兼併引物PCR

兼併引物PCR (degenerate primer PCR) 是指用設計引物的方法來擴增所有已知順序核苷酸序列的PCR 法。因為密碼子具有兼併性，為了擴增一些已知編碼順序的核酸序列，可通過設計兼併引物進行擴增。兼併引物是指代表編碼單個胺基酸所有不同鹼基可能性的不同序列的混合物。兼併度越低，產物特異性越強。

因此，在引物設計時,最選擇兼併性小的胺基酸，並避免引物3'端被兼併，因為3'端最後3個鹼基的退火足以在錯誤位點起始PCR;次黃嘌呤可以同所有的鹼基配對，降低引物的退火溫度。實驗證明，用脫氧肌苷引物進行PCR,可以代替編碼蛋白的多種兼併密碼子中的兼併鹼基。