MEGA 的全稱是Molecular Evolutionary Genetics Analysis 分子進化遺傳分析。MEGA is an integrated tool for automatic and manual sequence alignment, inferring phylogenetic trees, mining web-based databases, estimating rates of molecular evolution, and testing evolutionary hypotheses. MEGA 可用於序列比對、進化樹的推斷、估計分子進化速度、驗證進化假說等。MEGA 還可以通過網路（NCBI）進行序列的比對和數據的搜尋。是一款免費軟體。
最新版本：MEGA X
建議下載版本：MEGA 5.05 for Windows and Mac OS。
MEGA 5 has been tested on the following Microsoft Windows® operating systems:
Windows 95/98, NT, 2000, XP, Vista, version 7, Linux and Mac OS .
MEGA 5.05 可免費下載，只需輸入名字及有效信箱，下載連結會傳送至信箱，點擊可下載。
