不低於70%要用於國際創新人才的聘用、國內創新人才資源的整合。其中，不低於50%的人員聘任費要用於國際人才的聘用，不低於20%的人員聘任費要用於京外人才的聘用。引進的國內外高端人才中，45歲以下青年科學家的比例原則上不低於50%。
截止2017年10月，北京市教育委員會共認定22個北京高等學校高精尖創新中心。
序號 | 依託高校 | 中心名稱 |
1 | 北京大學 | 工程科學與新興技術高精尖創新中心 |
2 | 中國人民大學 | 北京高校思想政治理論課高精尖創新中心 |
3 | 清華大學 | 未來晶片技術高精尖創新中心 |
4 | 清華大學 | 結構生物學高精尖創新中心 |
5 | 北京工業大學 | 北京未來網路科技高精尖創新中心 |
6 | 北京航空航天大學 | 大數據科學與腦機智慧型高精尖創新中心 |
7 | 北京理工大學 | 智慧型機器人與系統高精尖創新中心 |
8 | 北京化工大學 | 軟物質科學與工程高精尖創新中心 |
9 | 中國農業大學 | 食品營養與人類健康高精尖創新中心 |
10 | 首都醫科大學 | 人腦保護高精尖創新中心 |
11 | 北京師範大學 | 未來教育高精尖創新中心 |
12 | 首都師範大學 | 成像理論與技術高精尖創新中心 |
13 | 中央美術學院 | 視覺藝術高精尖創新中心 |
14 | 北京大學 | 未來基因診斷高精尖創新中心 |
15 | 北京航空航天大學 | 生物醫學工程高精尖創新中心 |
16 | 北京建築大學 | 未來城市設計高精尖創新中心 |
17 | 北京林業大學 | 林木分子設計育種高精尖創新中心 |
18 | 北京語言大學 | 語言資源高精尖創新中心 |
19 | 中國音樂學院 | 中國樂派高精尖創新中心 |
20 | 北京航空航天大學-首都醫科大學 | 大數據精準醫療高精尖創新中心 |
21 | 北京電影學院 | 未來影像高精尖創新中心 |
22 | 北京科技大學 | 北京材料基因工程高精尖創新中心 |
